化合物结构检索系统的设计及在维吾尔药资源库上的实现

论文摘要

分子结构式是化学交流中普遍使用的语言,是化学领域中的科学基础。近年来在药物研究领域,对少数民族特有的天然药物的研究正在形成热点,而民族药物现代化的核心是对药物分子结构的功能分析。在建设维吾尔药资源库的过程中,维吾尔药化合物数据库是其中的重要内容。维药化合物结构信息的表达、存储和检索等问题又是需要解决的重点问题。本文在建立化合物结构检索系统时,研究了三个方面的问题:化学结构数据在数据库中的存储形式,结构匹配算法研究与设计,以及检索系统平台的设计和实现。本文首先对化学结构信息的计算机处理进行了认真研究,并详细分析了目前主流的一些数据库管理系统,结合维药的信息特点,选用SQL Server 2000作为数据库管理系统,设计并建立了维药资源数据库。通过分子结构——数据结构的转化,实现了维吾尔药化合物数据库的管理功能。在结构匹配检索算法设计中,通过对目前的一些主要算法的研究分析,使用VF2算法作为实现结构检索的算法,并用C++语言编程实现了该算法。算法程序以动态链接库的形式作为本地方法提供给主程序进行调用,实现了结构匹配检索功能。本文采用JSP和JavaBean技术设计和实现了基于Web的结构检索系统,实现了全结构和子结构检索功能,提供了图形化和直接上传MOL格式文件的两种结构输入方式,并实现了检索结果的二维和三维动态显示。经过严格地系统测试,结果表明该系统运行稳定、效率较高,完全符合项目的开发需求,可以应用于实际中。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 绪论
• 1.1 现代数据库技术的进展
• 1.2 化合物结构检索技术
• 1.2.1 化合物结构检索的研究背景、意义
• 1.2.2 结构检索的主要方法
• 1.3 化合物结构检索的进展
• 1.4 课题来源及研究的意义和内容
• 1.4.1 课题的来源
• 1.4.2 研究的意义
• 1.4.3 研究的内容
• 第二章 化学结构信息的计算机处理
• 2.1 结构信息的计算机表示
• 2.2 化学结构的文件格式
• 2.3 化学标记语言
• 2.4 本章小结
• 第三章 结构检索算法
• 3.1 子结构匹配算法
• 3.1.1 回溯法
• 3.1.2 划分-松弛法
• 3.1.3 筛分法
• 3.1.4 其他方法
• 3.2 本章小结
• 第四章 维吾尔药资源数据库的设计与建立
• 4.1 数据库管理系统（DBMS）
• 4.1.1 DBMS 简介
• 4.1.2 几种主流的数据库介绍
• 4.2 数据库平台的选取
• 4.2.1 数据库管理系统的选择原则
• 4.2.2 本工作选取的数据库管理系统
• 4.3 维药信息分析
• 4.4 维药资源数据库的设计与建立
• 4.5 化合物数据库管理功能的实现
• 4.5.1 普通用户查询功能
• 4.5.2 管理员用户的管理功能
• 4.5.3 用户管理功能
• 4.6 本章小结
• 第五章 维药化合物结构检索系统的设计与实现
• 5.1 网络系统开发技术概述
• 5.1.1 程序网络计算模式
• 5.1.2 B/S 模式技术介绍
• 5.1.3 化合物结构检索系统开发技术的选择
• 5.2 化合物结构检索系统的总体功能设计
• 5.3 化合物结构检索系统功能实现
• 5.3.1 检索算法的设计
• 5.3.2 检索结构的输入
• 5.3.3 结构匹配功能的实现
• 5.3.4 匹配结果的输出显示
• 5.3.5 实验结果
• 5.4 检索示例
• 5.4.1 检索系统配置
• 5.4.2 检索示例
• 5.5 本章小结
• 第六章 总结与展望
• 6.1 总结
• 6.2 展望
• 参考文献
• 在读期间发表论文清单
• 致谢