程广前:石刁柏核质体DNA的生物信息学分析及染色体定位论文

程广前:石刁柏核质体DNA的生物信息学分析及染色体定位论文

本文主要研究内容

作者程广前,贾克利,李娜,邓传良,李书粉,高武军(2019)在《石刁柏核质体DNA的生物信息学分析及染色体定位》一文中研究指出:在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT)。NUPTs在植物染色体(包括性染色体)的演化过程中具有重要作用,但目前相关研究比较缺乏。以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)2个片段进行染色体定位。结果表明,石刁柏核基因组中有2239个NUPTs序列的插入,总长度为565970bp,占核基因组的0.047%。不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其它染色体,表明NUPTs在石刁柏性(Y)染色体上累积的更多。石刁柏叶绿体基因组中的IR区、大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)序列均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高。此外,对2个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异性分布在Y染色体上。研究结果为深入揭示石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础。

Abstract

zai zhi wu ji yin zu zhong ,xie lu ti DNA(cpDNA)xu lie ke yi xiang he ji yin zu zhuai yi cheng wei he zhi ti DNA(NUPT)。NUPTszai zhi wu ran se ti (bao gua xing ran se ti )de yan hua guo cheng zhong ju you chong yao zuo yong ,dan mu qian xiang guan yan jiu bi jiao que fa 。yi ci xiong yi zhu zhi wu dan diao bai (Asparagus officinalis)wei cai liao ,cai yong sheng wu xin xi xue fang fa dui ji he ji yin zu NUPTsjin hang zhu shi ji fen xi ,bing shua qu xie lu ti ji yin zu fan xiang chong fu ou (IR)2ge pian duan jin hang ran se ti ding wei 。jie guo biao ming ,dan diao bai he ji yin zu zhong you 2239ge NUPTsxu lie de cha ru ,zong chang du wei 565970bp,zhan he ji yin zu de 0.047%。bu tong ran se ti shang cha ru de NUPTsshu liang cun zai jiao da cha yi ,Yran se ti shang de NUPTsshu liang 、mi du ji zong chang du jun gao yu ji ta ran se ti ,biao ming NUPTszai dan diao bai xing (Y)ran se ti shang lei ji de geng duo 。dan diao bai xie lu ti ji yin zu zhong de IRou 、da chan kao bei ou (LSC)he xiao chan kao bei ou (SSC)xu lie jun neng gou xiang he ji yin zu zhuai yi ,dan IRou xu lie zhuai yi pin lv geng gao 。ci wai ,dui 2ge IRou de xie lu ti xu lie jin hang ying guang yuan wei za jiao ,ji zhong AocpIR1zhu yao fen bu zai suo you ran se ti de zhao si li bu wei ,er AocpIR2te yi xing fen bu zai Yran se ti shang 。yan jiu jie guo wei shen ru jie shi dan diao bai ji yin zu de jie gou ji ji xing ran se ti de yan hua dian ding le jian shi de ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物学报的程广前,贾克利,李娜,邓传良,李书粉,高武军,发表于刊物植物学报2019年03期论文,是一篇关于石刁柏论文,生物信息学分析论文,核质体论文,性染色体论文,植物学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物学报2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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