02428双矮/南京11F2群体主要农艺性状QTL分析

02428双矮/南京11F2群体主要农艺性状QTL分析

论文摘要

利用02428DD/南京11F2群体构建水稻分子遗传图谱并进行水稻主要农艺性状QTL定位及遗传效应估计,对水稻重要QTL的发现及分子育种具有着重要的理论意义和实践意义,主要研究结果如下:1.选用95对引物对含189个单株的F2群体构建一张SSR遗传图谱,覆盖12条染色体共14个连锁群,该图谱全长1110.6cM,标记间平均距离11.7cM,各标记较均匀地分布在各条染色体上。2.检测到10个性状共15个QTL,分布在7条染色体的9个区间。分别为穗数QTL2个、每穗颖花数QTL1个、千粒重QTL2个、结实率QTL1个、穗长QTL1个、一次枝梗数QTL1个、二次枝梗数QTL2个、剑叶长QTL1个、剑叶长宽比QTL2个,基部茎粗QTL2个。3.穗数QTL为qPN10、qPN2,贡献率分别为16.65%和6.55%,其增效等位基因均来源于父本南京11。每穗颖花数QTL qSP8,可以解释该性状14.76%的表型变异,其增效等位基因来源于父本南京11。千粒重QTL2个--qGW6、qGW7,表型贡献率分别为6.86%、6.52%,其增效等位基因qGW6来自父本南京11,qGW7来自母本02428DD.结实率qSSR10贡献率为10.18%,其增效等位基因来自父本南京11。检测到1个控制穗长的QTL,qPL5,对表型的贡献率为9.04%,其增效等位基因来自母本02428DD.控制一、二次枝梗数的QTL分别为2个和1个,其中一次枝梗数QTL分别为qPBN8-2与qPBN8-1,两个QTL均位于第8染色体上,相距约28cM。两个QTL的贡献率均在10%以下,其增效等位基因均来源于父本南京11。二次枝梗数QTL为qSBN8,也位于第8染色体,位置与控制一次枝梗数的qPBN8-2目距仅6cM,表型贡献率为13.06%,为主效QTL,其增效等位基因来源于父本南京11。与剑叶长有关的QTL为qFL12,位于12染色体,其表型贡献率为13.70%,其增效等位基因来自母本02428DD.控制剑叶长宽比的QTL分别为qFLWR10与qFLWR8,其表型贡献率分别为11.49%和7.20%,其增效等位基因qFLWR10来自父本南京11,qFLWR8来自母本02428DD.与基部茎粗有关的QTL共检测到2个--qBCT5与qBCT7,前者贡献率为13.99%,后者贡献率为8.49%,两者的增效等位基因均来自母本02428DD。4.各QTL之间的连锁关系可部分解释各性状表型值之间的相关关系。且各连锁的QTL大多为增效QTL或者减效QTL连锁,而极少出现增效与减效QTL连锁的情况,可减少育种工作量,对育种利用有利;各QTLs其基因作用方式主要表现为超显性或显性,可用于杂种优势利用。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 缩略语
  • 第一章 文献综述
  • 1 分子标记的发展与遗传图谱的构建
  • 1.1 分子标记的类型
  • 1.2 遗传图谱的构建
  • 1.2.1 亲本选配
  • 1.2.2 作图群体的类型
  • 1.2.3 群体大小的选择
  • 1.2.4 标记基因型的检测与标记基因型数据连锁分析
  • 1.3 QTL定位分析方法
  • 2 水稻产量相关性状基因(QTL)及其他农艺性状基因(QTL)研究
  • 2.1 水稻产量相关性状QTL研究
  • 2.1.1 穗数QTL
  • 2.1.2 每穗颖花数QTL
  • 2.1.3 粒重QTL
  • 2.1.4 结实率QTL
  • 2.1.5 单株产量QTL
  • 2.1.6 穗长QTL
  • 2.1.7 一次枝梗数QTL
  • 2.1.8 二次枝梗数QTL
  • 2.2 水稻农艺性状QTL研究
  • 2.2.1 剑叶长度QTL
  • 2.2.2 剑叶宽度QTL
  • 2.2.3 剑叶叶面积QTL
  • 2.2.4 剑叶长宽比QTL
  • 2.2.5 基部茎粗QTL
  • 2.3 QTL研究的目的与意义
  • 3 本研究的目的意义
  • 2群体主要农艺性状QTL分析'>第二章 02428双矮/南京11 F2群体主要农艺性状QTL分析
  • 1 材料与方法
  • 1.1 供试材料
  • 1.1.1 亲本材料
  • 1.1.2 群体材料
  • 1.2 试剂与仪器
  • 1.2.1 常用溶液配制
  • 1.2.2 主要仪器
  • 1.3 田间种植与性状考查
  • 1.3.1 田间种植
  • 1.3.2 性状考察
  • 1.4 DNA的提取、试验引物、PCR扩增及电泳检测
  • 1.4.1 DNA的提取
  • 1.4.2 试验引物
  • 1.4.3 PCR扩增及电泳检测
  • 1.5 遗传图谱的构建及QTL分析
  • 1.5.1 遗传图谱构建
  • 1.5.2 QTL分析
  • 2 结果与分析
  • 2.1 遗传图谱的构建及比较
  • 2.1.1 SSR遗传图谱的构建
  • 2.1.2 遗传图谱的比较
  • 2群体性状表型'>2.2 亲本及F2群体性状表型
  • 2.2.1 亲本性状表型
  • 2群体性状表型'>2.2.2 F2群体性状表型
  • 2.3 各性状间的相关关系
  • 2.4 QTL定位及效应分析
  • 2.4.1 产量构成四要素QTLs的定位及其遗传效应分析
  • 2.4.2 穗长、一二次枝梗数QTLs的定位及其遗传效应分析
  • 2.4.3 与产量关系密切重要农艺性状QTLs的定位及其遗传效应分析
  • 3. 讨论
  • 3.1 关于遗传图谱的构建
  • 3.2 不同遗传背景下的鉴定结果比较
  • 3.3 关于QTL成簇分布
  • 3.4 关于基因作用方式及其应用
  • 第三章 全文总结
  • 1 全文结论
  • 1.1 02428DD/南京11遗传图谱构建
  • 1.2 相关QTLs定位及效应分析
  • 2 本研究的创新之处
  • 参考文献
  • 致谢
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