遗传性非综合征型耳聋两种致病基因易感位点的关联分析

论文摘要

遗传性耳聋是最常见的遗传病之一,平均每1000个新生儿中就有1个先天性耳聋患者。我国每年新生聋儿中约有50%是由遗传因素造成的。耳聋发病具有高度的遗传异质性,目前已发现100多种致聋基因。国内非综合征型耳聋患者中,由DFNB1和SLC26A4基因发生突变而致聋的患者占了50%以上。目前国内外对DFNB1和SLC26A4进行了大量的研究,已肯定其在耳聋致病中起着非常重要的作用。但迄今为止,有关DFNB1和SLC26A4基因单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）及单体型（haplotype）与耳聋的遗传关联性的研究,国内外仍未见相关报道。因此,本研究拟通过关联分析的方法来探讨遗传性非综合征型耳聋两种类型致病基因易感位点DFNB1和SLC26A4的SNPs,以及所构建的单体型,在散发性耳聋患者和正常个体间是否存在差异,从而为临床遗传性耳聋的诊断和产前筛查提供重要的方法和证据。我们选取了DFNB1的rs2274084（C/T）,rs2274083（C/T）,rs7322538（A/G）,rs9315400（C/T）,snp-235delC（C/-）五个SNPs,SLC26A4的rs2248465（C/T）,rs2395911（C/T）,rs2712218（C/T）,rs982663（A/G）四个SNPs,采用等位基因特异性PCR（allele specific realtime PCR）和DNA序列测定的方法对以上9个SNPs进行基因分型,统计分型结果,验证哈迪-温伯格平衡（Hardy-weinberg equilibrium,HWE）,用SHEsis软件进行等位基因频率（allele frequencies）、基因型频率（genotype frequencies）和单体型（haplotype）的统计分析。研究结果显示,DFNB1位点的rs2274084,rs2274083,snp-235delC和SLC26A4的rs982663在散发性耳聋患者和正常对照间存在显著的差异。进一步验证了DFNB1和SLC26A4在耳聋发病中的重要作用。其中DFNB1的rs2274084,rs2274083,SLC26A4的rs2395911,rs2712218和rs982663存在显著的相关性（D’＞0.7）,根据其相关性构建的单体型C-C和T-T,G-A-C和G-G-C在耳聋患者和正常对照中具有显著差异性,C-C,G-A-C单体型在耳聋患者组显著高于正常对照组,而T-T,G-G-C单体型在患者组则明显低于正常对照组,提示C-C,G-A-C可能是引起遗传性耳聋的高致病性的单体型,T-T,G-G-C则可能是具有保护作用的单体型。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 前言
• 材料和方法
• 结果
• 讨论
• 小结
• 参考文献
• 附录
• 致谢
• 综述