本文主要研究内容
作者胡健,朱海湾,毛伊敏（2019）在《基于时序加权PPI网络的关键蛋白质识别》一文中研究指出：关键蛋白质是生物体内一切生命活动中不可缺少的物质基础,关键蛋白质的识别不仅可以从理论上理解生命活动机理,同时在实际应用中为药物研制、疾病治疗提供重要基础。目前,现有的关键蛋白质识别算法大多应用在静态PPI网络上,忽略了蛋白质的动态性和保守性,只考虑网络拓扑结构,忽略了蛋白质的生物特性,并且未能完全解决PPI网络中假阳性和假阴性问题。针对以上问题,构建一种混合动态保守蛋白质的时序加权PPI网络,并提出一种名为JTBC(Joint Topological properties,Biological properties and Complexes information)的关键蛋白质识别算法。利用基因表达数据提取动态蛋白质和保守蛋白质的活性信息,以动态调整静态PPI网络进而构建时序PPI网络,有效降低了PPI网络中的假阴性;设计一种融合双重拓扑特性的点边凝聚度DEcc(node and edge cohesion coefficient),以衡量蛋白质在PPI网络中的拓扑特性,再结合带有生物特性的蛋白质结构域信息和皮尔逊相关系数为时序PPI网络加权,以准确描述蛋白质之间的相互作用,减少了假阳性的影响;根据关键蛋白质的聚集特性和共表达特性,设计一种共表达复合物中心性方法局部评估蛋白质的重要程度。综上考虑,整合权重信息和蛋白质复合物信息来综合衡量蛋白质的关键性。实验结果表明该算法能够从全局和局部特性较准确地识别关键蛋白质。
Abstract
guan jian dan bai zhi shi sheng wu ti nei yi qie sheng ming huo dong zhong bu ke que shao de wu zhi ji chu ,guan jian dan bai zhi de shi bie bu jin ke yi cong li lun shang li jie sheng ming huo dong ji li ,tong shi zai shi ji ying yong zhong wei yao wu yan zhi 、ji bing zhi liao di gong chong yao ji chu 。mu qian ,xian you de guan jian dan bai zhi shi bie suan fa da duo ying yong zai jing tai PPIwang lao shang ,hu lve le dan bai zhi de dong tai xing he bao shou xing ,zhi kao lv wang lao ta pu jie gou ,hu lve le dan bai zhi de sheng wu te xing ,bing ju wei neng wan quan jie jue PPIwang lao zhong jia yang xing he jia yin xing wen ti 。zhen dui yi shang wen ti ,gou jian yi chong hun ge dong tai bao shou dan bai zhi de shi xu jia quan PPIwang lao ,bing di chu yi chong ming wei JTBC(Joint Topological properties,Biological properties and Complexes information)de guan jian dan bai zhi shi bie suan fa 。li yong ji yin biao da shu ju di qu dong tai dan bai zhi he bao shou dan bai zhi de huo xing xin xi ,yi dong tai diao zheng jing tai PPIwang lao jin er gou jian shi xu PPIwang lao ,you xiao jiang di le PPIwang lao zhong de jia yin xing ;she ji yi chong rong ge shuang chong ta pu te xing de dian bian ning ju du DEcc(node and edge cohesion coefficient),yi heng liang dan bai zhi zai PPIwang lao zhong de ta pu te xing ,zai jie ge dai you sheng wu te xing de dan bai zhi jie gou yu xin xi he pi er xun xiang guan ji shu wei shi xu PPIwang lao jia quan ,yi zhun que miao shu dan bai zhi zhi jian de xiang hu zuo yong ,jian shao le jia yang xing de ying xiang ;gen ju guan jian dan bai zhi de ju ji te xing he gong biao da te xing ,she ji yi chong gong biao da fu ge wu zhong xin xing fang fa ju bu ping gu dan bai zhi de chong yao cheng du 。zeng shang kao lv ,zheng ge quan chong xin xi he dan bai zhi fu ge wu xin xi lai zeng ge heng liang dan bai zhi de guan jian xing 。shi yan jie guo biao ming gai suan fa neng gou cong quan ju he ju bu te xing jiao zhun que de shi bie guan jian dan bai zhi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自计算机工程与应用的胡健,朱海湾,毛伊敏，发表于刊物计算机工程与应用2019年23期论文，是一篇关于关键蛋白质论文,保守蛋白质论文,蛋白质结构域论文,共表达复合物中心性论文,计算机工程与应用2019年23期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自计算机工程与应用2019年23期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：关键蛋白质论文; 保守蛋白质论文; 蛋白质结构域论文; 共表达复合物中心性论文; 计算机工程与应用2019年23期论文;