王瑶瑶:喜树碱关键酶基因的克隆与生物信息学分析论文

王瑶瑶:喜树碱关键酶基因的克隆与生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者王瑶瑶,丁剑兰,韩卓,郭亚鑫,刘诗卉,刘晓宁(2019)在《喜树碱关键酶基因的克隆与生物信息学分析》一文中研究指出:为了克隆喜树碱生物合成途径关键酶异胡豆苷合成酶的基因STR,本文对喜树幼叶进行RNA提取,利用RT-PCR克隆基因STR的CDS序列,利用在线软件ExPASy ProtParam、SignalP4.1、TMHMMV.2.0、TargetP 1.1分析蛋白理化性质、蛋白信号肽、蛋白跨膜区以及亚细胞定位,利用在线工具Conserved Domain、SOPMA预测蛋白保守结构域和二级结构,利用MEGA 6.0软件构建蛋白系统进化树。结果表明,以喜树幼芽为材料,通过RT-PCR克隆喜树碱生物合成途径关键酶基因STR的CDS序列为993 bp;生物信息学分析表明,STR定位于分泌通道,为酸性蛋白,无信号肽,有1个跨膜区,由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲等二级结构组成;STR包含高度保守的结构域,聚类分析表明其与中果咖啡具有较高的相似性、较近的亲缘关系和遗传距离。

Abstract

wei le ke long xi shu jian sheng wu ge cheng tu jing guan jian mei yi hu dou gan ge cheng mei de ji yin STR,ben wen dui xi shu you xie jin hang RNAdi qu ,li yong RT-PCRke long ji yin STRde CDSxu lie ,li yong zai xian ruan jian ExPASy ProtParam、SignalP4.1、TMHMMV.2.0、TargetP 1.1fen xi dan bai li hua xing zhi 、dan bai xin hao tai 、dan bai kua mo ou yi ji ya xi bao ding wei ,li yong zai xian gong ju Conserved Domain、SOPMAyu ce dan bai bao shou jie gou yu he er ji jie gou ,li yong MEGA 6.0ruan jian gou jian dan bai ji tong jin hua shu 。jie guo biao ming ,yi xi shu you ya wei cai liao ,tong guo RT-PCRke long xi shu jian sheng wu ge cheng tu jing guan jian mei ji yin STRde CDSxu lie wei 993 bp;sheng wu xin xi xue fen xi biao ming ,STRding wei yu fen bi tong dao ,wei suan xing dan bai ,mo xin hao tai ,you 1ge kua mo ou ,you α-luo xuan 、yan shen lian 、β-zhuai jiao he mo gui ze juan qu deng er ji jie gou zu cheng ;STRbao han gao du bao shou de jie gou yu ,ju lei fen xi biao ming ji yu zhong guo ga fei ju you jiao gao de xiang shi xing 、jiao jin de qin yuan guan ji he wei chuan ju li 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自现代农业科技的王瑶瑶,丁剑兰,韩卓,郭亚鑫,刘诗卉,刘晓宁,发表于刊物现代农业科技2019年02期论文,是一篇关于喜树碱论文,异胡豆苷合成酶论文,基因克隆论文,生物信息学分析论文,现代农业科技2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自现代农业科技2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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