我国甘肃和陕西省虫媒病毒调查与病毒分子生物学特征研究

论文摘要

甘肃省和陕西省位于我国西北部,是通往大西北内陆的门户,也是我国南北气候分界线所在。这两省长期以来是我国虫媒传染病——乙型脑炎的流行疫区,特别是陕西省近年来的乙型脑炎发病率一直较高。甘肃省天水、陇南和平凉市位于甘肃东南部,紧邻乙脑高发区陕西省和四川省,存在着多种虫媒病毒的传播媒介。对陕西省和甘肃省的病毒性脑炎流行病学监测结果显示,在蚊虫活动高峰的夏秋季节,当地存在病因不明的发热和病毒性脑炎患者,提示当地存在其它虫媒病毒性疾病的可能性。目前我国正进行西部大开发,将有大量人员和物资的来往和流动,可能会造成虫媒病毒病的传入、甚至爆发流行。因此,对甘肃省和陕西省进行虫媒病毒病原学的调查,全面了解当地存在和循环的虫媒病毒种类与分布情况,对于研究我国西北的虫媒病毒生物学及分子生物学特征、预防和控制当地虫媒病毒病等均具有重要意义。本课题对甘肃和陕西省部分地区进行虫媒病毒调查,以明确当地存在的虫媒病毒种类与分布,并对近年在虫媒病毒调查中分离到的部分病毒进行详细鉴定和序列分析,以了解我国新分离株的系统分类地位、分子生物学特征及其与国外分离株之间的分子生物学差异。1.甘肃省虫媒病毒调查2006年和2007年7～8月在甘肃省天水、陇南和平凉市的11个县区采集蚊虫标本13872只,分206批进行研磨和病毒分离。结果分离到30个阳性分离物,来自5个蚊种——三带喙库蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊、淡色库蚊和伊蚊。经过系统鉴定,共得到4株乙脑病毒（Japanese encephalitis virus,JEV）、2株盖塔病毒（Getah virus,GETV）、10株版纳病毒（Banna vires,BAV）和17株骚扰阿蚊单组分RNA病毒（Armigeres subalbatus Totivirus,AsTV）,共计33株。从三带喙库蚊和淡色库蚊中分离到的病毒最多,分别是22株和4株;4种病毒均能从三带喙库蚊中均分离到。对新分离病毒分子生物学特征分析显示,4株JEV均为基因Ⅰ型病毒,分离株之间E基因核苷酸和氨基酸序列同源性为98.3%～100%和99.8%～100%。新分离JEV与疫苗株SA14-14-2在E基因区段存在11处共同的氨基酸差异,但差异位点均不处于决定抗原性的关键氨基酸位点3’非编码区中均有典型的基因Ⅰ型序列缺失特征。2株新分离的GETV与我国其它省份和其它国家分离株的遗传关系很相近,Capsid基因之间的核苷酸和氨基酸序列同源性在97%以上。发现分离株GS07-KD22在Capsid基因中紧邻第76位后出现1个氨基酸的插入。2株GETV在3’UTR区第45nt～54nt间都存在与我国其它省分离株及蒙古和俄罗斯分离株相同的10个核苷酸缺失。对10株新分离BAV的核酸带型分析发现新分离株与北京分离株（BJ95-75）在第6和第9条带稍有差异,第6条带稍小,而第9条带稍大。甘肃省分离株第12片段核苷酸和VP12蛋白序列中存在多个不同于其它地域分离株的共同差异位点,10株病毒在第689位核苷酸发生缺失,并且VP12基因有两个连续的起始密码子,终止密码子与印度尼西亚分离株相同（TGA）,而不同于云南和北京分离株（TAA）。10株BAV与基因A型分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.4%～93.3%和91.8%～93.7%,与基因B型分离株的同源性分别为88.6%～89.9%和85.5%～87.9%。系统发生分析结果显示甘肃省分布的BAV具有明显的地域特征,属于基因A型内的一个新亚型。2.陕西省虫媒病毒调查2006年9月在陕西省安康市和宝鸡巿共4县区采集蚊虫标本2765只,分离到1株昆虫浓核病毒（Densovirus,DNV）和1株AsTV。对AsTV分离株SaX06-AK20进行了全基因组特征研究,AsTV全长7510 bp,有两个开放读码框（ORF）,ORF1长4443nt,编码病毒衣壳蛋白CP,ORF2长2286 nt,编码聚合酶RdRp。AsTV与单分体病毒科成员的核苷酸同源性为17.5%～41.4%,氨基酸同源性为5.3%～43.1%,系统发生分析表明AsTV是该科内的一种新病毒,或者可能是一种新的感染节肢动物的dsRNA病毒科的代表。3.病毒分子生物学特征研究对我国分离到的10株GETV进行序列测定和分子特征分析,测定了其中3株（M1、HB0234、YN0540）的全基因组序列,和另7株的E2基因和3’UTR。3株病毒与其它国家分离株的全基因组序列同源性分别是97.4%～98.8%（核苷酸）和98.7%～99.6%（氨基酸）。10株病毒之间E2基因核苷酸序列同源性在97.7%～99.9%,发现所有分离株在3’UTR第45-54位均出现10个核苷酸的缺失（YN0540有9个缺失）,这同我国台湾、蒙古和俄罗斯分离株的一致。系统发生分析显示我国分离的GETV之间均有很近的亲缘关系。对16株分离自辽宁、云南、新疆和贵州省的淡色库蚊浓核病毒（CppDNV）进行鉴定和分子特征分析,结果显示CppDNV的完整编码区长3,335nt,有3个开放读码框,ORF1,2,3分别为2,376 nt、1,092 nt和1,071 nt,分别编码非结构蛋白1（NS1）、非结构蛋白2（NS2）和衣壳蛋白（VP）。CppDNV（JZ-16）全编码区序列同AalDNV-1、AalDNV-2、AaeDNV、AalDNV-3和HeDNV的同源性在81.6%～93.0%（核苷酸）之间,而且16株CppDNV分离株之间的同源性在98%以上,序列差异和系统发生分析显示CppDNV是一类新的DNV变异株。4.其它工作此外,对7株河南省2006年病毒分离物、1株新疆病毒分离物,1株蝙蝠病毒分离物和6株贵州省2006年病毒分离物进行了鉴定和/或分子生物学特征分析。河南省7株病毒均为基因Ⅰ型JEV,贵州省鉴定出3株基因Ⅰ型JEV,而新疆的病毒分离物M0507JS9可能为芜箐黄花叶病毒科（Tymoviridae）内的新成员。本课题的意义本课题对甘肃省和陕西省部分地区进行了虫媒病毒调查,在甘肃省分离到4种病毒,在陕西省分离到2种病毒。在甘肃省首次分离到基因Ⅰ型JEV,同时发现甘肃省分布的BAV具有明显的地域特征,并且还分离到一种新病毒（AsTV）。这些数据不但丰富了我国和甘肃省、陕西省虫媒病毒的种类,而且为了解当地传染病病因以及积极预防和控制相关虫媒病毒疾病提供了重要的信息。对我国分离到的GETV、CppDNV以及河南、新疆、贵州等省的病毒分离物的鉴定和/或基因分子生物学特征分析,明确了这些病毒的分类地位及与国内外分离株之间的分子生物学差异,丰富了我国虫媒病毒分子生物学研究内容,为深入研究我国存在和流行的虫媒病毒积累了知识。

论文目录

• 英文缩略语
• 中文摘要
• 英文摘要
• 前言
• 第一章 甘肃和陕西省虫媒病毒的调查与病毒分子特征分析
• 第一节 甘肃省蚊虫标本采集和病毒分离
• 第二节 甘肃省新分离病毒的鉴定及分子特征分析
• 第三节 陕西省虫媒病毒调查
• 第二章 虫媒病毒的分子生物学特征研究
• 第一节 我国分离的10株盖塔病毒分子生物学特征研究
• 第二节 我国新分离的浓核病毒全编码区基因组序列特征分析
• 第三节 新分离单组分RNA病毒全基因组特征研究
• 第三章 其它内容
• 第一节 河南省2006年乙脑病毒分离株的鉴定和分子特征分析
• 第二节 贵州省2006年虫媒病毒分离物的鉴定
• 第三节 蝙蝠病毒分离物YN8613的初步鉴定
• 第四节 新分离Tymo病毒的鉴定
• 总结
• 一.甘肃省和陕西省虫媒病毒调查
• 二.新分离病毒的分子生物学特征研究
• 三.其它工作
• 参考文献
• 论文综述:鉴定未知病毒的分子生物学技术
• 附录:蚊虫标本采集背景资料
• 个人简历
• 致谢