绵羊Leptin基因与部分经济性状的遗传相关性研究

绵羊Leptin基因与部分经济性状的遗传相关性研究

论文摘要

本研究以蒙古羊、滩羊、小尾寒羊和欧拉型藏羊为研究对象,选取瘦素蛋白基因(Leptin)作为候选基因,利用6个位点对其进行遗传多样性研究,同时研究其作为候选基因对生产性状进行分子标记的可行性,得到如下结果:1.根据已公布的绵羊Leptin基因序列,分别在第三外显子,第二内含子和3’非翻译区筛选6个位点设计引物,并进行PCR扩增,均得到了特异性扩增结果。经检测L1、L2、L3和L4,4个位点存在多态性,均为三个基因型AA、AB和BB型,其中AA型为野生型,AB型为杂合子,BB型为突变基因型。L1位点BB型在404bp处有一突变,为G—A突变; L2位点BB型在103bp处有一突变,为G—T突变; L3位点BB型在162bp处有一突变,为A—G突变; L4位点BB型在268bp处有一突变,为G—A突变;4个群体在4个位点上的有效等位基因数小于实际观察等位基因数。2.本试验对4个多态位点进行基因频率卡方检验,发现L1位点只有在小尾寒羊群体处于Hardy-Weinberg平衡状态;L2和L4位点在蒙古羊和滩羊群体处于Hardy-Weinberg平衡状态;L3位点只有在欧拉羊群体处于Hardy-Weinberg不平衡状态。4个群体的平均有效等位基因数为1.7162,与实际观察值相近,说明等位基因数分布较均衡。L1、L3和L4三个位点在蒙古羊群体的多态信息含量和信息熵均大于其他3个品种群体,证明了蒙古羊具有丰富的遗传基础。L2位点在滩羊群体的多态信息含量最大,说明滩羊的该位点遗传基础丰富。3.将4个含有多态基因型的位点与4个品种绵羊的部分经济性状进行相关性分析结果如下:在蒙古羊群体中,L1位点与屠宰率存在相关性,各基因型的均值差异显著(P<0.05);L2位点与背膘厚、体重和胴体重存在相关性,但各基因型的均值差异显著(P<0.05),可作为蒙古羊活重等6个屠宰性状的标记位点,其中L2-AA型所对应活重、胴体重、背膘厚、花油重和腹脂重的最小二乘均数皆为最大,且与其他两个基因型比较,差异显著(P<0.05),可作为蒙古羊的活重等5个性状的标记基因型;L3位点只与屠宰率存在相关性,且各基因型的均值差异显著(P<0.05),对L3位点和L1位点选择效应比较得知,L3-BB基因型可作为蒙古羊群体的屠宰率标记基因型;L4位点与屠宰率存在相关性,且各基因型的均值差异显著(P<0.05)。在小尾寒羊群体中,L1位点多态性与背膘厚存在相关性,各基因型的均值差异显著(P<0.05);L3位点多态性与体重、胴体重、背膘厚、肾脏脂肪重、花油重和腹脂重存在相关性,各基因型的均值差异极显著(P<0.01),且L3-BB基因型的最小二乘均值最大,可作为胴体重、肾脏脂肪重和腹脂重的标记基因型,此外对L3位点和L4位点选择效应比较得知,L3-BB基因型也可作为小尾寒羊群体的体重和背膘厚标记基因型;L4位点多态性与小尾寒羊的体重和背膘厚存在相关性,各基因型的均值差异极显著(P<0.05)。在滩羊群体中,L3位点多态性与体重、胴体重和花油重存在相关性,且各基因型均值差异显著(P<0.05),其中L3-BB基因型对应最小二乘均值最大,可作为滩羊的体重、胴体重和花油重的标记基因型;在欧拉羊群体中,L1位点与体重有相关性,且各基因型的均值差异显著(P<0.05);L2位点与体重有相关性,且各基因型的均值差异显著(P<0.05);L3位点与体重有相关性,且各基因型的均值差异显著(P<0.05)对L3位点与L1和L2位点选择效应比较得知,L3-BB基因型也可作为欧拉羊群体的体重标记基因型。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 Leptin 基因研究进展
  • 1.1 LEPTIN 的发现
  • 1.2 LEPTIN 基因及其表达产物的大小
  • 1.3 LEPTIN 基因及其表达产物结构
  • 1.3.1 Leptin 基因结构
  • 1.3.2 Leptin 的氨基酸序列
  • 1.4 LEPTIN 的生物学作用
  • 1.4.1 调节脂肪沉积和体脂含量
  • 1.4.2 调节生长和代谢
  • 1.4.3 调节生殖和发育
  • 1.4.4 调节免疫和造血机能
  • 1.4.5 参与应激反应
  • 1.5 LEPTIN 水平与脂肪沉积的关系
  • 1.6 LEPTIN 基因在畜牧业上应用的展望
  • 1.7 本研究的目的及意义
  • 第二章 试验方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.1.1 供试羊来源及血样采集
  • 2.1.2 主要仪器设备及产地
  • 2.1.3 工具酶及主要试剂
  • 2.1.4 主要试剂配制
  • 2.2 试验方法
  • 2.2.1 基因组DNA 的提取-常规酚氯仿抽提法
  • 2.2.2 DNA 浓度和纯度的检测
  • 2.2.3 PCR-SSCP 分析及程序
  • 2.2.4 统计分析方法及相关应用软件
  • 第三章 结果与分析
  • 3.1 LEPTIN 基因遗传变异检测
  • 3.1.1 基因组DNA 检测
  • 3.1.2 PCR 扩增结果
  • 3.1.3 PCR-SSCP 结果
  • 3.1.4 PCR 产物测序结果
  • 3.2 LEPTIN 基因的多态性分析
  • 3.2.1 L1 位点多态性分析
  • 3.2.2 L2 位点多态性分析
  • 3.2.3 L3 位点多态性分析
  • 3.2.4 L4 位点多态性分析
  • 3.3 LEPTIN 基因多态性与绵羊部分经济性状的相关性
  • 3.3.1 Leptin 基因多态性与蒙古羊部分经济性状的相关性
  • 3.3.2 Leptin 基因多态性与小尾寒羊部分经济性状的相关性
  • 3.3.3 Leptin 基因多态性与滩羊部分经济性状的相关性
  • 3.3.4 Leptin 基因多态性与欧拉羊部分经济性状的相关性
  • 第四章 讨论
  • 4.1 关于试验方法的优化
  • 4.2 绵羊LEPTIN 基因不同位点的群体遗传多态性分析
  • 4.3 绵羊LEPTIN 基因不同位点的选择效应
  • 第五章 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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