噬菌体ФC31整合酶互作细胞蛋白的鉴定与分析

噬菌体ФC31整合酶互作细胞蛋白的鉴定与分析

论文摘要

噬菌体ФC31整合酶介导的基因转运相对于逆转录病毒载体往往被视为是一种更为安全的方法,因为该整合酶可以将目的基因插入到哺乳动物基因组的有限位点上。为了弄清ФC31整合酶在哺乳动物细胞中的整合机制以及可能存在的风险,研究ФC31整合酶和细胞蛋白的相互作用则是必要的。以pLexA-ФC31为诱饵,用酵母双杂交的方法对ФC31整合酶的互作蛋白进行了筛选。从106个阳性克隆中挑选了61个进行测序,结果鉴定到了11个可能的ФC31整合酶互作蛋白,分别是DAXX,TTRAP,SP100,RIP,BRD7,ZNF403,RPL14,UBA2,TARDBP,SEC61G和PRKDC。其中DAXX出现的频率最高(51/61),它和ФC31整合酶的相互作用又使用免疫共沉淀的方法得以确认。缺失突变分析表明DAXX的Fas结合域负责和ФC31整合酶的相互作用。而利用ФC31整合酶的肽段阵列和HEK293细胞裂解液之间的杂交表明ФC31整合酶C端的一个四氨基酸肽段,即451RFGK454,负责和DAXX的相互作用。这四个氨基酸对ФC31整合酶的活性也是必需的,因为缺失这四个氨基酸以后几乎丧失了全部的整合活性。DAXX和ФC31整合酶的功能上的相互作用也得以证实,因为在沉默细胞内源DAXX的情况下,ФC31整合酶介导的整合反应效率有显著的提高。另外,我们也对ФC31整合酶和TTRAP的相互作用进行了深入的研究。首先利用免疫共沉淀的方法进一步确认了二者的相互结合。突变分析表明TTRAP的N端和ФC31整合酶的C端分别负责彼此的结合。在TTRAP沉默的情况下,ФC31整合酶介导整合反应的效率也有明显的提高。有趣的是,类似于DAXX,TTRAP被证实是一个新的PML核体相关蛋白,因为我们发现TTRAP可以和PML共定位,其转录和表达可以受IFN-γ的上调。另外,我们利用酵母配对实验发现了TTRAP可以和PML以及DAXX相互作用。因此,DAXX和TTRAP作为PML核体相关蛋白,可能是作为宿主细胞的防御机制来抑制ФC31整合酶的活性。我们接着对TTRAP的功能进行了初步的分析。首先我们鉴定到TTRAP也可以和P53,CDC20,SP100,噬菌体ФBT1整合酶以及HIV整合酶相互作用,其次TTRAP可能是P53转录的调节因子,对P53转录活性有促进作用。另外,我们表达和纯化了GST-TTRAP的融合蛋白并对其酶活性进行分析,结果我们并没有发现TTRAP具有生物信息学所推测的磷酸二酯酶活性。我们也初步分析了ФC31整合酶对细胞信号通路的影响,结果表明ФC31整合酶对TNFαNIL-1激活的NFκB活性具有显著的抑制作用,然而这个过程是否通过DAXX或TTRAP起作用的还有待证实。

论文目录

  • 英文缩略词
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 前言
  • 第二章 材料和方法
  • 1 实验材料
  • 1.1 主要试剂
  • 1.2 菌株、细胞株和质粒
  • 1.3 常用试剂配制
  • 1.4 主要仪器设备
  • 1.5 计算机软件及数据库
  • 2 实验方法
  • 2.1 酵母双杂交实验
  • 2.2 酵母配对实验
  • 2.3 真核细胞的培养和转染
  • 2.4 蛋白质杂交膜分析
  • 2.5 免疫共沉淀分析
  • 2.6 亚细胞定位
  • 2.7 ΦC31整合酶的效率测定
  • 2.8 ΦC31整合酶对NF κ B的影响
  • -γ对TTRAP转录和表达的影响'>2.9 IFN对TTRAP转录和表达的影响
  • 2.10 TTRAP的酶学分析
  • 第三章 实验结果
  • 1 ΦC31整合酶互作蛋白的筛选
  • 2 ΦC31整合酶和DAXX的相互作用
  • 3 451RFGK454对ΦC31整合酶的活性是必需的
  • 4 ΦC31整合酶和DAXX的亚细胞定位
  • 5 DAXX对ΦC31整合酶效率的影响
  • 6 ΦC31整合酶和TTRAP相互作用的研究
  • 7 ΦC31整合酶和TTRAP的亚细胞定位
  • 8 TTRAP对ΦC31整合酶效率的影响
  • 9 C31整合酶对NF κ B的影响
  • 10 DAXX和TTRAP之间关系的分析
  • 11 TTRAP是PML核体相关蛋白
  • 12 TTRAP的酶学分析
  • 13 TTRAP相互作用蛋白的鉴定
  • 14 TTRAP调节P53的转录活性
  • 第四章 讨论
  • 1 ΦC31整合酶相互作用的细胞蛋白
  • 2 ΦC31整合酶和DAXX
  • 3 ΦC31整合酶和TTRAP
  • 4 TTRAP是PML核体相关蛋白
  • 研究小结
  • 参考文献
  • 综述 非病毒载体在基因治疗中的应用
  • 第一节 非病毒载体的优势,问题和发展方向
  • 第二节 非病毒载体的类型
  • 第三节 非病毒载体的基因导入方法
  • 主要参考文献
  • 发表的论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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