水稻穗长QTL定位

论文摘要

分子标记技术的应用日趋广泛,对水稻育种研究有重要的价值。近年来,水稻分子标记在水稻遗传图谱的构建、遗传资源保存和遗传多样性分析、基因的标记与克隆、分子标记辅助育种等方面发挥着重要的作用。穗长是水稻产量的重要构成因子之一,控制水稻穗长的基因位点是数量性状,检测水稻穗长性状的QTL并进行遗传效应分析对于水稻产量和品质的遗传改良具有重要的意义。到目前为止,对水稻穗长基因的定位已经有不少报道,但是在不同遗传群体和环境下检测到的穗长QTLs结果有较大差异。本研究利用F2代群体对控制水稻穗长性状基因进行QTL定位分析,利用SSR标记研究穗长性状的遗传多样性。主要研究结果如下:我们用泸恢99╳日本晴的F2代群体(374个单株)为作图群体,构建了遗传连锁图谱,拟合了138个标记,覆盖水稻基因组总长度2342.4 cM,标记间的平均距离为15.61 cM。应用该分子标记连锁图,采用复合区间作图法对穗长性状进行QTLs检测,共检测到7个与穗长性状相关的QTLs,分别位于第1、2、6、7、8、9和10染色体上,这些QTLs对表型变异的贡献率在2.25%～14.35%之间,其中位于第2染色体上的qpl02为主效基因,对表型变异的贡献率最高,为14.35%。所有的QTLs的联合贡献率为48.84%。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 1 文献综述
• 1.1 分子标记技术的发展
• 1.1.1 遗传多样性的概念及其研究方法
• 1.1.2 分子标记技术的分类和发展
• 1.1.3 分子标记技术的应用
• 1.2 QTL 定位研究现状
• 1.2.1 QTLs 的作图分析方法
• 1.2.2 水稻QTL 定位研究进展
• 2 水稻穗长基因的QTL 定位
• 2.1 材料与方法
• 2.1.1 实验材料、设备和主要试剂
• 2.1.2 取样和总DNA 的提取
• 2.1.3 SSR 引物来源
• 2.1.4 SSR 分析
• 2.1.5 数据分析和图谱构建
• 2.1.6 QTL 定位与分析
• 2.2 结果与分析
• 2.2.1 穗长性状在亲本及F2 群体中的表现
• 2.2.2 分子标记的多态性筛选及群体多态性扩增
• 2.2.3 连锁分析和图谱构建
• 2.2.4 水稻穗长的QTLs 复合区间作图分析
• 2.3 讨论
• 3 QTL 定位中存在的问题和前景展望
• 3.1 存在的问题
• 3.1.1 QTL 研究中的互作问题
• 3.1.2 性状间的相关性
• 3.1.3 QTL 定位的不精确性
• 3.1.4 QTL 定位静态分析的弊端
• 3.1.5 QTL 定位与育种实践尚存在脱节现象
• 3.2 前景与展望
• 致谢
• 参考文献
• 附录
• A. 作者在攻读学位期间发表的论文目录