广西壮、汉族人群HIV-1感染相关基因CCR5△32、CCR2-64I、SDF1-3’A多态性的研究

广西壮、汉族人群HIV-1感染相关基因CCR5△32、CCR2-64I、SDF1-3’A多态性的研究

论文摘要

目的调查HIV-1感染相关的CCR5△32、CCR2-64I及SDF1-3’A在广西壮、汉族人群中的等位基因频率及基因多态性的分布。通过课题的研究,将揭示它们在广西壮、汉族健康人群和HIV-1感染者中的等位基因突变频率及其多态性特点。了解广西壮、汉族人群对HIV-1的遗传易感性,为广西HIV-1的流行特点、致病机理等方面提供基础资料。方法在广西天等县、横县和南宁市通过随机抽取方法收集壮、汉族健康人群共180例(其中壮族120例,汉族60例)以及壮、汉族HIV-1感染者共60例(其中壮、汉族各30例)作为研究对象。所有的研究对象提取染色体基因组DNA,经过PCR(聚合酶链式反应)扩增不同的基因特定片段和PCR-RFLP(PCR-限制性片段长度多态性)检测其突变,分析HIV-1感染相关的基因多态性,并将研究结果与国内外报道的其他民族结果进行比较。结果(1)CCR5:120例壮族健康人群检测,CCR5△32(CCR5等位基因编码区域第185号氨基酸密码子以后发生了32个碱基缺失的突变)未发现有突变,等位基因频率为0。30例壮族HIV-1感染者中,CCR5△32未发现有突变,等位基因频率为0。60例汉族健康人群中,CCR5△32未发现有突变,等位基因频率为0。30例汉族HIV-1感染者中,CCR5△32未发现有突变,等位基因频率为0。(2)CCR2:120例壮族健康人群检测,CCR2-64I(CCR2基因的读码框架起始点ATG后的第190位点G→A核苷酸的替换)纯合突变0例,占总数的0;杂合突变61例,占总数的50.83%。等位基因频率为25.42%。30例壮族HIV-1感染人群检测,CCR2-64I纯合突变0例,占总数的0;杂合突变12例,占总数的40%。等位基因频率为20%。60例汉族健康人群检测,CCR2-64I纯合突变0例,占总数0;杂合突变31例,占总数的51.67%。等位基因频率为25.83%。30例汉族HIV-1感染人群检测,CCR2-64I纯合突变0例,占总数的0;杂合突变14例,占总数的46.67%。等位基因频率为23.33%。(3)SDF1:120例壮族健康人群检测,SDF1-3’A(是编码基因801位的G突变为A,位于3’端非翻译区)纯合突变12例,占总数的10%;杂合突变42例,占总数的35%。等位基因频率为27.50%。30例壮族HIV-1感染人群检测,SDF1-3’A纯合突变2例,占总数的6.67%;杂合突变14例,占总数的46.67%。等位基因频率为30%。60例汉族健康人群检测,SDF1-3’A纯合突变4例,占总数的6.70%;杂合突变25例,占总数的41.67%。等位基因频率为27.50%。30例汉族HIV-1感染人群检测,SDF1-3’A纯合突变4例,占总数的13.33%;杂合突变11例,占总数的36.67%。等位基因频率为31.17%。结论(1)本研究中广西壮、汉族人群未检测到CCR5△32突变。说明广西壮、汉族人群对HIV-1的感染在辅助受体CCR5上具有较低的遗传保护性,对巨噬细胞嗜性HIV-1的易感性高于欧美白人。(2)广西壮、汉族人群CCR2辅助受体的基因突变率高于欧美白人。广西壮、汉族间的基因突变率差别没有显著意义。(3)SDF1-3’A基因在广西壮、汉族人群中均有突变,但两组人群之间的基因突变率差别没有显著性。广西壮族基因变异率高于欧美白人。

论文目录

  • 中英文缩写对照表
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 材料与方法
  • 一、研究对象
  • 二、实验材料
  • 1. 主要仪器与设备
  • 2. 主要试剂
  • 3. 主要试剂配制
  • 4. 生物学软件和分析工具
  • 5. 统计学软件
  • 三、实验方法
  • 1. 样本采集和处理
  • 2. 引物的序列、位置及目的
  • 3. CCR5实验
  • 4. CCR2实验
  • 5. SDF1实验
  • 结果
  • 一、PCR及PCR-RFLP检测CCR5Δ32、CCR2-64I、SDF1-3’A突变情况
  • 二、测序结果验证突变
  • 三、广西壮、汉族人群CCR5Δ32、CCR2-64I以及SDF1-3’A基因的基因型 和等位基因频率
  • 四、CCR5Δ32、CCR2-64I和SDF1-3’A突变在广西壮、汉族健康人群和 HIV-1感染者中的差别比较
  • 五、广西壮、汉族与中国汉族、中国其它少数民族CCR5Δ23、CCR2-64I 和SDF1-3’A等位基因频率的比较
  • 六、广西壮、汉族与中国汉族及欧美白人CCR5Δ32、CCR2-64I和SDF1-3’ A等位基因频率的比较
  • 讨论
  • 一、广西壮、汉族与中国汉族、欧美人群CCR5Δ32、CCR2-64I以及SDF1-3' A基因多态性的比较及意义
  • 二、广西壮、汉族健康人群与HIV-1感染者CCR5Δ32、CCR2-64I以及SDF1-3' A基因多态性的比较及意义
  • 三、实验过程中的质量控制
  • 小结
  • 参考文献
  • 综述
  • 致谢
  • 相关论文文献

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