论文题目: 广义竹叶青蛇属的分类及系统发育研究（蛇亚目：蝮亚科）
论文类型: 博士论文
论文专业: 动物学
作者: 郭鹏
导师: 赵尔宓
关键词: 形态,半阴茎,头骨,分类,分子系统
文献来源: 四川大学
发表年度: 2005
论文摘要: 广义竹叶青蛇属Trimeresurus (sensu lato)是蝮亚科蛇中一个较大的类群,包含有40多个物种,广泛分布于东亚、南亚、东南亚国家和地区。Trimeresurus(sensu lato)物种表现出了丰富的多样性。首先,在地理分布上,既有广泛分布的物种,也有局限分布在较小范围的物种;既有分布在高海拔地区的种类,也有仅见于低中海拔的。其次,在生活环境上,有树栖、半树栖和陆栖三种类型。第三,在生殖上,有卵生、卵胎生两种方式。另外,体色丰富多样,个体大小差异大。该类群一般认为可划分为6属(Trimeresurus sensu stricto, Ovophis,Protobothrops, Zhaoermia, Tropidolaemus, Triceratolepidophis)。最近,主要依据半阴茎形态和分子系统学研究结果,Trimeresurus (Sensu stricto)和Ovophis又被进一步划分为多个属。 尽管,过去的几十年里,不少学者从形态、细胞和分子水平上对该类群的分类和系统演化作了大量的工作。但是由于受各种条件和因素的限制(如,难以获得足够数量和种类的标本),目前还存在着一些争议和不同的意见。首先,各属应包含哪些物种;其次,一些分布区域狭窄,而且种群数量十分稀少的种类的系统地位如何?第三,一些分布范围非常广泛的种类的种下系统关系不清楚;最后,一些属缺乏相应的形态学证据。 本文对Trimeresurus (sensu lato)10种的半阴茎形态和9种的头骨特征进行了比较解剖;采用最大简约法(MP)、似然法(ML)和贝叶斯法(BI)三种方法对43种(未包括Tropidolaemus)的3个线粒体基因序列(cyt.b、12S rRNA、16S rRNA)进行了系统发育分析。主要目的在于:重新评价Trimeresurus (sensulato)的系统关系;阐明一些稀有和分布狭窄物种的系统地位;初步探讨一些广泛分布的物种的种下关系;为一些属、种的分类提供必要的形态学证据。研究结果表明:
论文目录:
中文摘要
英文摘要
第一部分 综述：广义竹叶青蛇属Trimeresurus(sensu lato)的分类及系统学研究进展
1.概述
2.基于形态上的分类研究
2.1 Tropidolaemus
2.2 Ovophis
2.3 Protobothrops
2.4 Triceratolepidophis
2.5 Zhaoermia
2.6 Trimeresurus(sensu stricto)
3.细胞遗传学研究
4.分子系统学研究
5.有待解决的问题
第二部分 Trimeresurus(sensu lato)的形态研究
1.半阴茎形态的比较
1.1 先前蛇类半阴茎形态的研究概述
1.2 材料和方法
1.3 半阴茎形态的描述
1.4 讨论
1.4.1 相关物种的分类问题
1.4.2 广义竹叶青蛇属半阴茎形态的比较
2.头骨形态的比较
2.1 材料和方法
2.2 结果
2.3 讨论
2.3.1 与先前头骨形态研究的比较
2.3.2 相关问题的讨论
第三部分 Trimeresurus(sensu lato)的分子系统学研究
1.前言
2.材料和方法
2.1 样品收集
2.2 PCR扩增
2.3 序列测定
2.4 序列编辑及排序
2.5 数据相合性检验
2.5.1 Partition Homogeneity Test
2.5.2 后验概率检验(Posterior Probability Test)
2.6 系统发育分析
2.6.1 最大简约法(Maximum Parsimony，MP)
2.6.2 最大似然法(Maximum Likelihood，ML)
2.6.3 贝叶斯推断(Bayesian Inference or BI)
3.结果
3.1 测序和序列分析
3.2 数据相合性检验
3.3 系统发育分析
3.3.1 MrBayes推断树
3.3.2 最简约树
3.3.3 最大似然树
4.讨论
4.1 Trimeresurus(sensu lato)的系统学
4.2 Trimeresurus(sensustricto)的再划分
4.3 Viridovipera的系统关系
4.4 烙铁头蛇属Ovophis
4.5 原矛头蝮属Protobothrops
第四部分 结论
致谢
参考文献
附录
博士期间发表的论文及获奖情况
声明
Trimeresurus(sensu lato)所含属种名录
Log Likelihood scores
核苷酸频率
图版Ⅰ
发布时间: 2005-10-08
参考文献
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