青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtaunese)GST和FREP基因的表达与功能

青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtaunese)GST和FREP基因的表达与功能

论文摘要

文昌鱼(amphioxus)是介于无脊椎动物和脊椎动物之间的过渡类型,是现存的与脊椎动物祖先最接近的无脊椎动物,一直被认为是研究脊椎动物起源和进化的重要模式动物。文昌鱼基因的序列和表达模式已经被广泛用于不同物种之间的比较基因组学研究和发育同源性分析。本文从青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtaunese)肠cDNA文库中,分离了具有完整编码框的,与脊椎动物肝脏功能密切相关的谷胱苷肽转硫酶(GST)和纤维蛋白原相关蛋白(FREP)基因,并对它们的结构、进化、表达和功能进行了研究。我们在文昌鱼的肠cDNA文库中分离到了一个全长1032 bp的GST cDNA,它最长的开放阅读框编码一个227个氨基酸的蛋白,预测其分子量为26 kDa。BLASTp搜索结果显示该蛋白的N-端(3-79位残基)为GSTN结构域,C-端(120-204为残基)为GSTC结构域。用BbGST-1和其他14类胞质GSTs的氨基酸序列构建系统进化树,发现BbGST-1与多数水生生物(包括鱼类和绿藻)GSTs聚为一支,而与其它胞质GSTs明显分开。多序列比对结果显示BbGST-1与真鲷、黑呆头鱼、金头鲷、欧鲽、大嘴鲈鱼、牙鲆、斑马鱼和绿藻的GSTs分别有51.1%、48.9%、47.4%、48.4%、48.0%、47.6%、51.8%和43.7%的同源性,而与其他类的胞质GSTs同源性均低于27%。经分析,佛罗里达文昌鱼的基因组数据库中也存在GST的cDNA(和BbGST-1氨基酸序列同源性高达93%)和基因组DNA,表明BbGST-1在种内高度保守。基因组结构分析表明,文昌鱼GST基因与斑马鱼的假设GST,真鲷GSTR1和欧鲽GSTA1基因都具有6个外显子和5个内含子。这表明文昌鱼GST的基因组组成与其他几种鱼的GST一致。构建BbGST-1原核表达载体,转化大肠杆菌后诱导表达。纯化的重组蛋白对CDNB表现出相对高的活性(3.37±0.1 unit/mg),对EA表现出低的活性(0.41±0.01 unit/mg),而对DCNB, CHP, 4NBC和4HNE没有检测到活性。原位杂交显示BbGST-1转录本在文昌鱼的肝盲囊表达最丰富,在内柱、咽上沟、后肠、鳃和精巢有微弱表达,而在肌肉、脊索和神经管没有表达。用纯化的重组BbGST-1免疫小鼠制备抗血清,免疫组化实验进一步表明BbGST-1主要分布于肝盲囊、后肠、鳃和卵巢。所有这些表明文昌鱼GST-1属于一类新的GST——rho类,并且其表达具有组织特异性。同时这也显示在GST合成方面,文昌鱼的肝盲囊和脊椎动物的肝脏具有相似性,支持了文昌鱼肝盲囊和脊椎动物肝脏在功能上的等价性。我们还分离了一个编码纤维蛋白原相关蛋白(fibrinogen-related protein, FREP)的基因BbFREP。BbFREP全长1110 bp,它的开放阅读框编码一个286个氨基酸的蛋白,预测其分子量为32 kDa。推测BbFREP有一29个氨基酸残基的信号肽,并且在148位残基有一潜在的Asn-糖基化位点。BLASTp搜索显示,BbFREP在62-281位残基间有一FBG结构域。多序列比对分析表明,BbFREP的FBG和其他已知的FREPs有33.7-43.3%的同源性,它们都有4个保守的半胱氨酸残基。用这些FREPs的FBG结构域构建的进化树表明:BbFREP与人纤维蛋白原β和γ链聚为一支,而与其他FREPs相分开。实时定量PCR显示:在经过脂多糖(LPS)或磷壁酸(LTA)的刺激后,BbFREP的表达量会显著上升,峰值分别达到未处理组的38.8和21.4倍,这表明BbFREP可能为一免疫防御相关分子。通过毕赤酵母重组表达,获得纯化的BbFREP成熟肽,它可以特异性识别细菌表面的病原相关分子模式(PAMPs),包括LPS、肽聚糖(PGN)和LTA。另外重组蛋白对革兰氏阴性菌大肠杆菌和革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌表现出强的溶菌活性,扫描电子显微镜观察发现菌体表面受到破坏。Western blot结果显示,BbFREP也可以与大肠杆菌和金黄色葡萄球菌结合。原位杂交结果表明BbFREP主要在文昌鱼的肝盲囊和后肠表达,这也和其他FREP基因主要在脊椎动物肝脏表达结果一致。以上结果说明BbFREP作为一种模式识别受体起作用,并且可以通过与细菌表明的LPS、LTA和PGN结合,进而导致细菌溶解。另一方面,这些结果也支持了文昌鱼的肝盲囊与脊椎动物肝脏同源的观点,它们都是急性时相反应的主要组织。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 文昌鱼——研究脊椎动物起源和进化的模式动物
  • 1.1 文昌鱼概述
  • 1.2 命名和分类
  • 1.3 文昌鱼的形体结构
  • 1.4 胚胎发育特点
  • 1.5 分子生物学在文昌鱼进化研究中的应用
  • 2 谷胱苷肽转硫酶研究进展
  • 2.1 GSTs的结构
  • 2.2 GSTs的分类
  • 2.3 GSTs的进化
  • 2.4 GSTs的功能
  • 2.5 GSTs的表达模式
  • 3 FREP基因研究概况
  • 3.1 哺乳动物中的FREPs
  • 3.2 无脊椎动物中的FREPs
  • 4 研究目的和技术路线
  • 第二章 青岛文昌鱼Glutathione S-Transferase基因的表达与功能
  • 1 前言
  • 2 材料和方法
  • 2.1 文昌鱼肠cDNA文库的构建和测序
  • 2.2 序列比较与系统进化分析
  • 2.3 BbGST-1 在大肠杆菌中的表达
  • 2.4 重组BbGST-1 的底物特异性
  • 2.5 Northern blot
  • 2.6 切片原位杂交
  • 2.7 多克隆抗体的制备
  • 2.8 Western blot检测
  • 2.9 BbGST-1 的免疫组织化学检测
  • 3 实验结果
  • 3.1 BbGST-1 的序列分析
  • 3.2 BbGST-1 的系统进化分析
  • 3.3 BbGST-1 基因的基因组分析
  • 3.4 重组蛋白BbGST-1 的表达纯化
  • 3.5 BbGST-1 的底物特异性
  • 3.6 BbGST-1 在文昌鱼成体各组织的表达模式
  • 4 讨论
  • 第三章 文昌鱼Fibrinogen-Related Protein基因的表达与功能
  • 1 前言
  • 2 材料和方法
  • 2.1 文库的构建、测序、序列比较与系统进化分析
  • 2.2 BbFREP在大肠杆菌中的表达
  • 2.3 多克隆抗体的制备
  • 2.4 BbFREP基因在毕赤酵母中的表达
  • 2.5 实时定量PCR实验
  • 2.6 酵母表达的BbFREP杀菌活性检测
  • 2.7 扫描电镜实验
  • 2.8 ELISA实验
  • 2.9 酵母重组表达的BbFREP与细菌的结合实验
  • 2.10 Northern blot
  • 2.11 切片原位杂交
  • 3 结果
  • 3.1 BbFREP基因的序列分析
  • 3.2 BbFREP在大肠杆菌中的表达
  • 3.3 BbFREP在酵母中的表达
  • 3.4 LPS和LTA处理后BbFREP的表达模式
  • 3.5 重组BbFREP的溶菌活性
  • 3.6 重组BbFREP与细菌的结合
  • 3.7 重组蛋白与各种配体的结合
  • 3.8 BbFREP基因在成体组织中的表达模式
  • 4 讨论
  • 总结与展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 发表的学术论文
  • 相关论文文献

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