论文题目: 我国禽流感的流行病学调查——1、高致病性禽流感时空分布规律的初步研究 2、禽流感病毒生态分布和流行现状的调查研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 预防兽医学
作者: 崔尚金
导师: 孔宪刚
关键词: 禽流感,流行病学,时空分布,生态分布,分子进化
文献来源: 中国农业科学院
发表年度: 2005
论文摘要: 本文在调查、分析禽流感发生情况以及影响疫情相关因素的基础上，针对我国野鸟迁徙的2条主要路线，对我国禽流感病毒生态分布和禽流感流行现状的研究，对爆发高致病禽流感疫区的自主活动鸟类禽流感的血清学调查与分析，对黑龙江省部分地区散养畜禽流感病毒感染的血清学调查与分析，并对鹅源H5N1亚型禽流感病毒新疆分离株A／Goose／XJYL／10／2003HA基因的克隆和序列测定与分析，对H5N1亚型禽流感病毒新疆株NS基因的克隆和序列分析。在此基础上，对禽流感发生的流行病学分析，对高致病性禽流感时空分布规律的初步研究，从而初步建立了高致病禽流感传播的风险评估框架，分析并构建了温度对我国禽流感传播影响的时空模式，建立了禽流感免疫与流行的生物数学模型初析。本文的主要结论是：1．禽流感的发生和流行有其必然的因素，多发生在水多、鸟多、林子多以及野鸟迁徙地及其周边生态环境。2．对高致病性禽流感时空分布规律的初步研究，初步建立了高致病禽流感传播的风险评估框架。3．对2004年我国发生禽流感时的气温进行了研究，研究结果显示风险区域随时间变化而转移，其时空模式为：1—5月，风险区域从南向北迁移：6—8月，除青藏高原外，全国基本处于低风险；9—12月，从北向南迁移。其时空转移规律与2004年第一季度的禽流感疫情扩散趋势基本吻合。4．建立了禽流感免疫与流行的生物数学模型初析。5．对爆发高致病禽流感疫区的自主活动鸟类禽流感的血清学调查与分析，结果提示我们，对我国野生生态系禽流感病毒的监测是预警、预报我国家禽流感爆发的有效途径，也是十分必要的，同时血清学的检测结果为我们进一步的分子水平的分析研究提供了明确的靶向。6．对黑龙江省部分地区散养畜禽流感病毒感染的血清学调查与分析，试验检测结果表明，在黑龙江省的畜禽养殖中，尤其是猪与家禽当中，存在流感病毒的传播，在水禽、鸡群中有H5亚型流感病毒存在，在猪群中H9亚型流感病毒感染与流行。7．对鹅源H5N1亚型禽流感病毒新疆分离株A／Goose／XJYL／10／2003HA基因的克隆和序列测定与分析，分析结果表明，本试验株与广东、香港和东南亚等不同地区的H5N1禽流感病毒HA的核甘酸序列的同源率很高，其氨基酸切割位点附近具有高致病性禽流感病毒的特征。系统进化树分析表明，新疆株为独立分支，属于欧亚种系。8．对H5N1亚型禽流感病毒新疆株NS基因的克隆和序列分析，序列分析结果表明，新疆毒株间的核甘酸同源率为97.8％-98.9％，氨基酸同源率为96.5％-98.7％，与广东、香港和东南亚等不同地区的11个毒株比较，同源率在90.0％-99.4％之间。与来自野禽、猪等不同种类的11个流感毒株比较，同源率在81.4％-99.3％之间。系统进化分析表明，新疆株独立分支。9．对1株环志鸟H5N1亚型禽流感病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)基因进行扩增、克隆和序列测定。结果表明，HA基因全长1707bp，编码568个氨基酸，NA基因全长1350bp，编码446个氨基酸。HA基因有7个糖基化位点，在裂解位点附近有连续6个碱性氨基酸的插入；NA基因有3个糖基化位点。结果证实了野鸟中存在高致病力禽流感病毒。
论文目录:
内容摘要
Abstract
一、文献综述
(一)、流感病毒的研究进展
1.流感的历史
1.1 流感的历史概述
1.1.1 西班牙流感
1.1.2 亚洲流感
1.1.3 香港流感
1.1.4 俄国流感
1.1.5 香港97年流感事件
1.1.6 近年流感事件
1.1.7 青海候鸟流感事件
1.2 禽流感的历史
1.2.1 病原
1.2.2 高致病力禽流感(High Pathogenic Avian Influenza,HPAI)
1.2.3 低致病力禽流感(Low Pathogenic Avian Influenza,LPAI)
1.2.4 LPAIV向HPAIV的转变
2 流感病毒的宿主范围
3 A型流感病毒在宿主中的存在和传播方式
3.1 水禽
3.2 哺乳动物
3.2.1 猪
3.2.2 马
3.2.3 海洋哺乳动物
3.2.4 人
4 产生导致人流感大流行的病毒的可能机制
4.1 猪作为中间宿主
4.2 AIV直接传播给人
5.流感病毒的基因库
6.流感病毒的分子生物学特性
6.1 流感病毒基因组的结构及其编码蛋白的功能
6.1.1 聚合酶蛋白(Polymerase)
6.1.2 血凝素(Hemagglutinin,HA)
6.1.2.1 HA的结构和功能
6.1.2.2 HA的裂解与流感病毒致病性的关系
6.1.3 核蛋白(Nucleoprotein,NP)
6.1.4 神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)
6.1.5 基质蛋白(Matrix Protein,M)
6.1.6 非结构蛋白(Nonstructural Protein,NS)
6.2 病毒的复制
6.3 流感病毒的抗原性变异
7.不同宿主流感病毒的分子标志
7.1 HA基因的作用
7.2 NA基因的作用
7.3 其它基因的作用
8.结语
(二)、流感病毒的生态分布及流行病学
1、动物流感病毒在自然界的分布与进化
1.1 禽流感病毒
1.2 猪流感病毒
1.3 马流感病毒
2、动物流感病毒流行病学
2.1 禽流感
2.2 猪流感
2.3 马流感
3、流感病毒的监测
3.1 我国人类流感的监测网络及作用
3.1.1 监测网络目的
3.1.2 内容
3.1.3 步骤与方法
3.1.4 职责分工
3.1.5 结果与评价
3.2 动物流感监测网络建设及其意义
3.3 流感病毒流行趋势预测
二 理论分析——禽流感发生的流行病学分析
1 禽流感的流行特点
1.1 流感病毒亚型多,分多节断,易变异和重组,从而容易出现新病毒
1.2 流感宿主谱广,野禽居多
2、禽类的免疫
2.1 野禽免疫系统特点
2.2 疫苗的应用
3.环境因素
3.1 南方的生态环境 水多、鸟多、林子多,野鸟迁徙地
3.2 饲养方式
3.3 气候和季节
4.今后采取的措施
4.1 使土地、空气等环境载体承受适当的消化能力
4.2 改变养殖方式
4.3 正确面对野鸟
4.4 主动监测和预警预报
三、高致病禽流感时空分布规律研究
(一) 传播的风险评估框架的初步建立
1 高致病性禽流感传播风险评估指标体系的确定
1.1 确定高致病性禽流感传播风险因素的基本原则
1.2 高致病性禽流感传播风险评估指标体系及说明
2 高致病性禽流感传播风险评估指标的评价标准
3 高致病性禽流感风险评估指标权重的确定
3.1 建立层次结构模型
3.2 构造判断矩阵
3.3 层次单排序及其一致性检验
3.4 层次总排序及其一致性检验
4 综合评分方法
5 数据采集方法
6 结论
(二) 温度对我国禽流感传播影响的时空模式分析
1 前言
2 材料与方法
2.1 计算机环境
2.2 气温数据校正和标准化
2.3 气温数据库的建立
2.4 禽流感传播气温风险评估标准的建立
2.5 用EpiGeoInfo绘制禽流感传播风险图
3 结果
4 讨论
(三) 禽流感免疫与流行的生物数学模型初析
四、我国禽流感病毒生态分布和禽流感流行现状的研究
(一) 爆发高致病禽流感疫区的自主活动鸟类禽流感及新城疫的血清学调查与分析
摘要
1 前言
2 材料与方法
2.1 材料
2.2 方法
3 结果与分析
4 讨论
(二) 黑龙江省部分地区散养畜禽流感病毒感染的血清学调查与分析
摘要
1 前言
2、材料与方法
2.1 材料
2.2 方法
3 结果
4 讨论
(三) 鹅源H5N1亚型禽流感病毒新疆分离株A/Goose/XJYL/10/2003HA基因的克隆和序列测定与分析
摘要:
1 材料和方法
1.1 毒株
1.2 鸡胚
1.3 菌株
1.4 质粒载体
1.5 试剂盒
1.6 主要试剂
1.7 引物
1.8 病毒RNA的提取
1.9 HA基因的RT-PCR扩增
1.10 目的基因的克隆
1.11 重组质粒的PCR鉴定
1.12 目的基因的测序
1.13 序列分析
2 结果
2.1 RT-PCR扩增
2.2 重组质粒的鉴定
2.3 HA基因的序列测定和序列分析
3 讨论
(四) H5N1亚型禽流感病毒新疆株NS基因的克隆和序列分析
摘要
1 材料和方法
1.1 毒株
1.2 鸡胚
1.3 菌株
1.4 质粒载体
1.5 试剂盒
1.6 主要试剂
1.7 引物
1.8 病毒RNA的提取
1.9 NS基因的RT-PCR扩增
1.10 目的基因的克隆
1.11 重组质粒的PCR鉴定
1.12 目的基因的测序
1.13 序列分析
2 结果
3 讨论
(五) 环志鸟H5N1亚型禽流感病毒株的HA和NA基因特征性分析
摘要
1 材料和方法
2 结果
3 讨论
结论
致谢
参考文献
博士生期间发表的学术论文,专著
博士后期间发表的学术论文,专著
个人简历
联系地址
永久通信地址
发布时间: 2007-09-18
参考文献
- [1].H5N1禽流感病毒小鼠致病性的分子基础[D]. 璩骁.武汉大学2015
- [2].高致病性H5N1禽流感病毒PA与宿主相互作用蛋白的筛选、鉴定及功能分析[D]. 高照.扬州大学2018
- [3].鸭源禽流感病毒的分离鉴定及其聚合酶活性研究[D]. 王军政.吉林农业大学2015
- [4].宁夏禽流感流行病学调查及病毒HA基因遗传进化分析[D]. 李知新.甘肃农业大学2017
- [5].华东地区家鸭中不同HA亚型禽流感病毒的分布以及从家养水禽和鸡中分离的H5亚型禽流感病毒HA基因的分子流行病学[D]. 钱忠明.扬州大学2004
- [6].用不同鸡痘病毒载体构建单表达或双表达抗H5和H9亚型禽流感的重组疫苗及其免疫效力[D]. 陈素娟.扬州大学2005
- [7].中国H9N2亚型禽流感病毒进化分析与H5N1亚型禽流感病毒标记疫苗的研究[D]. 李呈军.中国农业科学院2005
- [8].H9亚型禽流感病毒抗独特型抗体的研制与其免疫原性的初步分析[D]. 李宝全.山东农业大学2005
- [9].禽流感病毒ELISA快速检测试剂盒的研制及其重组核蛋白粘膜免疫研究[D]. 肖运才.华中农业大学2005
- [10].禽流感病毒重组蛋白粘膜免疫研究及NP-ELISA抗体检测方法的建立[D]. 吴仁蔚.华中农业大学2006
相关论文
- [1].我国部分地区猪流感病毒分子流行病学及致病性研究[D]. 祁贤.南京农业大学2006
- [2].中国部分地区猪流感病毒的分子流行病学研究[D]. 于海.中国农业科学院2008