利用微卫星标记分析滩羊群体的遗传多样性与遗传分化

论文摘要

采用中心产区典型群随机抽样方法,在宁夏回族自治区采集四个绵羊群体(园区白滩羊、保种场白滩羊、黑滩羊和小尾寒羊)的样本。选用位于不同染色体上的10个微卫星位点,以小尾寒羊为参照,研究了宁夏牧区三个滩羊群体的遗传多样性和遗传分化,探讨了滩羊群体内和群体间的遗传变异及亲缘关系,初步分析了黑滩羊群体在滩羊群体中的系统地位。研究结果如下:1、10个微卫星座位中共检测到167个等位基因,每个座位在每个群体都检测到的等位基因数在5～13个之间。各对微卫星引物在四个绵羊群体中表现出较大差异。某些绵羊群体一些基因座的观察等位基因数和有效等位基因数非常接近,差距均小于1,说明这些基因座的等位基因在各群体中的分布比较均匀。2、10个微卫星座位和四个绵羊群体的期望杂合度均在0.8左右,属于高度杂合座位和高度杂合群体。各绵羊群体内存在着一定程度的近交。10个微卫星座位均为高度多态座位,平均多态信息含量在0.7223～0.8385之间,四个群体的平均多态信息含量在0.7723～0.7946之间。说明基因变异较大,遗传多样性较好,遗传基础比较广泛,也说明选用的座位均能提供较好的信息,可以反映四个绵羊群体的遗传多样性。3、四个绵羊群体内近交程度较高,有8.93%的遗传变异来源于群体间,而91.07%遗传变异由各群体内个体间的差异引起,群体间存在一定的基因迁移或者有较近的亲缘关系。各群体间基因分化系数Fst均达到极显著水平(p<0.001),说明四个绵羊群体群体间遗传分化极显著。结合Fst值及由其计算得到的每世代两群体间有效迁移个体数,可在一定程度上说明滩羊群体与小尾寒羊之间遗传分化程度最大,黑滩羊群体和白滩羊群体间存在一定的遗传分化,两个白滩羊群体间遗传分化程度相对最小。4、四个群体间遗传距离同遗传分化系数变化趋势一样。综合四个基于DA和DC遗传距离UPGMA和NJ聚类图,显而易见两个白滩羊群体之间遗传关系较近,黑滩羊和白滩羊群体间存在一定的差异,而小尾寒羊群体和滩羊群体遗传关系较远。5、关于黑滩羊群体在滩羊总群体中的系统地位及其分化程度,综合其历史起源、遗传分化系数、遗传距离及聚类图等,可说明黑滩羊群体和白滩羊群体间遗传分化程度较低。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1 文献综述
• 1.1 家畜遗传多样性的概念及其研究意义
• 1.1.1 家畜遗传多样性的概念
• 1.1.2 研究遗传多样性的意义
• 1.2 遗传多样性研究采用的遗传标记
• 1.2.1 遗传标记的概况
• 1.2.2 DNA 分子标记的特点
• 1.2.3 DNA 分子标记的技术类型
• 1.2.4 DNA 分子标记技术的应用
• 1.3 微卫星DNA 标记
• 1.3.1 微卫星DNA 的含义及其分布
• 1.3.2 SSR 标记技术的特点
• 1.3.3 SSR 标记技术在动物遗传育种研究中的应用
• 1.4 本研究涉及的绵羊群体的种质特性
• 1.4.1 白滩羊种质特性
• 1.4.2 黑滩羊种质特性
• 1.4.3 小尾寒羊种质特性
• 1.5 本研究所使用的统计方法
• 1.5.1 群体遗传学一般统计学指标
• 1.5.2 固定指数（Fixation indices）或 F-统计（F-statistics）和基因流分析
• 1.5.3 遗传距离
• 1.5.4 系统树构建常用方法
• 1.6 本研究的目的和意义
• 2 利用微卫星标记进行滩羊群体遗传多样性与遗传分化的研究
• 2.1 实验材料
• 2.1.1 实验样本
• 2.1.2 主要试剂及其配制
• 2.1.3 主要仪器设备
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 绵羊基因组DNA 的提取
• 2.2.2 微卫星引物的选择及PCR 反应条件
• 2.2.3 PCR 扩增产物的凝胶电泳
• 2.2.4 凝胶的硝酸银染色及基因型的判定
• 2.3 统计分析
• 2.3.1 群体遗传学一般统计学指标
• 2.3.2 固定指数（Fixation indices）或 F-统计（F-statistics）及基因流分析
• 2.3.3 遗传距离
• 2.3.4 系统树的构建
• 2.4 结果与分析
• 2.4.1 绵羊基因组 DNA 提取结果
• 2.4.2 微卫星引物 PCR 扩增产物的检测
• 2.4.3 四个绵羊群体的遗传变异水平
• 2.4.5 遗传分化度量及基因流分析
• 2.4.6 四个绵羊群体间的遗传距离及系统树的构建
• 2.5 讨论
• 2.5.1 关于群体的遗传变异
• 2.5.2 关于基因分化系数与群体间遗传分化
• 2.5.3 关于聚类分析与品种选育背景的关系
• 2.6 结论
• 参考文献
• 附录
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文目录