论文摘要
目的:以华中平原携带汉坦病毒的大仓鼠为研究对象,对所携带病毒全S 片段核苷酸序列进行分析,阐明大仓鼠携带汉坦病毒的型别和基因特征。方法:用IFA 对鼠肺标本进行初筛,免疫荧光阳性者采取细胞培养和乳鼠传代的方法分离病毒。提取病毒RNA 后反转录套式PCR 对其分型,设计引物用PCR 法扩增S 全片段,产物纯化后连接入质粒载体,转化到JM109 细菌。提取阳性质粒后测序,测序结果用分子进化的方法和软件分析与其它汉坦病毒核苷酸和氨基酸的同源性,并绘制系统进化图。结果:YU61 和YU62 IFA 初筛检测可见阳性抗原颗粒,细胞传代培养三代,乳鼠传代培养三代后得到高滴度的汉坦病毒。应用特异分型引物进行基因分型发现YU61 和YU62属于HTN 型汉坦病毒。YU61 和YU62 的克隆子的核苷酸进行测序:YU61 和YU62 株S 基因全长1701nt,其中A 、T、C、G 的比例分别为31.22%、25.81%、19.93%、23.05%。A+T 的含量为57.03%,C+G 的含量为42.97%。由5’非编码区（non-coding region NCR）、开放阅读框（opening reading frame ORF）以及3’非编码区三部分组成。5’和3’非编码区的长度分别为36nt、375nt。只存在一个全长为1290nt 的完整开放阅读框,起始于第37 位,终止于第1326 位,编码N
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