信号标签突变论文-耿士忠,郭荣显,焦新安

信号标签突变论文-耿士忠,郭荣显,焦新安

导读:本文包含了信号标签突变论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:鸡白痢沙门菌,转座子,毒力相关基因,标签

信号标签突变论文文献综述

耿士忠,郭荣显,焦新安[1](2014)在《鸡白痢沙门菌转座子信号标签突变库的构建及毒力相关基因的筛选》一文中研究指出引言鸡白痢是由鸡白痢沙门菌引起的一种常见传染性疾病,目前,对该病原菌易引起持续感染、垂直传播和免疫逃避等问题的认识尚有不足,进一步研究鸡白痢沙门菌感染与致病机制,寻找防治该病的药物和疫苗新靶点,是预防和控制鸡白痢的工作重点。信号标签突变技术(Signature-tagged mutagenesis,STM)是一种用来鉴定病原体在宿主体内存活和复制的决定性基因的有效手段,并且随着信号标签和(本文来源于《中国畜牧兽医学会2014年学术年会论文集》期刊2014-11-08)

赫明雷,刘慧芳,刘思国,司薇,王春来[2](2009)在《猪胸膜肺炎放线杆菌血清1型信号标签诱导突变体库的构建》一文中研究指出本研究以自杀性质粒pUT携带含有信号标签的Mini-Tn5转座子对猪胸膜肺炎放线杆菌血清1型菌进行转座诱变,构建了带有12对特异性信号标签的Mini-Tn5转座子的pUT自杀质粒,转化到供体菌E.coliβ2155后,利用双亲本滤膜杂交法与受体猪胸膜肺炎放线杆菌血清1型菌(APP1)进行接合转移,构建并优化了接合转移体系。利用抗性和营养缺陷培养平板筛选得到接合突变体,通过抗性通用引物与12个特异标签引物和胸膜肺炎放线杆菌毒素IV(ApxIV)鉴定引物分别对这些突变体进行了PCR鉴定和测序验证。结果表明,经过加入标签的Mini-Tn5转座子可以通过接合转移的方式从供体菌E.coliβ2155中插入到APP1基因组当中,并成功构建了12个含有特异信号标签的重组质粒,获得了APP1的12个转座突变体库,经筛选鉴定后得到561个突变株。这为研究APP1的功能基因和筛选特定突变株提供了必要的基础。(本文来源于《中国动物传染病学报》期刊2009年01期)

陈静园[3](2009)在《幽门螺杆菌ArsRS信号标签突变体的构建及STM文库构建方法的研究》一文中研究指出目前,全球约50%的人口感染幽门螺杆菌(H.pylori),我国人口感染率高于世界平均水平,为50~70%。世界卫生组织已将幽门螺杆菌列为第一类致癌因子,明确其为胃癌的危险因素。因此,抗幽门螺杆菌感染的控制和治疗是我们面临的重要医疗和社会问题。随着H pylori根除治疗中抗生素的广泛应用,H.pylori的耐药问题突出。对于耐药基因的鉴定,长期以来多以药靶基因和药物代谢相关基因的分析为主,如:H.pylori对克拉霉素的耐药性与克拉霉素的作用位点23S rRNA基因(A2142G、A2143G)突变有关;H.pylori对甲硝唑耐药是由于rdxA基因的突变失活,而rdxA基因编码NADPH硝基还原酶,能使甲硝唑还原而生成具有杀菌活性的代谢产物。但这种方法不能全面发现耐药相关基因及其机制。因此新的耐药性分析的方法和药物靶点的发现,是目前急需解决的重要课题。信号标签突变技术(STM)能够高通量筛选病原微生物的毒力相关基因,自1995年由Holden及其同事建立起来,该技术已用于十多种病原微生物的致病基因的研究,它是通过用病原体全基因组随机插入的突变体在动物体内进行高通量筛选,从而对病原体的毒力基因进行鉴定的一种负向筛选方法。其理论基础是:如果在与病原体致病过程有关的毒力基因中插入转座子,产生的突变体就会由于毒力基因的插入失活而无法引起持续性感染,结果不能在宿主体内存活下来。通过突变体库感染宿主,然后对存活下来的突变体进行负筛选就可鉴定出病原体的毒力相关基因。这种高通量筛选方法不仅是筛选鉴定致病相关基因的有力手段,而且是筛选耐药基因以及各种特定功能相关基因的有效方法。双组分系统是大部份细菌赋有的精密的信号传导系统,由组氨酸蛋白激酶(HPK)和效应调节蛋白(RR)两个组分组成,其功能是感知环境变化并产生适当的细胞反应,使之更好的适应外界环境变化。研究表明,H pylori ArsRS双组分系统是H pylori能够在胃黏膜内长期定植的最重要原因之一。因此,我们认为ArsRS双组分系统可能与H pylori耐药有一定关系。在ArsRS双组分系统中,酸敏感的组氨酸激酶ArsS(H pylori0165)及其反应元件ArsR(H pylori0166)调控着H pylori的大部分耐酸性基因:ureABEFGHI、α碳酸酐酶(CA)、NiKR、NixA、hypB、hypA、HspA、Fur、aspA;动力性基因:flaABEGH;毒力基因cagA等,而这些基因是H pylori生长繁殖、致病、耐药的关键,对这些基因的调控系统——ArsRS的研究有助于我们对H pylori致病及耐药机制更进一步的认识。在本实验中,我们用带有标签的重组质粒替代转座子,通过PCR扩增ArsS、ArsR基因片段,扩增产物分别克隆于载体pID700A1中,化学法转化感受态大肠杆菌E.coli DH5α;然后将重组载体经电转化法转化幽门螺杆菌标准菌株,通过重组质粒插入失活,成功构建了ArsS和ArsR突变株。我们通过在不同PH值的培养基上比较突变株与野生株的的生长情况,发现ArsS、ArsR基因缺失会对幽门螺杆菌生长活性产生影响:当PH值为7.0时,突变株克隆数与野生株克隆数无明显差异,随着PH值的逐渐降低,当PH在6.0、5.0和4.0时,ArsS、ArsR突变株克隆数随着PH值的逐渐降低而明显减少,而野生株克隆数的变化则不明显。我们还惊奇地发现,ArsS、ArsR突变株对药物的敏感性明显高于野生株,说明ArsSR双组分系统可能与Hp耐药具有一定关系。在ArsS、ArsR突变株构建方法建立的基础上,我们以四种限制性内切酶酶切方法获得了Hp DNA 300-500bp片段,克隆入pID700系列载体,经电转化Hp,以抗生素筛选得到了70个幽门螺杆菌突变菌株,成功建立了Hp STM突变株文库构建方法,为进一步大规模构建H.pylori突变体文库和鉴定H.pylori耐药相关基因奠定了基础。(本文来源于《第四军医大学》期刊2009-04-01)

商霖,李薇,李良军,黎璐,张四化[4](2008)在《胸膜肺炎放线杆菌萘啶酸抗性菌株的选育和信号标签突变株的构建》一文中研究指出胸膜肺炎放线杆菌(APP)是重要的猪呼吸道病原菌,给世界养猪业造成严重的经济损失。信号标签突变(STM)技术是在宿主动物体内鉴定病原菌毒力因子的高通量方法。通过体外传代选育出APP血清1型和3型萘啶酸抗性菌株,再以萘啶酸抗性菌株为受体菌,以携带mini-Tn10的标签质粒(pLOF/TAG1-48)的E.coliCC118λpir或S17-1λpir为供体菌,在或不在E.coliDH5α(pRK2073)的辅助下,进行叁亲本或两亲本接合,通过抗性筛选、PCR和Southern杂交鉴定转座突变株。结果表明:体外萘啶酸加压传代很容易选育出萘啶酸抗性APP菌株,该抗性的产生与DNA促旋酶A亚基基因gyrA的突变有关。在APP与E.coli接合实验中,两亲本接合比叁亲本接合操作更简单,效率也较高;APP不同菌株在接合和转座效率上存在很大差异,血清1型菌株高于血清3型菌株,3型标准菌株高于地方分离株JL03-R。本研究为APPSTM突变体库的构建与毒力基因的鉴定奠定了基础。(本文来源于《微生物学报》期刊2008年01期)

商霖[5](2007)在《胸膜肺炎放线杆菌萘啶酸抗性菌株的选育和信号标签突变株的构建》一文中研究指出胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae,APP)是猪传染性胸膜肺炎(porcine contagious pleuropneumonia,PCP)的病原菌,引起猪的一种高度接触传染性呼吸道疾病,给世界养猪业造成严重的经济损失。该病分最急性、急性和慢性叁种:最急性或急性以肺部广泛出血为特征,可造成猪急性死亡;慢性以肺部局灶性坏死和胸膜炎为特征,会导致猪生长缓慢,饲料报酬降低。预防和控制该病的主要措施是疫苗免疫接种。但由于APP血清型众多,而且各血清型之间交叉保护力较低,再则该病传染性很强,给应用传统疫苗对该病进行免疫预防带来了极大的困难。人们采取了各种灭活疫苗、亚单位疫苗的免疫措施和方法来控制和预防该病,但效果均不是十分理想。因此,迫切需要更安全、高效的新型疫苗来预防和控制该传染病的发生与流行。而毒力因子的全面鉴定是病原菌致病机理研究和防治产品开发的基础。信号标签诱变(signature-tagged mutagenesis,STM)技术是由Holden等人于1995年建立的一种鉴定病原菌毒力基因的高通量方法。它是以整个基因组为基础的研究病原体致病机制,可在体内对毒力基因进行高通量筛选的一种新方法。近几年应用该技术已对十多种病原微生物进行了筛选。这些筛选中除了找到已知的毒力基因外,还都鉴定到了未知的毒力因子。本研究通过体外传代选育出APP血清1型和3型萘啶酸抗性菌株,再以萘啶酸抗性菌株为受体菌,以携带mini-Tn10的标签质粒(pLOF/TAG1-48)的E.coli CC118λpir或Sm17-1λpir为供体菌,在或不在E.coli DH5α(pRK2073)的辅助下,进行叁亲本或两亲本接合,通过抗性筛选、PCR和Southern杂交鉴定转座突变株。结果表明:体外萘啶酸加压传代很容易选育出萘啶酸抗性APP菌株,该抗性的产生与DNA促旋酶A亚基基因gyrA的突变有关。在APP与E.coli接合实验中,两亲本接合比叁亲本接合操作更简单,效率也较高;APP不同菌株在接合和转座效率上存在很大差异,血清1型菌株高于血清3型菌株,3型标准菌株高于地方分离株JL-03。本研究为APP的STM突变体库的构建与毒力基因的鉴定奠定了基础。(本文来源于《华中农业大学》期刊2007-06-01)

刘德松[6](2006)在《嗜肺军团菌血清10型信号标签诱变突变体文库构建》一文中研究指出目的: 本文通过PCR扩增特异信号标签,导入载体质粒pC6,构建信号标签诱变突变体文库穿梭质粒pC6RS;通过细菌结合配对时转座子的转座作用,使特异信号标签随机插入到嗜肺军团菌的基因组中,由此构建嗜肺军团菌血清10型信号标签诱变突变体文库,为筛选嗜肺军团菌血清10型毒力基因打下基础。包括二部分:1、信号标签诱变突变体文库穿梭质粒构建;2、嗜肺军团菌血清10型信号标签诱变突变体文库的建立。 方法: 实验一:信号标签诱变突变体文库穿梭质粒构建通过PCR扩增信号标签(signature tags,STs)片段,导入载体质粒pC6,构建重组质粒pC6RS,电穿孔转化到大肠杆菌CC118中,从CC118中提取重组质粒pC6RS后转化到大肠杆菌S17-1中,获得信号标签诱变突变体文库穿梭质粒。 实验二:嗜肺军团菌血清10型信号标签诱变突变体文库的建立 含重组质粒pC6RS的大肠杆菌S17-1与嗜肺军团茵L10结合配对,通过转座子的转座作用,将特意信号标签片段随机插入到军团菌的基因组中,通过营养依赖和抗性筛选建立嗜肺军团菌血清10型信号标签诱变突变体文库。 结果: 实验一:信号标签诱变突变体文库穿梭质粒构建通过PCR扩增信号标签(signature tags,STs)片段,导入载体pC6,构建重组质粒pC6RS,电穿孔转化(本文来源于《四川大学》期刊2006-04-01)

刘德松,王涛,陈建平,鲁芳,张雷[7](2006)在《信号标签诱变突变体文库穿梭质粒构建》一文中研究指出目的建立信号标签诱变突变体穿梭质粒,为构建信号标签诱变突变体文库及病原微生物毒力基因筛选打下基础。方法通过PCR扩增信号标签(signature tags,STs)片段,导入载体pC6,构建重组质粒pC6RS,转化到大肠杆菌CC118中,提取重组质粒后转化到大肠杆菌S17-1中。结果经过PCR、核苷酸序列测定鉴定,成功地构建了pC6RS质粒。(本文来源于《西部医学》期刊2006年01期)

姚潇,王恒梁,杨伯伦,史兆兴,冯尔玲[8](2003)在《志贺菌福氏2a信号标签诱变突变体文库的构建》一文中研究指出以合成的单链序列特异性标签为模板,通过PCR得到双链DNA标签并将其克隆到自杀质粒pUT-Tn5Km2的转座子中,转化大肠杆菌S17-1λpir;然后用经转化的S17-1λpir与福氏志贺菌2a2457T交配,挑出对氨苄青霉素敏感、对卡那霉素和萘啶酮酸抗性的菌落。结果表明构建了包含4376个福氏志贺菌突变体信号标签诱变文库,为进一步鉴定该病原体的毒力基因打下了基础。(本文来源于《生物技术通讯》期刊2003年01期)

信号标签突变论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

本研究以自杀性质粒pUT携带含有信号标签的Mini-Tn5转座子对猪胸膜肺炎放线杆菌血清1型菌进行转座诱变,构建了带有12对特异性信号标签的Mini-Tn5转座子的pUT自杀质粒,转化到供体菌E.coliβ2155后,利用双亲本滤膜杂交法与受体猪胸膜肺炎放线杆菌血清1型菌(APP1)进行接合转移,构建并优化了接合转移体系。利用抗性和营养缺陷培养平板筛选得到接合突变体,通过抗性通用引物与12个特异标签引物和胸膜肺炎放线杆菌毒素IV(ApxIV)鉴定引物分别对这些突变体进行了PCR鉴定和测序验证。结果表明,经过加入标签的Mini-Tn5转座子可以通过接合转移的方式从供体菌E.coliβ2155中插入到APP1基因组当中,并成功构建了12个含有特异信号标签的重组质粒,获得了APP1的12个转座突变体库,经筛选鉴定后得到561个突变株。这为研究APP1的功能基因和筛选特定突变株提供了必要的基础。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

信号标签突变论文参考文献

[1].耿士忠,郭荣显,焦新安.鸡白痢沙门菌转座子信号标签突变库的构建及毒力相关基因的筛选[C].中国畜牧兽医学会2014年学术年会论文集.2014

[2].赫明雷,刘慧芳,刘思国,司薇,王春来.猪胸膜肺炎放线杆菌血清1型信号标签诱导突变体库的构建[J].中国动物传染病学报.2009

[3].陈静园.幽门螺杆菌ArsRS信号标签突变体的构建及STM文库构建方法的研究[D].第四军医大学.2009

[4].商霖,李薇,李良军,黎璐,张四化.胸膜肺炎放线杆菌萘啶酸抗性菌株的选育和信号标签突变株的构建[J].微生物学报.2008

[5].商霖.胸膜肺炎放线杆菌萘啶酸抗性菌株的选育和信号标签突变株的构建[D].华中农业大学.2007

[6].刘德松.嗜肺军团菌血清10型信号标签诱变突变体文库构建[D].四川大学.2006

[7].刘德松,王涛,陈建平,鲁芳,张雷.信号标签诱变突变体文库穿梭质粒构建[J].西部医学.2006

[8].姚潇,王恒梁,杨伯伦,史兆兴,冯尔玲.志贺菌福氏2a信号标签诱变突变体文库的构建[J].生物技术通讯.2003

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