白山龙胆天然群体的遗传与表观遗传结构研究

论文摘要

保护遗传学（conservation genetics）是保护生物学与分子遗传学交叉而产生的一门新兴学科,其是当今生物学研究的热点之一。在本论文的研究中,我们分别运用了扩增片段长度多态性（Amplified fragment length polymorphism, AFLP）和甲基化敏感扩增多态性（Methylation-sensitive amplification polymorphism, MSAP）技术对分布于长白山不同海拔高度的白山龙胆（Gentiana jamesii）居群进行了遗传和表观遗传结构分析,并在此基础上探讨了其与海拔高度之间的相关性。根据AFLP结果显示,白山龙胆遗传多样性很高。通过15对AFLP引物组合共扩增出的总条带数为664条,其中439个条带为多态性位点,其多态位点百分比平均值为65.99 %,Shannon信息指数平均值为0.326。同时,白山龙胆MSAP 12对引物组合共扩出的总条带数为550。通过白山龙胆甲基化敏感多态矩阵（Methylation-sensitive polymorphisms, MSP）计算出的白山龙胆甲基化引物多态位点百分比平均值为54.73%,Shannon信息指数平均值为0.29。结果中看出白山龙胆的MSAP甲基化引物多态性较高。此外,根据甲基化水平分析显示,CG和CHG总合的平均值为36.87 %,该结果显示白山龙胆甲基化水平较高。此外,本论文还通过Structure和PAUP软件计算得到了白山龙胆的遗传结构图和邻接树（neighbor joining, NJ）。结果显示,白山龙胆的遗传和表观遗传结构与海拔高度成正相关,这可能是对高山生态环境适应的结果。基于以上的研究基础,我们对分布于长白山的白山龙胆的遗传和表观遗传结构有了初步的了解,这为将来进一步的遗传保护提供了可靠的理论依据。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 引言
• 一、文献综述
• 1.1 植物群体遗传学研究进展
• 1.1.1 植物群体遗传学的发展
• 1.1.2 植物群体遗传多态性度量参数
• 1.2 DNA 分子标记技术及其在植物遗传研究中的应用
• 1.2.1 DNA 分子标记技术
• 1.2.2 DNA 分子标记技术在植物遗传研究中的应用
• 二、白山龙胆遗传与表观遗传结构研究
• 2.1 材料和方法
• 2.1.1 材料
• 2.1.2 方法
• 2.2 结果和分析
• 2.2.1 AFLP 引物组合筛选
• 2.2.2 MSAP 引物组合筛选
• 2.2.3 MSAP 甲基化水平分析
• 2.2.4 Structure 软件分析与NJ 系统树的构建
• 2.3 讨论
• 结论
• 参考文献
• 致谢