扩增阻滞突变系统论文-沈维祥,陈春峰,张小燕,郜恒骏

扩增阻滞突变系统论文-沈维祥,陈春峰,张小燕,郜恒骏

导读:本文包含了扩增阻滞突变系统论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:突变阻滞扩增系统,实时荧光PCR,基因突变

扩增阻滞突变系统论文文献综述

沈维祥,陈春峰,张小燕,郜恒骏[1](2017)在《基于突变阻滞扩增系统的实时荧光PCR技术检测幽门螺杆菌23S rRNA基因突变及其评价》一文中研究指出目的探索突变阻滞扩增系统(ARMS)联合实时荧光PCR技术用于检测幽门螺杆菌23S rRNA基因突变的可行性。方法以幽门螺杆菌23S rRNA基因2143位点的两种基因型(野生型为AAA,突变型为AGA)质粒DNA为研究模型,设计ARMS引物同时对实时荧光PCR体系进行优化,对突变阻滞扩增系统联合实时荧光PCR技术的基因分型特异性进行评价。结果在与模板匹配的ARMS引物3'端附近故意引入错配碱基,降低该ARMS引物浓度和镁离子浓度,并采用两步PCR循环的反应程序,使ARMS引物的特异性增强,能够得到清晰的基因分型结果。结论这种基于突变阻滞扩增系统的实时荧光PCR技术,实验设计简便,特异性较好,并有望在此基础上发展成为适合临床应用的突变检测方法。(本文来源于《中国医药生物技术》期刊2017年02期)

王建华,李纪鹏,金明威,李珊凤[2](2017)在《Sanger测序法和突变扩增阻滞系统法检测非小细胞肺癌EGFR基因19、21号外显子突变的临床价值比较》一文中研究指出目的比较Sanger测序法和突变扩增阻滞系统(ARMS)法检测非小细胞肺癌(NSCLC)EGFR基因19、21号外显子突变的临床价值。方法收集经病理组织学确诊的NSCLC患者肺部原发或转移癌标本102例,其中石蜡包埋组织75例,病理活检标本27例;采用Sanger测序法和ARMS法检测上述标本EGFR基因19、21号外显子突变情况,分析其与患者临床病理学特征的关系。结果 ARMS法突变检出率为48.0%(49/102),高于Sanger测序法的32.3%(31/96),两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。病理活检组织ARMS法突变检出率为57.1%(12/21),明显高于Sanger测序法的23.8%(5/21),差异有统计学意义(P<0.05);石蜡包埋组织ARMS法和Sanger测序法突变检出率分别为49.3%(37/75)和34.7%(26/75),两者比较差异无统计学意义(P>0.05)。女性患者EGFR基因突变检出率68.0%高于男性患者的28.8%,未吸烟患者突变检出率65.5%高于吸烟患者的27.7%,腺癌患者突变检出率62.3%高于鳞癌患者的26.8%,差异均有统计学意义(均P<0.05);但EGFR基因突变检出率和有无淋巴结转移及年龄比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论 EGFR基因19、21号外显子突变好发于女性、未吸烟患者和腺癌患者,Sanger测序法对大组织样本及未知突变检测更有优势,ARMS法对病理活检、微小样本及要求灵敏度高的样本检测更为适合,结合2种方法检测结果更为全面可靠。(本文来源于《浙江医学》期刊2017年02期)

朱毅,裴锋[3](2016)在《扩增阻滞突变系统检测晚期非小细胞肺癌患者外周血游离DNA中EGFR基因突变》一文中研究指出目的探究外周血游离DNA(cf DNA)检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的可行性。方法收集2013年7月-2014年1月湖北省肿瘤医院收治50例确诊为晚期NSCLC患者的肿瘤组织及配对的外周血样本,分别提取肿瘤组织DNA及cf DNA,采用基于实时荧光定量PCR的扩增阻滞突变系统(ARMS)检测两类样本中EGFR基因突变。结果以肿瘤组织的结果为准,cf DNA中检出突变的特异性为97.2%(35/36),敏感度为78.6%(11/14),一致性为92.0%(46/50),且具有和肿瘤组织相同的EGFR基因突变类型。结论 cf DNA和肿瘤组织的EGFR基因突变类型相同,一致性、特异性和敏感度较高,对于晚期难以获得组织的NSCLC患者,外周血可代替肿瘤组织应用于临床EGFR基因突变检测。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2016年24期)

王佳,王淑玲,周文胜,洪秀琴[4](2015)在《扩增阻滞突变系统快速检测H型高血压患者MTHFR C677T基因型的应用研究》一文中研究指出目的通过扩增阻滞突变系统-聚合酶链反应(ARMS-PCR)检测H型高血压患者5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因型,以期建立一种低成本、简单快速的MTHFR C677T基因分型方法。方法基于湖南省H型高血压危险因素研究的大型流行病调查的人群基础,采用单纯随机方法,选取94例H型高血压患者作为研究对象。设计阻滞度递减的系列错配引物,采用ARMS-PCR对94例患者外周血样本的MTHFR C677T基因型进行鉴定,并抽取不同基因型进行测序验证。结果 ARMS-PCR产物电泳后条带清晰,易于判读MTHFR C677T基因型。94例H型高血压患者共检出CC基因型42例、CT基因型24例和TT基因型28例。ARMS-PCR与DNA测序结果一致。结论 ARMS-PCR经阻滞度递减的系列错配引物能有效对MTHFR C677T基因型进行鉴定,此法具有成本低、操作简单、用时短的优点。适用于各类基因的多态性分析。(本文来源于《中国全科医学》期刊2015年35期)

张朝,朱娟莉,杨江存,马婷,惠文利[5](2014)在《扩增阻滞突变系统用于ABO血型基因分型研究》一文中研究指出目的建立一种快速、低成本的ABO血型基因分型方法。方法设计6对引物,建立扩增阻滞突变系统(ARMS),对30例中国汉族无关个体外周血样本的ABO基因型进行鉴定,并与血清学方法和直接测序结果进行比较。结果 ARMS技术检测30例样本结果同血清学方法、直接测序结果吻合率达到100%。结论该研究建立的ABO血型基因型鉴定方法可快速检测出28种ABO基因型,具有一定的临床应用价值。(本文来源于《细胞与分子免疫学杂志》期刊2014年06期)

吴海凤,马琳,赵悦[6](2013)在《采用扩增阻滞突变系统法检测非小细胞肺癌患者外周血EGFR突变的研究》一文中研究指出目的探讨非小细胞肺癌患者使用外周血替代肿瘤组织进行EGFR突变检测的可行性。方法采用QIAGEN DNA提取试剂盒提取DNA,然后使用AmoyDx人类EGFR基因21种基因突变荧光PCR检测试剂盒检测EGFR基因的突变情况。结果1、EGFR突变率在外周血及肿瘤组织中都存在腺癌患者(P<0.05)中显着增高,尤其晚期肺腺癌突变比例更高,两者配对样本中EGFR突变与年龄、性别、吸烟状况无关。2、68例配对标本中,外周血总EGFR的突变率为29.4%(20/68);新鲜肿瘤组织的总EGFR突变检出率为(本文来源于《中华医学会呼吸病学年会——2013第十四次全国呼吸病学学术会议论文汇编》期刊2013-09-18)

吴海凤[7](2013)在《扩增阻滞突变系统法检测非小细胞肺癌患者外周血EGFR突变的研究》一文中研究指出目的:本实验旨在探讨我院非小细胞肺癌患者的外周血与肿瘤组织采用ARMS法检测EGFR的突变情况,比较两者的一致性,证明非小细胞肺癌患者使用外周血替代肿瘤组织进行EGFR突变检测的可行性。方法:收集南昌大学第一附属医院胸外科68例经手术治疗NSCLC患者肿瘤组织及配对的外周静脉血标本。采用QIAGEN公司DNA提取试剂盒提取标DNA,然后使用AmoyDx人类EGFR基因检测试剂盒检测EGFR基因的突变情况,最后采用卡方检验检验外周血及新鲜肿瘤组织EGFR突变与患者临床特征的关系,不同突变类型与临床特征的关系,并采用配对资料卡方检验,比较外周血与肿瘤组织EGFR突变检出率差异。结果:1、EGFR突变率在外周血及肿瘤组织中都存在腺癌患者(P<0.05)中显着增高,两者配对样本中EGFR突变与年龄、性别、吸烟状况无关。2、68例配对标本中,外周血总EGFR的突变率为29.4%(20/68);新鲜肿瘤组织的总EGFR突变检出率为36.8%(25/68),两者EGFR突变率一致性达80%,二者间差异无统计学意义(0.05<P<0.1)。3、EGFR基因突变主要为外显子19和21突变.且此两种突变类型与病理类型、病理分期、年龄、性别及吸烟状态无关。结论:NSCLC患者进行EGFR基因突变检测,仍以组织标本为金标准,对于晚期肺腺癌患者可使用外周血检测EGFR基因突变检测,筛选TKIs靶向治疗患者。外周血替代肿瘤组织对晚期NSCLC患者进行EGFR基因突变检测具有一定可行性。(本文来源于《南昌大学》期刊2013-06-01)

赵婧雅,王笑影,曾海英,黄洁,洪群英[8](2013)在《直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统检测肺癌小活检标本EGFR基因突变的比较》一文中研究指出背景与目的:表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因的突变状态与肺癌患者应用EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)的疗效密切相关。目前,临床上缺乏统一的方法检测EGFR基因突变。本研究旨在探讨直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统(scorpions amplification refractory mutation system,scorpions ARMS法)在检测肺癌临床活检小标本EGFR突变时敏感性的差异,以及相关靶向治疗疗效的分析。方法:采用直接测序法和ARMS法共同检测168例石蜡包埋肺癌标本,并随访评估其中行靶向治疗患者的临床疗效。结果:手术标本80例中,直接测序法与ARMS法所检出的突变阳性率分别为18.8%和25.0%,敏感性分别为71.4%和95.2%,差异无统计学意义(P>0.05)。而活检小标本88例中,直接测序法与ARMS法所检出的突变阳性率分别为19.3%和42.0%,敏感性分别为42.5%和92.5%,前者均显着低于后者(P<0.01)。靶向治疗疗效方面,直接测序法与ARMS法野生型患者客观缓解率(objectiveresponse rate,ORR)分别为26.3%和3.8%,前者明显高于后者(P<0.05),而在小活检标本中,直接测序法野生型患者ORR达32.0%。直接测序法野生型患者中位无进展生存期(progression-free survival,PFS)为4.0个月,明显长于ARMS法野生型患者的1.5个月(P<0.05)。结论:对活检小标本而言,ARMS法较直接测序法的敏感性更高,其检测结果与临床疗效的一致性更好,纤维支气管镜活检等小标本EGFR突变检测更适合用ARMS法。(本文来源于《中国癌症杂志》期刊2013年02期)

任睿欣,李嘉瑜,李雪飞,陈秀,任胜祥[9](2012)在《扩增阻滞突变系统法检测非小细胞肺癌微小标本表皮生长因子受体突变》一文中研究指出目的:探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)微小标本代替大体标本用于扩增阻滞突变系统(ampli cation refractory mutation system,ARMS)法检测表皮生长因子受体(epidermal growth factorreceptor,EGFR)基因突变的可行性。方法:181例NSCLC标本纳入本研究,包括157例微小标本(分别为CT引导下经皮肺穿刺活检标本、支气管内超声引导下针吸活检标本、淋巴结活检标本、支气管镜活检标本和胸腔积液)和24例大体标本。采用QIAGEN DNA提取试剂盒提取标本组织DNA,然后使用AmoyDx人类EGFR基因4种突变荧光PCR检测试剂盒检测EGFR基因的突变情况,最后采用χ2检验或Fisher精确检验比较微小标本与大体标本的EGFR突变检出率。结果:181例标本中,EGFR的总突变率为39.8%(72/181);其中微小标本的EGFR突变检出率为38.9%,大体标本的EGFR突变检出率为45.8%,2者间差异无统计学意义(P=0.515)。EGFR突变率在不吸烟患者(P=0.033)和腺癌患者(P<0.001)中显着增高。结论:ARMS法检测NSCLC微小标本也能获得较高的EGFR突变检出率。对于晚期难以获得大体标本的NSCLC患者,微小标本可代替大体标本应用于临床EGFR突变检测。(本文来源于《肿瘤》期刊2012年11期)

刘晶[10](2012)在《北京协和医院病理科首先开展蝎形探针扩增阻滞突变系统检测石蜡切片基因突变》一文中研究指出北京协和医院病理科在国内首次引入蝎形探针扩增阻滞突变系统(scorpions amplification refractory mutation system,Scorpions ARMS)进行石蜡切片基因突变检测,并证实该项新技术较之传统恶性肿瘤石蜡切片的基因突变检测具有高敏感(本文来源于《协和医学杂志》期刊2012年02期)

扩增阻滞突变系统论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的比较Sanger测序法和突变扩增阻滞系统(ARMS)法检测非小细胞肺癌(NSCLC)EGFR基因19、21号外显子突变的临床价值。方法收集经病理组织学确诊的NSCLC患者肺部原发或转移癌标本102例,其中石蜡包埋组织75例,病理活检标本27例;采用Sanger测序法和ARMS法检测上述标本EGFR基因19、21号外显子突变情况,分析其与患者临床病理学特征的关系。结果 ARMS法突变检出率为48.0%(49/102),高于Sanger测序法的32.3%(31/96),两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。病理活检组织ARMS法突变检出率为57.1%(12/21),明显高于Sanger测序法的23.8%(5/21),差异有统计学意义(P<0.05);石蜡包埋组织ARMS法和Sanger测序法突变检出率分别为49.3%(37/75)和34.7%(26/75),两者比较差异无统计学意义(P>0.05)。女性患者EGFR基因突变检出率68.0%高于男性患者的28.8%,未吸烟患者突变检出率65.5%高于吸烟患者的27.7%,腺癌患者突变检出率62.3%高于鳞癌患者的26.8%,差异均有统计学意义(均P<0.05);但EGFR基因突变检出率和有无淋巴结转移及年龄比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论 EGFR基因19、21号外显子突变好发于女性、未吸烟患者和腺癌患者,Sanger测序法对大组织样本及未知突变检测更有优势,ARMS法对病理活检、微小样本及要求灵敏度高的样本检测更为适合,结合2种方法检测结果更为全面可靠。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

扩增阻滞突变系统论文参考文献

[1].沈维祥,陈春峰,张小燕,郜恒骏.基于突变阻滞扩增系统的实时荧光PCR技术检测幽门螺杆菌23SrRNA基因突变及其评价[J].中国医药生物技术.2017

[2].王建华,李纪鹏,金明威,李珊凤.Sanger测序法和突变扩增阻滞系统法检测非小细胞肺癌EGFR基因19、21号外显子突变的临床价值比较[J].浙江医学.2017

[3].朱毅,裴锋.扩增阻滞突变系统检测晚期非小细胞肺癌患者外周血游离DNA中EGFR基因突变[J].中国卫生检验杂志.2016

[4].王佳,王淑玲,周文胜,洪秀琴.扩增阻滞突变系统快速检测H型高血压患者MTHFRC677T基因型的应用研究[J].中国全科医学.2015

[5].张朝,朱娟莉,杨江存,马婷,惠文利.扩增阻滞突变系统用于ABO血型基因分型研究[J].细胞与分子免疫学杂志.2014

[6].吴海凤,马琳,赵悦.采用扩增阻滞突变系统法检测非小细胞肺癌患者外周血EGFR突变的研究[C].中华医学会呼吸病学年会——2013第十四次全国呼吸病学学术会议论文汇编.2013

[7].吴海凤.扩增阻滞突变系统法检测非小细胞肺癌患者外周血EGFR突变的研究[D].南昌大学.2013

[8].赵婧雅,王笑影,曾海英,黄洁,洪群英.直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统检测肺癌小活检标本EGFR基因突变的比较[J].中国癌症杂志.2013

[9].任睿欣,李嘉瑜,李雪飞,陈秀,任胜祥.扩增阻滞突变系统法检测非小细胞肺癌微小标本表皮生长因子受体突变[J].肿瘤.2012

[10].刘晶.北京协和医院病理科首先开展蝎形探针扩增阻滞突变系统检测石蜡切片基因突变[J].协和医学杂志.2012

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