论文摘要
本文以猕猴川西亚种的5个群体为研究对象,采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)银染法和PCR技术相结合的方法,对111个猕猴个体的基因型进行了检测。通过计算遗传杂合度、多态信息含量、有效等位基因数和Nei氏遗传距离,采用UPGMA法和N-J等方法,分析了5个群体的遗传多样性和群体遗传结构。1)本实验共采用25对引物,通过PCR扩增检测,筛选出了扩增效果比较好的8对引物用于本研究。8个位点共检测到109个等位基因,平均每个位点检测到的等位基因数为13.62个,平均有效等位基因数为6.52个,表明本实验所选用的微卫星位点具有较好的多态性。2)通过Hardy-Weinberg平衡检测发现:在5个群体中,巴中群体除位点MML10S6F,九龙群体除位点D17S1300外,两群体的其他位点均处于不平衡状态,而其余三个群体处于平衡和不平衡状态的位点数目相当。整个猕猴川西亚种视为一个大群,有3个位点处于平衡状态,另外5个位点处于不平衡状态。分析其原因,可能是由于种群间亚结构、近亲交配和无效等位基因等造成的。3) 8个位点平均多态信息含量达0.89(PIC>0.5),表明均为高度多态性位点,5个群体平均观测杂合度为0.64,遗传多样性较为丰富。4)通过POPGENE32软件计算获得遗传同一性。其中,汉源与九龙间的遗传同一性最高(GI=0.8819),黑水与巴中间的遗传同一性最低(GI=0.6625),这与5个群体的地理位置分布完全相符。5)根据Nei氏(1983)遗传距离分别做UPGMA和N-J聚类分析:在UPGMA聚类图中,小金和黑水聚为一类,汉源和九龙聚为一类,上述两者再聚为一类,最后巴中与前面所有聚为一类;在N-J图中汉源与九龙首先聚为一类,小金和黑水单独聚在一起,最后巴中与上述两类共同聚为一类。两种聚类图的聚类结果与5个种群地理形态分布基本一致,汉源和九龙地处川西、巴中地处川东、而小金和黑水位于川西北,说明该8对微卫星标记检测群体间的遗传距离较为准确。