吉林省大豆推广品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性评价

论文摘要

优良品种是作物获得高产的基础,而品种混杂和纯度降低会明显降低产量,快速准确地鉴定品种和进行纯度分析对于种子质量标准化、品种审定、种性辨别、产权保护均有重要作用。种质资源的遗传多样性及亲缘关系信息是育种工作的基础,对优良品种的遗传多样性进行准确的评价可以为亲本选配、后代遗传变异程度及杂种优势水平的预测提供预见性指导,这是育种目标能否成功实现的关键。本研究选取89个吉林省广泛推广的大豆品种,利用SSR分子标记构建其DNA指纹图谱,从分子水平分析其遗传多样性,为今后的育种工作提供参考。本研究获得的主要结果如下:1.确定了最适的SSR反应体系:即反应体系25μl,包括模板DNA约40ng,引物0.5umol,dNTPs 0.4mmol,10×buffer 2.5μl,TaqDNA聚合酶1.5u,其余用ddH2O补足。扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性45s,55℃复性45s,72℃延伸1min,40个循环;最后一次延伸温度为72℃10min。l2.通过20对多态性引物的鉴别结果,引物satt586与引物satt530的鉴别效率最高,能鉴别5个品种;satt002能鉴别4个品种;sct188能鉴别3个品种。引物satt586、satt530、sct188等的Shannon值均在1.35以上,在大豆品种鉴别和纯度鉴定时可优先使用。3.20对SSR引物共扩增出出110个等位基因变异,平均每对引物扩增出5.5个等位变异。引物satt586、satt329的等位变异最多为10,satt022等位变异最少为3个。每个SSR位点的Shannon指数的分布范围为0.7068-2.1225,平均值为1.3193,指数最大的是引物satt586,其次为satt239。4.供试品种间遗传相似系数的变化范围为0.385-0.936,总体平均值为0.672,相似系数较大,品种间遗传差异较小。各组群间以中以吉育号品种（组群1）与吉农号品种（组群2）遗传遗传距离（0.2312）最近。吉育号品种（组群1）与九农号品种（组群4）遗传距离（0.6216）最远。5.基于SSR标记的数据结果,对供试品种进行聚类分析,供试品种分为三个类群和一个特殊品种。简称为SGs（SSR-based Groups）:SGⅠ包括71个品种,SGⅡ包括9个品种,SGⅢ包括8个品种,特殊品种为白农9号。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1.前言
• 1.1 分子标记及其分类
• 1.1.1 基于DNA-DNA杂交的DNA标记
• 1.1.2 基于PCR技术的DNA标记
• 1.1.3 简单重复序列SSR标记技术
• 1.2 SSR技术在研究中的应用
• 1.2.1 品种鉴定
• 1.2.2 遗传多样性分析
• 1.2.3 构建大豆分子遗传图谱
• 1.2.4 分子辅助标记育种
• 1.3 本文研究的背景、目的和意义
• 2.材料与方法
• 2.1 供试材料
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 DNA提取
• 2.2.2 SSR-PCR体系优化
• 2.2.3 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
• 2.3 数据处理分析
• 3.结果与分析
• 3.1 大豆DNA的提取
• 3.2 大豆SSR反应体系及扩增程序的建立
• 3.2.1 引物浓度对SSR扩增的影响
• 3.2.2 模板DNA浓度对SSR扩增的影响
• 3.2.3 TaqDNA聚合酶用量对SSR扩增的影响
• 3.2.4 dNTPs浓度对SSR扩增的影响
• 3.3 引物筛选
• 3.4 吉林省大豆推广品种DNA指纹图谱的构建
• 3.5 SSR分子标记检测结果
• 3.6 遗传多样性分析
• 3.6.1 组群的遗传结构
• 3.6.2 供试品种遗传多样性
• 3.7 聚类分析
• 4.讨论
• 4.1 DNA的提取
• 4.2 SSR反应条件的建立及应注意的问题
• 4.3 PAGE凝胶电泳条件的建立及应注意的问题
• 4.3.1 PCR样品变性
• 4.3.2 制胶及涂板
• 4.3.3 预电泳
• 4.3.4 银染
• 4.4 分子标记在大DNA指纹图谱构建中的应用
• 4.5 基于SSR的吉林省大豆推广品种遗传多样性研究
• 4.6 吉林省大豆推广品种DNA指纹图谱的应用
• 5.结论
• 参考文献
• 附录
• 致谢