不同品系金鱼和鲫鱼的线粒体分子标记及其系统发育分析

不同品系金鱼和鲫鱼的线粒体分子标记及其系统发育分析

论文摘要

我国的鱼类实验动物开发利用研究工作比较滞后,标准化的鱼类实验动物至今仍是空白。以中国为原产地的金鱼(Carassius auratusVar.)可以作为一种鱼类实验动物进行研究与开发。关于金鱼的解剖性状、蛋白质、同工酶和基因组DNA的随机多态扩增(RAPD)已有一些研究报道,但是,把金鱼作为实验动物,其系统进化关系和分子遗传背景尚有一些争议,很有必要进行深入的研究。线粒体DNA具有自身独特的遗传系统,是理想的物种鉴定的遗传标记物之一。作为分子标记已被广泛应用于各物种系统发生的研究。本文通过研究不同品系的金鱼和鲫鱼的线粒体DNA控制区及其一侧tRNA基因部分核苷酸序列及Cytb序列的对比,为金鱼的系统进化关系和遗传背景研究提供分子生物学证据。本研究的主要研究内容如下:1、对金鱼的代表品种红龙睛、红帽子、虎头、琉金、墨龙睛、水泡眼及彭泽鲫的线粒体DNA控制区及tRNA-Thr和tRNA-Phe基因进行了测序,将所得序列同GenBank中日本白鲫、红鲫、鲤鱼的序列进行比较分析。分析结果说明tRNA-Thr、tRNA-Phe基因序列变化较小,保守性高,进化慢,不能很好地提供系统发育信息;控制区遗传变异程度较高,因而可以为金鱼和鲫鱼系统发育研究提供一个好的分子遗传标记。从线粒体控制区分析证实了金鱼起源于鲫鱼,在演化过程中其遗传物质发生了较大的变异,各个品种金鱼的遗传物质也形成了一定的分化。2、对金鱼的代表品种红龙睛、红帽子、虎头、琉金、墨龙睛、水泡眼、珍珠及彭泽鲫的Cytb基因进行了测序,将所得序列同GenBank中日本白鲫、银鲫、红鲫、野鲫和鲤鱼的序列进行比较分析。从Cyt b基因分析,进一步证实了金鱼起源于鲫鱼。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1.前言与综述
  • 1.1 金鱼起源和系统演化的研究概述
  • 1.2 利用线粒体DNA在鱼类种类遗传分化研究中的应用概述
  • 1.3 本研究的目的和内容
  • 2.金鱼线粒体DNA控制区及tRNA-Thr和tRNA-Phe基因的序列分析
  • 2.1 材料与方法
  • 2.2 结果与分析
  • 2.3 讨论
  • 3.金鱼线粒体Cyt b基因序列分析
  • 3.1 材料与方法
  • 3.2 结果与分析
  • 3.3 讨论
  • 结语
  • 参考文献
  • 附录
  • 附录1 攻读学位论文期间发表的学术论文
  • 附录2 致谢
  • 相关论文文献

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