鹅PRL基因5’端调控区克隆、SNPs检测及与产蛋性能的关系

鹅PRL基因5’端调控区克隆、SNPs检测及与产蛋性能的关系

论文摘要

动物垂体前叶分泌的催乳素(Prolactin,PRL)具有广泛的生理效应,在家禽中PRL主要与就巢和繁殖性能有重要关联。我国地方禽种强就巢性是其产蛋量低的主要因素之一。禽类血浆PRL水平上升与就巢行为的起始和维持具有密切的相关性。本研究以中国优良的地方鹅种皖西白鹅(n=200)和引入的莱茵鹅(n=80)作为研究素材,将PRL基因作为产蛋量性状的候选基因,通过比较基因组学方法,应用Dnastar和Primer Premier 5.0软件,设计了1对引物对鹅PRL基因的5’调控区序列进行克隆测序。运用PCR-SSCP技术对鹅PRL基因外显子2和5’调控区序列片段分别进行多态性分析并结合测序,检测其基因突变位点,并分析基因型及与鹅产蛋性能的相关性。克隆了鹅PRL基因5’调控区的部分序列(GenBank登录号:EF190486)。序列比较分析表明,与家鸡的同源性为73%,与Ceylon jungle fowl(锡兰原鸡)和日本鹌鹑的同源性分别为78%和69%,各物种之间调控区序列变异比较大。在鹅PRL基因5’调控区发现3个SNP,即A-401G、G-268A和T-266A。应用TFSEARCHver1.3软件对PRL基因5’调控区潜在的调控元件和蛋白结合因子预测发现:在-401位没有转录结合因子,发生A-401G突变后仍然没有结合因子。在发生G-268A和T-266A突变前,有转录结合因子GATA-2和GATA-1,但是突变后这两个结合因子全部消失。经分析表明三个碱基突变为连锁变异,对基因的表达调控可能发挥调节作用。皖西白鹅P2引物扩增获得2个等位基因,频率分别为0.7275和0.2725,三种基因型(AA、AB和BB)的频率分别为0.615、0.225和0.16;E2引物扩增的两个等位基因频率分别为0.665和0.335。莱茵鹅P2引物扩增获得2个等位基因,频率分别为0.6688和0.3312,三种基因型的频率分别为0.5625、0.2125和0.225;E2引物扩增的两等位基因频率分别为0.6125和0.3875。?2检验表明,两个鹅群在P2和E2检测位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态。对鹅早期产蛋性能与各多态位点的基因型进行关联分析,结果显示,PRL基因5’调控区碱基突变对皖西白鹅产蛋量有影响,表现为AA型产蛋量显著低于AB型和BB型(P<0.05)。PRL基因外显子2碱基突变对鹅的开产蛋重有影响,表现为皖西白鹅CC基因型开产蛋重显著(P<0.05)小于CD型和DD型;莱茵鹅EE基因型开产蛋重显著(P<0.05)小于EF型和FF型。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 目录
  • 本论文中所用缩略词
  • 文献综述
  • 1 催乳素的研究进展
  • 1.1 催乳素的结构
  • 1.2 催乳素的生理功能
  • 2 催乳素基因结构及其表达调控
  • 2.1 催乳素基因结构
  • 2.2 催乳素基因表达调控
  • 引言
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试验材料
  • 1.1.1 试验样本
  • 1.1.2 主要仪器设备
  • 1.1.3 药品和酶
  • 1.1.4 常规溶液及试剂配制
  • 1.1.5 菌株和载体
  • 1.1.6 分析工具软件
  • 1.2 实验方法
  • 1.2.1 DNA提取
  • 1.2.2 引物设计
  • 1.2.3 最佳PCR条件的建立
  • 1.2.4 琼脂糖凝胶电泳检测
  • 1.2.5 单链构像多态性检测(SSCP)
  • 1.2.6 PRL基因序列克隆和测序
  • 1.2.7 数据统计分析方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 鹅PRL基因5'端调控区序列的克隆与测序
  • 2.1.1 鹅PRL基因5'端调控区序列的PCR扩增结果
  • 2.1.2 鹅PRL基因5'端调控区序列的测定及与鸡等同源性比较
  • 2.2 PRL基因的多态性分析
  • 2.2.1 分段的鹅PRL基因5'端调控区序列PCR扩增
  • 2.2.2 鹅PRL基因外显子2序列的PCR扩增
  • 2.2.3 鹅PRL基因5'端调控区序列SSCP检测结果
  • 2.2.4 鹅PRL基因外显子2的SSCP检测结果
  • 2.2.5 有多态性序列的测序
  • 2.3 PRL基因5'区潜在的调控元件及蛋白结合位点的预测
  • 2.4 PRL基因群体遗传学分析
  • 2.4.1 PRL基因频率和基因型频率
  • 2.4.2 PRL基因Hardy—Weinber9平衡检验
  • 2.5 鹅PRL基因变异与产蛋性能的关系
  • 3 讨论
  • 3.1 鹅PRL基因5'端调控区序列比较分析
  • 3.2 鹅PRL基因突变及其多态性分析
  • 3.3 与催乳素基因5'调控区多态位点结合的转录因子
  • 3.4 PRL基因群体遗传结构分析
  • 3.5 PRL基因与部分产蛋性状的关联性分析
  • 4 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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