中国北方群体中强直性脊柱炎的候选基因关联研究DA2B的病因学研究

论文摘要

AS是一种常见的慢性炎症性疾病。病变主要累及骶髂关节,引起脊柱强直,部分患者伴有不同程度的髋关节、眼、肺、心血管、肾等多器官损害,目前为止,AS的发病原因仍不清楚。既往研究表明AS与HLA-627强关联。全基因组连锁和关联分析结果显示在染色体1p、2q、6q、6p、9q、10q、16q以及19q存在AS连锁区段。近年来多个群体报道2q14的Interleukin 1基因簇与AS关联。这些结果为研究非B27基因提供了线索和证据。论文一采用候选基因关联研究,在中国北方人群中定位AS的易感基因,并深入研究-850T变异对TNFa启动子转录活性的影响。本论文的第一部分旨在以HLAⅢ类基因区的TNFa启动子-850T变异作为AS的遗传标记,在其侧翼各60kb的范围内定位AS的易感基因。我们挑选了11个SNPs,在中国北方吉林群体中进行病例对照关联研究。结果显示,TNF（rs1799724）在中国北方吉林人群中与AS关联（P=0.021）,携带T等位基因增强了疾病的发病风险（OR=1.95,95%CI:1.10-3.45）。通过连锁不平衡分析,将AS可能的易感基因定位在58kb的范围内。为了进一步寻找AS的易感基因,我们从58kb区段内的7个与免疫疾病相关基因中挑选出29个SNP进行精细定位。结果尚未发现与AS关联的SNP。为了进一步研究-850T变异对TNFa基因启动子转录活性的影响,我们利用定点突变技术分别构建突变型T和野生型C两种荧光素酶报告基因载体,瞬时转染人HepG2细胞系,检测突变型T对TNFa启动子活性的影响。结果显示-850突变型T等位基因较野生型C增强了TNFa启动子活性,1.05-1.33倍。独立样本t检验未见统计学意义（t=1.645,P=0.102）。提示-850T变异可能仅作为遗传标记连锁AS的易感基因。结论:我们在HLAⅢ基因区将AS的易感基因定位于58kb的范围,-850T未能增强TNFa启动子的转录活性,其周围紧密连锁有AS的易感基因。本论文的第二部分从免疫应答和免疫调节网络入手,采用候选基因关联研究策略寻找AS的易感基因。首先通过文献检索,挑选与抗原呈递,T细胞活化,细胞免疫和体液免疫应答,免疫调节等方面的节点基因,初步作为AS研究的候选基因。经PubMed和遗传关联数据库（GAD）筛选,保留14个与三个或三个以上的免疫学疾病关联基因作为候鸦颉Ｆ浯未?4个基因中挑选出19个与三个或三个以上的免疫学疾病关联,同时显著性大于0.001的SNP作为遗传标记,分别在45个中国吉林AS患者与HapMap数据库中提供的中国北京地区正常群体中进行关联研究,保留显著性小于0.01的两个SNP rs10489629和rs1024611,在整个中国吉林AS群体中复制关联结果。其中IL23R SNPrs10489629与AS关联。最后在其周围挑选7个SNP进行病例对照关联研究。结果显示SNP rs10736406和rs10889677与AS关联。结论:我们基于免疫应答和免疫调节网络,采用候选基因关联研究策略,研究AS的易感基因。结果显示IL23基因与AS关联。DA2B是一种先天性遗传病,主要表现为2个或2个以上关节的挛缩畸形,并且不包括由神经和肌肉病变所导致的关节畸形。远端关节弯曲2B型是DA中最常见的类型之一。其有明显的遗传异质性,目前发现TNNI2,TNNT3和MYH3的突变导致了疾病的发生。论文二旨在制造携带R156X和del175K两种突变的Knock-in小鼠模型,并用其来研究DA2B的发病机理。首先我们利用定点突变技术构建打靶载体,并通过基因打靶技术获得携带TNNI2del175K突变基因的ES细胞,经囊胚注射和假孕移植产生嵌合体小鼠,筛选F1和F2代小鼠,鉴定出TNNI2del175K/del175K纯合小鼠。表型分析发现:1)部分TNNI2del175K/+和全部TNNI2del175K/del175K小鼠在哺乳期死亡。2)TNNI2del175K/+和TNNI2del175K/del175K小鼠在哺乳期内发育迟缓。结论:1.TNNI2del175K纯合突变致死。2.TNNI2del175K变导致小鼠发育迟缓。

论文目录

• 中文摘要
• Abstract
• 前言
• 参考文献
• 论文一 中国北方群体中强直性脊柱炎的候选基因关联研究
• 第一部分 HLAⅢ类基因区的强直性脊柱炎关联研究
• 第一节 HLAⅢ基因区AS易感基因的定位研究
• 材料
• 方法
• 结果
• 分析
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 第二节 HLAⅡ基因区精细定位AS的易感基因
• 材料
• 方法
• 结果与分析
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 第三节 体外探讨-850T突变对TNFα基因转录活性的影响
• 材料
• 方法
• 结果
• 分析
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 第二部分 免疫系统网络候选基因法筛选AS的易感基因
• 材料
• 方法
• 结果
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 论文二 DA2B的病因学研究
• 第一节 Tnni2R156X和Tnni2del175Kknock-in小鼠模型的建立及其表型分析
• 材料
• 方法
• 结果与分析
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 结论
• 附录一 英汉名词及对照
• 致谢
• 个人简历