水稻程序性细胞死亡相关基因的克隆和功能分析

水稻程序性细胞死亡相关基因的克隆和功能分析

论文摘要

程序性细胞死亡(PCD)是生物体内高度协调的生理过程,在植物发育、分化和压力诱导下都发挥着重要作用。在哺乳动物中很多抑制或诱导PCD的基因已经被克隆和分析,但是却很少在植物中发现它们的同源基因。 我们先前在水稻中克隆并报道了一个与PCD相关的基因——OsPDCDS,它的过表达能够使转基因植株出现多种PCD的特征。在这篇论文中,我们将对OsPDCD5基因的特征进行详细地分析。OsPDCD5基因的cDNA全长为416bp,编码一个128aa的蛋白质。RT-PCR分析表明OsPDCD5基因在成熟根和叶片中的表达水平分别高于幼根和幼叶,而且在水稻杆中的表达是沿顶端到根部方向逐渐递减,说明OsPDCD5的表达与叶片和根的衰老以及杆的发育有关。我们使用anti-OsPDCD5的多克隆抗体检测OsPDCD5在水稻多种组织中的分布,免疫杂交结果表明OsPDCD5在水稻叶片、叶鞘、幼穗、杆的不同节段中都有表达,但是在花药组织中不表达。另外,我们发现UV-B照射能诱导OsPDCD5的表达,无论是在转录水平和蛋白水平。最后,我们使用酵母双杂交方法筛选水稻cDNA文库,获得了OsPDCD5的相互作用蛋白——类钙调磷酸酶B相互作用蛋白激酶23(OsCIPK23),它是类钙调磷酸酶B(CLBs)和CLB相互作用蛋白激酶(CIPKs)信号网络的一员。通过GST沉降分析进一步证实OsPDCD5和OsCIPK23在体外能够相互作用。 在哺乳动物中PCD被主要分成两类:凋亡和自噬。在自噬过程中,一部分细胞质被双层膜结构包裹形成自噬体,然后靶向运输到液泡,被液泡内水解酶降解。双层膜结构的形成与两条类泛素修饰途径有关,其中一个修饰途径是Atg8与PE连接反应。Atg8的C末端首先被半胱氨酸蛋白酶Atg4切割,随后Atg8暴露出的甘氨酸被Atg7激活后转到Atg3,最终实现Atg8与PE相连。近期研究已经在拟南芥中分离了Atgs家族,但是迄今为止并没有关于水稻Atgs家族和自噬途径的研究报道。在本论文的第二章中,我们首先在水稻中分离了两个自噬相关基因,OsAtg8和OsAtg4。RT-PCR结果表明OsAtg8和OsAtg4基因在水稻成熟叶片、幼叶、成熟根、幼根、叶鞘和幼穗组织中具有一致的表达水平。为了继续研究这两个基因是否与酵母同源基因具有相似的特点,我们对酵母中表达的OsAtg8融合蛋白进免疫杂交分析,结果表明OsAtg8的C末端能够在酵母细胞中被切割。将OsAtg8的C末端117位甘氨酸突变成丙氨酸后,OsAtg8-Gly117Ala融合蛋白的C末端不能被切割,说明Gly117是OsAtg8的C末端切割反应所必须的,这些与对哺乳动物Atg8的Gly120的研究结果相一致。另外,我们通过酵母双杂交的方法证实了OsAtg8和OsAtg4之间能够发生相互作用,而且发现OsAtg8蛋白Gly117的突变并不能影响它们的作用。这些结果说明OsAtg8和OsAtg4在结构和功能上都是非常保守的,提示在水稻中存在保守的自噬途径。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 综述:植物程序性细胞死亡的研究进展
  • 1 程序性细胞死亡的分类
  • 2 在植物中存在凋亡吗?
  • 3 自噬
  • 3.1 自噬的类型
  • 3.2 醉母自噬的分子遗传学模型
  • 3.3 在拟南芥中对ATG系统的分子生物学分析
  • 3.4 植物中自噬的生理作用
  • 4 非溶酶体参与的PCD
  • 5 诱导植物PCD的因素
  • 5.1 发育PCD
  • 5.2 在植物病原体侵害时的细胞死亡
  • 6 动物死亡相关基因的植物同源基因
  • 7 植物PCD特有的基因
  • 8 总结和展望
  • 参考文献
  • 第一章 水稻OsPDCD5基因表达和特征分析
  • 前言
  • 1.1 材料
  • 1.1.1 水稻材料
  • 1.1.2 菌种
  • 1.1.3 质粒载体
  • 1.1.4 细胞株
  • 1.2 引物和测序
  • 1.3 实验材料
  • 1.3.1 实验试剂及试剂盒
  • 1.3.2 试剂及培养基的配制
  • 1.4 仪器设备
  • 1.5 分析软件
  • 1.6 实验方法
  • 1.6.1 技术路线和实验方案
  • 1.6.2 水稻OsPDCD5基因及其氨基酸序列分析
  • 1.6.3 RT-PCR分析
  • 1.6.4 重组质粒的构建
  • 1.6.5 水稻OsPDCD5重组蛋白的表达纯化
  • 1.6.6 多克隆抗体的制备和检测
  • 1.6.7 水稻蛋白质的抽提
  • 1.6.8 免疫杂交分析
  • 1.6.9 酵母双杂交筛选与OsPDCD5相互作用的蛋白质
  • 1.6.10 GST沉降技术分析
  • 1.7 结果
  • 1.7.1 OsPDCD5基因序列分析
  • 1.7.2 OsPDCD5基因的组织表达分析
  • 1.7.3 OsPDCD5蛋白表达纯化和anti-OsPDCD5多克隆抗体的制备
  • 1.7.4 OsPDCD5的组织表达分析
  • 1.7.5 UV-B能够诱导OsPDCD5的表达
  • 1.7.6 OsPDCD5新互作蛋白的筛选
  • 1.7.7 OsPDCD5与OsCIPK23的相互作用
  • 1.8 讨论
  • 参考文献
  • 第二章 水稻OsAtg8和OsAtg4基因克隆与功能分析
  • 前言
  • 2.1 材料
  • 2.2 引物及测序
  • 2.3 实验试剂和试剂盒
  • 2.4 实验方法
  • 2.4.1 技术路线和实验方案
  • 2.4.2 水稻OsAtg8和OsAtg4基因的克隆及分析
  • 2.4.3 OsAtg8及其突变体的C末端切割分析
  • 2.4.4 OsAtg8及其突变体与OsAtg4的相互作用分析
  • 2.5 结果
  • 2.5.1 OsAtg8和OsAtg4的克隆及序列分析
  • 2.5.2 同源性比较分析
  • 2.5.3 OsAtg8和OsAtg4基因的组织表达分析
  • 2.5.4 OsAtg8及其突变体C末端切割反应研究
  • 2.5.5 OsAtg8及其突变体与OsAtg4的相互作用分析
  • 2.6 讨论
  • 参考文献
  • 缩写词表
  • 致谢
  • 博士期间发表的论文
  • 相关论文文献

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