本文主要研究内容
作者张宇飞（2019）在《无芒隐子草全基因组水平内含子长度多态性（ILP）分子标记的开发和应用》一文中研究指出：无芒隐子草(Cleistogenes songorica)属于禾本科隐子草属,是荒漠草地旱生种,为荒漠草原的建群种和优势种。它具有饲用价值高、耐寒、耐旱等优良特性,可作为饲草、草坪草和生态草。目前,在无芒隐子草中还没有大规模开发分子标记的报道,限制了无芒隐子草分子生物学研究与育种工作。本研究在全基因组水平开发了高效的无芒隐子草内含子长度多态性(Intron Length Polymorphism,ILP)分子标记,并验证了无芒隐子草ILP(Cs_ILP)标记在其他物种中的通用性,为无芒隐子草的分子标记辅助育种、居群遗传学研究等工作奠定基础。主要研究结果如下:1.从无芒隐子草全基因组中检索出220,165个内含子,其中有181,681个内含子可以注释到27,314个基因,并定位到无芒隐子草的20对染色体上。对这些基因进行了生物信息学分析,有20,503个基因被注释到了GO数据库,9,604个基因被注释到KEGG数据库。根据检索出的内含子序列,设计了91,170对Cs_ILP标记引物。共有84,635个Cs_ILP标记可以定位到染色体上。2.利用417对Cs_ILP标记引物,对23个隐子草属植物居群进行遗传多样性分析。结果表明,共扩增得到402个等位基因(Na),期望杂合度(He)的平均值为0.61,多态信息含量(PIC)的平均值为0.56。Cs_ILP标记能很好地区分隐子草属不同种的居群,对地理分布不同的无芒隐子草居群也有一定的区分作用。说明Cs_ILP标记适用于隐子草属遗传多样性研究、系统分类研究等。3.用无芒隐子草及其他10种植物对Cs_ILP标记进行了通用性分析表明,这些植物材料中Cs_ILP标记的通用率为58.40%,构建系统发育树能将不同科的植物材料区分开。说明Cs_ILP标记能在不同科的物种中表达通用性。
Abstract
mo mang yin zi cao (Cleistogenes songorica)shu yu he ben ke yin zi cao shu ,shi huang mo cao de han sheng chong ,wei huang mo cao yuan de jian qun chong he you shi chong 。ta ju you si yong jia zhi gao 、nai han 、nai han deng you liang te xing ,ke zuo wei si cao 、cao ping cao he sheng tai cao 。mu qian ,zai mo mang yin zi cao zhong hai mei you da gui mo kai fa fen zi biao ji de bao dao ,xian zhi le mo mang yin zi cao fen zi sheng wu xue yan jiu yu yo chong gong zuo 。ben yan jiu zai quan ji yin zu shui ping kai fa le gao xiao de mo mang yin zi cao nei han zi chang du duo tai xing (Intron Length Polymorphism,ILP)fen zi biao ji ,bing yan zheng le mo mang yin zi cao ILP(Cs_ILP)biao ji zai ji ta wu chong zhong de tong yong xing ,wei mo mang yin zi cao de fen zi biao ji fu zhu yo chong 、ju qun wei chuan xue yan jiu deng gong zuo dian ding ji chu 。zhu yao yan jiu jie guo ru xia :1.cong mo mang yin zi cao quan ji yin zu zhong jian suo chu 220,165ge nei han zi ,ji zhong you 181,681ge nei han zi ke yi zhu shi dao 27,314ge ji yin ,bing ding wei dao mo mang yin zi cao de 20dui ran se ti shang 。dui zhe xie ji yin jin hang le sheng wu xin xi xue fen xi ,you 20,503ge ji yin bei zhu shi dao le GOshu ju ku ,9,604ge ji yin bei zhu shi dao KEGGshu ju ku 。gen ju jian suo chu de nei han zi xu lie ,she ji le 91,170dui Cs_ILPbiao ji yin wu 。gong you 84,635ge Cs_ILPbiao ji ke yi ding wei dao ran se ti shang 。2.li yong 417dui Cs_ILPbiao ji yin wu ,dui 23ge yin zi cao shu zhi wu ju qun jin hang wei chuan duo yang xing fen xi 。jie guo biao ming ,gong kuo zeng de dao 402ge deng wei ji yin (Na),ji wang za ge du (He)de ping jun zhi wei 0.61,duo tai xin xi han liang (PIC)de ping jun zhi wei 0.56。Cs_ILPbiao ji neng hen hao de ou fen yin zi cao shu bu tong chong de ju qun ,dui de li fen bu bu tong de mo mang yin zi cao ju qun ye you yi ding de ou fen zuo yong 。shui ming Cs_ILPbiao ji kuo yong yu yin zi cao shu wei chuan duo yang xing yan jiu 、ji tong fen lei yan jiu deng 。3.yong mo mang yin zi cao ji ji ta 10chong zhi wu dui Cs_ILPbiao ji jin hang le tong yong xing fen xi biao ming ,zhe xie zhi wu cai liao zhong Cs_ILPbiao ji de tong yong lv wei 58.40%,gou jian ji tong fa yo shu neng jiang bu tong ke de zhi wu cai liao ou fen kai 。shui ming Cs_ILPbiao ji neng zai bu tong ke de wu chong zhong biao da tong yong xing 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自兰州大学的张宇飞，发表于刊物兰州大学2019-07-29论文，是一篇关于无芒隐子草论文,内含子长度多态性论文,基因注释论文,遗传多样性论文,通用性论文,兰州大学2019-07-29论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自兰州大学2019-07-29论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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