基于部分线粒体12S rRNA基因探讨贵州翼手目部分类群的分子系统进化关系

基于部分线粒体12S rRNA基因探讨贵州翼手目部分类群的分子系统进化关系

论文摘要

处于中国西南地区的贵州约有翼手类7科17属40余种,除棕果蝠(Pteropus leschenaulti)外都是小蝙蝠亚目的种类(王应祥,2003;罗蓉等,1995)。我们测定了贵州省3科(蝙蝠科,菊头蝠和蹄蝠科)6属17种蝙蝠(18个个体)的12S rRNA基因序列,结合Genbank中13种该3科蝙蝠的12S rRNA基因序列来探讨所获贵州蝙蝠的分子系统进化关系。为验证属于菊头蝠超科的菊头蝠科和蹄蝠科究竟与蝙蝠科还是与大蝙蝠亚目狐蝠科的亲缘关系近,也为更准确的推断长翼蝠亚科的系统进化地位,另从Genbank获取3种狐蝠科和1种犬吻蝠科蝙蝠的对应序列。以牛科的3种(Genbank)为外群,对翼手目五科(蝙蝠科,菊头蝠,蹄蝠科,狐蝠科和犬吻蝠科)的最大俭约(maximum parsimony,MP)分析表明:原属于小蝙蝠亚目的菊头蝠科和蹄蝠科与大蝙蝠亚目的狐蝠科聚为一支,犬吻蝠科与蝙蝠科组成另一支,表明小蝙蝠亚目为双系起源,和最新的分子系统学分析结果一致。为进一步深入探讨贵州蝙蝠的分子系统进化关系,结合Genbank相关物种的同源序列,分别对蝙蝠科,菊头蝠科与蹄蝠科进行贝叶斯(Bayesian),邻接(Neighbor Joining)和最小进化(Minimum Evolution)分析。分析结果表明:1.长翼蝠亚科应从蝙蝠中提升出来成为蝙蝠超科中的长翼蝠科;2.鼠耳蝠属应提升为亚科并与由管鼻蝠和彩蝠组成的一支构成姐妹群,和最近的分子系统学研究一致;3.鼠耳蝠属内的系统进化关系与地理分化的相关性更大,来自新、旧大陆的物种分别构成单系;4.西南鼠耳蝠与大鼠耳蝠和小鼠耳蝠间有较远的亲缘关系;5.关于南蝠属在似伏翼蝙蝠类群中的进化地位,由于没有蝙蝠类群的物种做参照还不能最终确定它属于哪个类群,但分析结果都排除它属于伏翼类群的可能性,为进一步确定南蝠属的系统进化地位提供了有力的证据;6.三叶蹄蝠属于蹄蝠科而不是菊头蝠科;7.蹄蝠属内,大蹄蝠与中蹄蝠先聚在一起,之后与普氏蹄蝠聚为一支;8.在菊头蝠属内,马铁菊头蝠与Rhinolophus.sp聚在一起,是最先分出的一支,继它们之后分出的是中菊头蝠;云南菊头蝠和单角菊头蝠聚在一起,贵州菊头蝠和中华菊头蝠聚为一支,表明它们之间有近的亲缘关系。本研究首次用分子系统学方法研究了贵州省蝙蝠部分类群的系统进化关系,也是第一次论述南蝠在似伏翼蝙蝠类群中的系统进化地位,及西南鼠耳蝠与大鼠耳蝠和小鼠耳蝠间的亲缘关系。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一部分 文献综述
  • 第一章 翼手目动物及其研究现状
  • 1.1 生态学
  • 1.2 生殖和发育
  • 1.3 回声定位
  • 1.4 生化和生理学
  • 1.4.1 同工酶
  • 1.4.2 血液的有效成分
  • 1.4.3 神经生理
  • 1.5 分子生物学和遗传学方面的研究
  • 第二章 翼手目动物系统发育研究概述
  • 2.1 翼手目动物的系统分类研究概述
  • 2.2 世界及中国现存蝙蝠的分类
  • 2.3 翼手目与哺乳动物其它目之间的关系
  • 2.4 翼手目的单系起源
  • 2.5 小蝙蝠亚目的双系起源
  • 2.6 蝙蝠科,菊头蝠科和蹄蝠科的科内系统发育关系
  • 第三章 分子系统学
  • 3.1 分子序列数据的特点
  • 3.2 脊椎动物线粒体基因特点
  • 3.3 分子系统学建树方法
  • 第四章 贵州地理概况
  • 第五章 研究目的
  • 第二部分 实验
  • 第一章 实验所用药品,仪器及标本的采集与保存
  • 1.1 实验所用药品与仪器
  • 1.2 蝙蝠的捕捉
  • 第二章 线粒体基因片段序列的获得
  • 2.1 标本
  • 2.2 总DNA 的提取
  • 2.3 PCR 扩增及序列测定
  • 第三章 序列分析及结果
  • 3.1 序列的对位排列
  • 3.2 外群(Outgroup)的选择
  • 3.3 DNA 进化模型的选择
  • 3.4 遗传距离分析
  • 3.5 系统进化分析
  • 3.6 K-H 和Templeton 检验
  • 第四章 讨论
  • 4.1 小蝙蝠亚目双系起源
  • 4.2 蝙蝠科内亚科,属,种间的系统进化关系
  • 4.3 菊头蝠属的系统进化关系
  • 4.4 蹄蝠科的系统进化关系
  • 第五章 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 附录1 多重序列比对后37 个物种的部分线粒体125 RRNA 序列
  • 附录2 构建系统树时用到重要分析模块
  • 附录3 已发表论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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