ISS患儿GHR基因单核苷酸多态性的研究

ISS患儿GHR基因单核苷酸多态性的研究

论文摘要

目的:特发性矮小(idiopathic short stature,ISS)具有复杂的遗传背景,是基因和环境相互作用的结果。对该病染色体上易感基因的探究仍然是目前的研究热点和努力方向。本研究通过探讨生长激素受体(growth hormone receptor,GHR)基因外显子10单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)对血清IGF-1水平的影响,进一步研究其对人体生长轴的影响,最终明确GHR基因外显子10SNPs与特发性矮小的相关性。方法:1.病例组和对照组血清IGF-1检测采用放免法,试剂盒由天津九鼎医学生物科技有限公司提供。操作按说明书,批内、批间变异系数达要求范围。病例组与正常对照组进行组间比较。2.采用氯仿抽提法对病例组和正常对照组进行DNA提取,所提DNA采用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA。3.针对目的基因设计并合成引物,PCR扩增目的基因,采用2%琼脂糖凝胶电泳、凝胶成像仪鉴定PCR产物。4.PCR产物直接测序。5.应用软件对测序结果分析,进行SNP分型、等位基因频率的测定。经Hardy—Weinberg遗传平衡定律检验,确定各基因型频率已达到遗传平衡,具有群体代表性。6.组间性别差异用x2检验,年龄及血清IGF-1水平比较用t检验,组间基因型及等位基因频率比较用x2检验,其基因型及等位基因的相对危险度以优势比(Odds ratio,OR)及95%可信(CI)表示。各基因型间血清IGF-1水平差异比较采用方差分析。以上数据用SPSS12.0统计软件进行数据处理。结果:1.病例组的筛选病例组其血清GH水平均正常,甲状腺功能正常,无染色体疾病,无慢性器质性疾病及内分泌代谢性疾病。病例组与对照组年龄、性别差别无统计学意义(P>0.05)。2.病例组与对照组血清IGF-1水平近似正态分布,方差齐,经t检验,差别无统计学意义(P>0.05)。3.GHR基因SNPs的检测:本研究发现GHR基因外显子10共有3个SNP位点改变,分别为748A→C(I544L)、437G→T(C440P)和853A→C(T579P),与NCBI公布的相符合,NCBI公布的591C→T、601A→C在本研究人群中未检测到。各SNPs等位基因频率在人群中的分布符合Hardy-Weinberg平衡。其中位于748位核苷酸的A→C(I544L)处的单核苷酸多态性杂合度最高,为54.2%,3个SNPs位点氨基酸均有极性变化。4.GHR基因多态性与特发性矮小的相关性矮小组748位点SNP基因型频率的分布与对照组比较,差别无统计学意义(P>0.05),其等位基因频率与对照组比较差别无统计学意义(P>0.05);矮小组437、853位点SNP基因型频率的分布及等位基因频率与对照组比较差别均有统计学意义(P<0.05)。在437位点上,T等位基因频率明显升高,G等位基因频率明显降低;在853位点上,A等位基因频率明显升高,C等位基因频率明显降低。5.GHR基因多态性与血清IGF-1水平(1)748位点各基因型血清IGF-1水平经方差分析,差别无统计学意义(P>0.05)。(2)437位点各基因型血清IGF-1水平经方差分析显示,各基因型间差别有统计学意义(P<0.05),按基因型两两比较显示,GT与GG间差别有统计学意义(P<0.05);矮小组各基因型间差别有统计学意义(P<0.05),按基因型两两比较显示,矮小组GG与TT基因型间差别有统计学意义(P<0.05),GG与GT、GT与TT基因型间差别无统计学意义(P>0.05)。(3)853位点各基因型血清IGF-1水平经方差分析显示,各基因型间差别有统计学意义(P<0.05),按基因型两两比较显示,AA、AC分别与CC基因型间差别有统计学意义(P<0.05),AA与AC基因型间差别无统计学意义(P>0.05);矮小组各基因型间差别有统计学意义(P<0.05),AA、AC分别与CC基因型间差别有统计学意义(P<0.05),AA与AC基因型间差别无统计学意义(P>0.05);正常组各基因型间差别有统计学意义(P<0.05),AC、CC分别与AA基因型间差别无统计学意义(P>0.05),CC与AC基因型间差别有统计学意义(P<0.05)。结论:1.血清IGF-1水平不能作为特发性矮小的特异性诊断指标。2.GHR基因外显子10748位点基因型频率的分布与特发性矮小的发病无关。3.GHR基因外显子10748位点等位基因频率的改变不能引起血清IGF-1水平的升高或降低。4.GHR基因外显子10437位点GT、TT基因型及T等位基因是特发性矮小发病的易感性基因,GG基因型及G等位基因是其发病的保护性基因。5.GHR基因外显子10853位点AA、AC基因型及A等位基因是特发性矮小发病的易感性基因,CC基因型及C等位基因是其发病的保护性基因。6.GHR基因外显子10 437、853位点基因型频率及等位基因频率的分布能够影响血清IG-1水平,通过引起血清IGF-1水平的改变影响生长轴的功能。7.总之,GHR基因多态性能够影响血清IGF-1水平,从而影响生长轴的功能,可能是部分特发性矮小发病的危险因素。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 前言
  • 材料与方法
  • 结果
  • 讨论
  • 结论
  • 附图
  • 参考文献
  • 在学期间发表论文和参加科研情况说明
  • 综述
  • 致谢
  • 相关论文文献

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