白颈长尾雉保护遗传学研究

论文题目: 白颈长尾雉保护遗传学研究

论文类型: 博士论文

论文专业: 动物学

作者: 蒋萍萍

导师: 丁平

关键词: 白颈长尾雉,线粒体,调控区,遗传多样性,遗传结构,基因流,谱系,微卫星

文献来源: 浙江大学

发表年度: 2005

论文摘要: 白颈长尾雉是我国特有的国家一级重点保护动物,近年来因栖息地大面积的破坏及过量猎杀,种群数量逐渐下降。本文以线粒体DNA为分子标记,分析了野生和圈养白颈长尾雉的遗传学多样性水平和遗传结构状况,并通过微卫星文库筛选和构建,以期从核基因标记作进一步分析,为白颈长尾雉的保护与管理提供科学的依据。 1.线粒体调控区(D-loop)检测得出野生白颈长尾雉种群的遗传多样性参数为:单倍型多样性(Haplotype diversity,h)平均值为0.992,核苷多样性 (Nucleotide diversity, π)平均值为0.00616,核苷酸歧异度(Nucleotide pairwise divergence,%)平均值为0.0-1.5(%),总体遗传多样性较高。 2.线粒体调区(D-loop)对浙江,安徽,福建,湖南和贵州野生种群的遗传结构分析中得出:整体上白颈长尾雉的野生种群没有出现完全的遗传分化,但贵州种群的存在着较为明显的遗传差异,它与其它种群的基因流交流程度最低,正处于分化的过程中。因此在全国白颈长尾雉的自然保护网络体系建立中,可把贵州种群设为一保护管理单元(MU)来保护管理:同时因遗传结构是一历史积累过程,所以也应特别关注其它地区的自然保护区建设,以减缓或减小潜在的直接或间接的危胁。 3.宁波动物园白颈长尾雉的圈养种群,遗传多样性比野生种群低,主要原因是奠基者少,仅发现3个D-loop序列的单倍型(Ha,Hb,Hc),与原有3只雌性奠基者的数量相符。在没有遗传背景下人为的配对繁殖,以及谱系管理的匮乏使3 个D-loop序列单倍型在种群中分布及其不平衡。单倍型Hc仅存于2个雌性个体中,如果不加重视,这一基因型将会遗失。同时根据线粒体DNA母系遗传的特性, 通过3个D-loop序列单倍型在36个个体中的分布,揭示了圈养种群的母系谱系关系,拥有同一个单倍型的个体来源于同一个雌性奠基者。提出圈养种群为维持种群的遗传多样性,除了奠基者效应,遗传管理十分重要。 4.以白颈长尾雉DNA酶切片段为基因组,利用链霉抗生物素修饰的磁珠与生物素标记的探针的富集方法筛选了10个微卫星位点,但还需在一定数量的个体中

论文目录:

摘要

ABSTRACT

第一章引言

1．1 保护遗传学研究概况

1．1．1 保护遗传学的产生背景

1．1．2 保护遗传学的产生和发展

1．1．3 保护遗传学的概念、目的和研究内容

1．1．4 DNA分子标记(DNA markers)

1．2 白颈长尾雉现状与面临的问题

1．3 本研究的目的和意义

1．4 材料的来源、研究方法

第二章白颈长尾雉野生种群的线粒体DNA分析

2．1 引言

2．2 材料与方法

2．2．1．材料

2．2．2 方法

2．3 实验结果

2．3．1 D-loop序列

2．3．2 遗传多样性

2．3．3 遗传结构

2．4 分析与讨论

2．4．1 遗传多样性

2．4．2 遗传结构

第三章白颈长尾雉圈养种群的线粒体DNA分析

3．1 引言

3．2 材料与方法

3．2．1 材料

3．2．2 方法

3．3 实验结果

3．3．1 遗传多样性

3．3．2 母系谱系

3．4 分析与讨论

第四章白颈长尾雉微卫星文库构建

4．1 引言

4．2 材料

4．2．1 样品

4．2．2 试剂

4．2．3 主要仪器设备

4．3 微卫星片段筛选

4．3．1 DNA提取

4．3．2 准备限制性内切酶的接头

4．3．3 基因组DNA酶切与片段选择

4．3．4 选择性片段的连接

4．3．5 杂交及磁珠捕获重复片段

4．3．6 PCR检测并富集捕获的目的片段

4．3．7 PCR产物的纯化

4．3．8 连接

4．3．9 转化

4．3．10 筛选

4．3．11 鉴定

4．4 引物设计及检测

4．4．1 测序

4．4．2 引物设计与PCR检测

4．4．3 微卫星多态性检测

第五章总结与展望

参考文献

攻读博士学位期间发表、已投稿和计划撰写的论文

发布时间: 2005-10-10

参考文献

[1].白颈长尾雉空间生态学研究[D]. 郑家文.浙江大学2006

白颈长尾雉保护遗传学研究

猜你喜欢