比较研究核糖蛋白基因结构:探索核糖蛋白基因表达共调控的机制

比较研究核糖蛋白基因结构:探索核糖蛋白基因表达共调控的机制

论文摘要

核糖体是细胞中十分重要的细胞器,其各组分的合成随着细胞生长条件的改变而受到严紧控制。比较研究酵母、人类和拟南芥核糖蛋白基因的结构发现,酵母和拟南芥核糖蛋白基因启动子上游分别都有普遍的、有着位置偏好性的,相对于全基因组来说显著的转录因子结合位点。然而,与这两个物种不同的是,我们并没有在人类核糖蛋白基因启动子上游发现普遍的转录因子结合位点。但是我们发现人类核糖蛋白基因上游区域靠近转录起始位点附近有着高密度的寡聚嘧啶分布,暗示着翻译调控对人类核糖蛋白基因表达的重要性。同时,三种物种的核糖蛋白基因翻译起始密码子离最近的外显子内含子交界的距离与全基因组比较相对较小,而且相对于全基因组来说,该最近内含子的剪切位点附近序列和起始密码子附近序列都有比较保守的特征,预示着内含子和起始密码子识别在核糖蛋白基因的协同表达中有着重要的作用。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第1章 引言
  • 1.1 核糖体各组分的表达受到严紧控制
  • 1.2 酵母(S.cerevisiae)和人类(human)核糖蛋白基因的调控方式
  • 1.3 其它物种核糖蛋白基因也存在协同表达现象
  • 第2章 材料与方法
  • 2.1 序列来源
  • 2.2 启动子分析
  • 2.3 TATA序列的分析
  • 2.4 寡聚嘧啶分析
  • 2.5 信息熵分析
  • 2.6 起始密码子和最近内含子之间的距离
  • 第3章 结果
  • 3.1 基因序列的收集
  • 3.2 启动子结构的比较
  • 3.3 TATA元件在核糖蛋白基因的启动子上的分布
  • 3.4 核糖蛋白基因上游区域寡聚嘧啶的分布
  • 3.5 靠近起始密码子的内含子
  • 3.6 核糖蛋白基因起始密码子附近序列保守性的分析
  • 第4章 讨论
  • 致谢
  • 参考文献
  • 攻读学位期间的研究成果
  • 相关论文文献

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