本文主要研究内容
作者张名媛,韦东力,司景磊,郭晓萍,崔悦悦,瞿秋红,綦文晶,兰干球,郭亚芬（2019）在《广西巴马小型猪ApoA1基因克隆及其生物信息学分析》一文中研究指出：【目的】克隆广西巴马小型猪载脂蛋白A1(ApoA1)基因并进行生物信息学分析,为后续开展ApoA1基因研究提供基础数据,同时为制作广西巴马小型猪动脉粥样硬化疾病模型打下基础。【方法】以提取的广西巴马小型猪肝脏组织总RNA为模板,运用RT-PCR克隆广西巴马小型猪ApoA1基因序列,以实时荧光定量PCR(qPCR)检测ApoA1基因在广西巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中的表达情况,并利用MegAlign、ProtParam、SOPMA、NetPhos、SignalP和SWISS-MODEL等在线分析软件对广西巴马小型猪ApoA1基因进行生物信息学分析及构建系统发育进化树。【结果】广西巴马小型猪ApoA1基因编码区(CDS)序列长795 bp,与普通猪ApoA1基因序列的同源性为99.9%,仅第630处有1个碱基发生同义突变。ApoA1基因在广西巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中均有表达,且以肝脏中的相对表达量最高、脾脏中的相对表达量最低。广西巴马小型猪ApoA1由264个氨基酸残基构成,其分子式为C1343H2136N376O409S5,蛋白分子量为30254.31 Da,理论等电点(pI)为5.47,属于亲水性蛋白,存在跨膜结构,不存在信号肽,有18处磷酸化位点(丝氨酸磷酸化位点有10处,苏氨酸磷酸化位点有6处,络氨酸磷酸化位点有2处)。广西巴马小型猪ApoA1的二级结构中,α-螺旋占79.92%,β-折叠占2.65%,无规则卷曲占11.12%,延伸链占6.31%,属于全α类蛋白。广西巴马小型猪ApoA1氨基酸序列与普通猪的同源性最高,达99.6%;由基于ApoA1氨基酸序列同源性构建的系统发育进化树也可看出,广西巴马小型猪与普通猪的亲缘关系最近。【结论】广西巴马小型猪ApoA1基因保守性强,以在肝脏中的表达量最高,是广西巴马小型猪抗动脉粥样硬化的重要因子,通过敲除该基因可制作广西巴马小型猪动脉粥样硬化疾病模型。
Abstract
【mu de 】ke long an xi ba ma xiao xing zhu zai zhi dan bai A1(ApoA1)ji yin bing jin hang sheng wu xin xi xue fen xi ,wei hou xu kai zhan ApoA1ji yin yan jiu di gong ji chu shu ju ,tong shi wei zhi zuo an xi ba ma xiao xing zhu dong mai yu yang ying hua ji bing mo xing da xia ji chu 。【fang fa 】yi di qu de an xi ba ma xiao xing zhu gan zang zu zhi zong RNAwei mo ban ,yun yong RT-PCRke long an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1ji yin xu lie ,yi shi shi ying guang ding liang PCR(qPCR)jian ce ApoA1ji yin zai an xi ba ma xiao xing zhu xin zang 、gan zang 、pi zang 、fei zang he shen zang zu zhi zhong de biao da qing kuang ,bing li yong MegAlign、ProtParam、SOPMA、NetPhos、SignalPhe SWISS-MODELdeng zai xian fen xi ruan jian dui an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1ji yin jin hang sheng wu xin xi xue fen xi ji gou jian ji tong fa yo jin hua shu 。【jie guo 】an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1ji yin bian ma ou (CDS)xu lie chang 795 bp,yu pu tong zhu ApoA1ji yin xu lie de tong yuan xing wei 99.9%,jin di 630chu you 1ge jian ji fa sheng tong yi tu bian 。ApoA1ji yin zai an xi ba ma xiao xing zhu xin zang 、gan zang 、pi zang 、fei zang he shen zang zu zhi zhong jun you biao da ,ju yi gan zang zhong de xiang dui biao da liang zui gao 、pi zang zhong de xiang dui biao da liang zui di 。an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1you 264ge an ji suan can ji gou cheng ,ji fen zi shi wei C1343H2136N376O409S5,dan bai fen zi liang wei 30254.31 Da,li lun deng dian dian (pI)wei 5.47,shu yu qin shui xing dan bai ,cun zai kua mo jie gou ,bu cun zai xin hao tai ,you 18chu lin suan hua wei dian (si an suan lin suan hua wei dian you 10chu ,su an suan lin suan hua wei dian you 6chu ,lao an suan lin suan hua wei dian you 2chu )。an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1de er ji jie gou zhong ,α-luo xuan zhan 79.92%,β-she die zhan 2.65%,mo gui ze juan qu zhan 11.12%,yan shen lian zhan 6.31%,shu yu quan αlei dan bai 。an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1an ji suan xu lie yu pu tong zhu de tong yuan xing zui gao ,da 99.6%;you ji yu ApoA1an ji suan xu lie tong yuan xing gou jian de ji tong fa yo jin hua shu ye ke kan chu ,an xi ba ma xiao xing zhu yu pu tong zhu de qin yuan guan ji zui jin 。【jie lun 】an xi ba ma xiao xing zhu ApoA1ji yin bao shou xing jiang ,yi zai gan zang zhong de biao da liang zui gao ,shi an xi ba ma xiao xing zhu kang dong mai yu yang ying hua de chong yao yin zi ,tong guo qiao chu gai ji yin ke zhi zuo an xi ba ma xiao xing zhu dong mai yu yang ying hua ji bing mo xing 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自南方农业学报的张名媛,韦东力,司景磊,郭晓萍,崔悦悦,瞿秋红,綦文晶,兰干球,郭亚芬，发表于刊物南方农业学报2019年06期论文，是一篇关于广西巴马小型猪论文,基因论文,克隆论文,生物信息学分析论文,动物模型论文,南方农业学报2019年06期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自南方农业学报2019年06期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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