猪OB和OB-R基因多态性检测及其关联分析

论文摘要

本实验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析OB和OB-R2个候选基因的多态性及其与大白猪、长白猪、杜洛克这3个群体的产仔性能之间的关联性，结果表明：OB基因5’侧翼区OB-1片段245bp处检测到G→C突变；OB基因外显子2区域OB-2片段102bp处检测到A→G突变；OB-R基因第三外显子区域OBR-1片段119bp处检测到T→C突变；OB-R基因第三外显子区域OBR-2片段27bp处检测到C→T突变，上述突变除OBR-1片段119bp处的T→C突变位点只检测到2种基因型外，其他突变位点都相应地检测到3种基因型。在OB-1片段245bp的G→C突变位点上，不同基因型长白初产母猪、大白初产和经产母猪的TNB和NBA表现出GG型>CC型>GC型的趋势；但并无显著影响（P>0.05），长白经产母猪GG和CC型个体的TNB和NBA均显著高于GC型（P<0.05），GG型和CC型个体差异不显著，但大体也表现出GG型>CC型>GC型的趋势；杜洛克猪中初产和经产母猪GG型和CC型个体的TNB和NBA均高于GC型，但差异不显著（P>0.05）。在OB-2片段102bp的A→G突变位点上，长白猪初产母猪和经产母猪个体的TNB和表现出AG型>GG型>AA型的趋势，其中AG型和GG型个体间存在显著差异（P<0.05）；大白猪和杜洛克的初产母猪和经产母猪的TNB和NBA均表现为AG型>AA>GG型，但差异均不显著（P>0.05）。在OBR-1片段119bp的T→C突变位点上，长白初产母猪和经产母猪不同基因型对其TNB和NBA均无显著影响（P>0.05）；在大白猪中没有检测到CC型个体，其TT型初产母猪和经产母猪的TNB和NBA均大于TC型，但差异不显著（P>0.05）；杜洛克初产母猪不同基因型对TNB和NBA均无显著影响，经产母猪CC型和TC型个体的TNB和NBA均显著大于TT型（P<0.05），但CC型和TC型个体间的TNB和NBA差异不显著（P>0.05）。在OBR-2片段27bp的C→T突变位点上，长白猪和大白猪的初产母猪和经产母猪不同基因型对其TNB和NBA均无显著影响（P>0.05）。杜洛克初产母猪的CC、TT型个体的TNB分别大于CT型个体，差异显著（P＜0.05），但CC型和TT型个体间的TNB差异不显著（P>0.05）；杜洛克初产母猪NBA在不同基因型间差异均不显著（P>0.05）；杜洛克经产母猪的CC、TT型个体的TNB分别大于CT型，差异极显著（P＜0.01），但CC和TT型个体间的TNB差异不显著（P>0.05）；杜洛克经产母猪的CC型个体的NBA极显著大于CT型（P＜0.01），TT型个体的NBA显著大于TC型（P＜0.05），但CC型和TT型个体的NBA差异不显著（P>0.05）。综上，OB基因上OB-1片段245bp的G→C突变、OB-R基因上OBR-1片段119bp处的T→C突变这两个突变位点能否作为猪高产仔数的一个遗传标记，还需进一步研究确定；OB基因上OB-2片段102bp的A→G突变、OB-R基因上OBR-2片段27bp的C→T突变这两个突变位点可以作为与猪产仔性状相关联的遗传标记，利用这2个位点的多态性开展标记辅助选择，有望获得较大的遗传进展。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 1 猪品种介绍
• 1.1 长白猪
• 1.2 大白猪
• 1.3 杜洛克猪
• 2 分子遗传标记的概述
• 2.1 基于分子杂交的分子标记技术
• 2.2 基于 PCR 技术的分子标记技术
• 2.3 基于限制性酶切和 PCR 技术的 DNA 标记
• 2.4 基于 DNA 芯片技术的分子标记技术
• 3 OB 基因和 OB-R 基因的概述
• 3.1 瘦素（OB）基因的研究进展
• 3.2 瘦素受体（OB-R）基因的研究进展
• 4 研究的目的和意义
• 第二章 材料与方法
• 1 实验材料
• 1.1 试验猪来源
• 1.2 主要仪器设备、试剂及配置方法
• 1.3 软件工具
• 2 实验方法与步骤
• 2.1 基因组 DNA 提取
• 2.2 DNA 浓度和纯度检测
• 2.3 目的片段 DNA 扩增
• 2.4 PCR-SSCP 检测
• 2.5 PCR-RFLP 检测
• 3 统计分析方法
• 3.1 基因频率及基因型频率的计算
• 3.2 基因位点的多态信息含量（PIC）、有效等位基因数（Ne）和杂合度（He）
• 第三章 结果与分析
• 1 基因组 DNA 提取效果
• 2 OB 基因的多态性检测与猪繁殖性状的关联分析
• 2.1 OB-1 片段的遗传变异与繁殖性状的关联
• 2.2 OB-2 片段的遗传变异与繁殖性状的关联
• 3 OB-R 基因的多态性检测与猪繁殖性状的关联分析
• 3.1 OBR-1 片段的遗传变异与繁殖性状的关联
• 3.2 OBR-2 片段的遗传变异与与繁殖性状的关联
• 第四章 讨论
• 1 OB 基因
• 1.1 关于 OB 基因的多态性
• 1.2 关于 OB 基因多态性与繁殖性状的关系
• 2 OB-R 基因
• 2.1 关于 OB-R 基因的多态性
• 2.2 关于 OB-R 基因多态性与繁殖性状的关系
• 第五章 结论
• 参考文献