福州地区急性呼吸道感染患儿HCoV-HKU1、HCoV-OC43、RSV感染的检测及分析

论文摘要

目的探讨福州地区急性呼吸道感染患儿中新型人类冠状病毒HKU1（Human Coronavirus HKU1,HCoV-HKU1）、呼吸道合胞病毒（Respiratory Syncytial Virus,RSV）、人类冠状病毒OC43（Human Coronavirus OC43,HCoV-OC43）的感染情况,并探讨其临床意义。方法收集2006～2007年冬春季福建省立医院门诊和住院急性呼吸道感染患儿咽拭子标本176例。其中上呼吸道感染115例,下呼吸道感染61例。分别利用单一逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）和多重RT-PCR（multiplex RT-PCR,mRT-PCR）检测HCoV-HKU1 pol基因、RSV N基因、HCoV-OC43 S基因片段。对RSV阳性的标本同样分别利用单一RT-PCR和mRT-PCR检测A、B亚型的G基因进行亚型分析。对部分阳性产物进行测序鉴定,并将HCoV-HKU1、HCoV-OC43所测序列进一步进行同源性分析以及系统进化树分析。结果1、176例标本中,共检出HCoV-HKU1阳性1例（0.6%）,HCoV-OC43阳性9例（5.1%）,RSV阳性28例（15.9%）。2、唯一1例HCoV-HKU1阳性患者同时合并感染RSV。3、随机选取2例HCoV-OC43阳性扩增产物进行序列测定,结果分析显示核苷酸序列完全一致,与GenBank中HCoV-OC43部分代表株序列一致性达96%以上,氨基酸一致性达100%。4、HCoV-HKU1阳性扩增产物核苷酸序列与GenBank中HCoV-HKU1代表株序列一致性达99%以上,氨基酸同源性达100%;系统进化树分析显示与HCoV-HKU1 C基因型代表株（DQ415913）亲缘关系最近。5、28例RSV阳性标本中,急性下呼吸道感染组阳性率为37.7%（23/61）,显著高于急性上呼吸道感染组的4.3%（5/115）（x2=33.15,P<0.05）。6、RSV亚型检测显示,A亚型23例（82%）,B亚型4例（14%）,不明分型1例（4%）;上、下呼吸道感染组患者间RSV亚型分布差异无显著性（P>0.05）,都以A亚型为主。7、RSV阳性患儿的年龄以3岁以下为主。结论1、RSV和HCoV-OC43是福州地区2006～2007年冬春季急性呼吸道感染患儿的重要病毒病原。HCoV-HKU1感染可能与福州地区儿童下呼吸道感染存在相关性。2、RSV与HCoV-HKU1合并感染可能是造成患儿呼吸道疾病加重的重要原因。3、RSV主要引起急性下呼吸道感染,且以3岁以下婴幼儿易感。4、2006～2007年度福州地区RSV两种亚型同时流行,以A亚型为主。5、多重RT-PCR方法可代替单一RT-PCR进行HCoV-HKU1、HCoV-OC43、RSV的检测。

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