黑带蛙(Rana nigrovittata)皮肤抗菌肽的分子多样性、结构与功能研究

黑带蛙(Rana nigrovittata)皮肤抗菌肽的分子多样性、结构与功能研究

论文摘要

大量研究已经证实,两栖类动物皮肤是生物活性物质丰富的资源库。而抗菌肽(Antimicrobial peptides,AMPs)作为机体先天防御系统的重要组成部分,在两栖类皮肤分泌液中含量异常丰富。本研究中,我们以来源于中国云南西双版纳的一种蛙科动物黑带蛙(Rana,nigrovittata)为试验材料,研究其皮肤分泌液中抗菌肽的分子多样性并对其结构和功能进行研究。通过两步分离纯化:Sephadex G-50凝胶过滤层析和反相高压液相层析(RP-HPLC),我们从黑带蛙皮肤分泌物中初步分离到两种抗菌肽,与大多数蛙科来源的抗菌肽一样,它们C末端均有由二硫键形成的七肽环状结构,并因含有多个碱性氨基酸残基而使整个分子带正电荷。通过同源性比对并根据抗菌肽结构特点,将其分别命名为Nigroain-A1和Rugosin-RN1。为了进一步研究黑带蛙皮肤分泌液中抗菌肽的分子多样性,以对应编码蛙科抗菌肽前体信号肽区域从起始密码子开始的7个氨基酸残基的碱基序列为引物,从构建的单个黑带蛙皮肤cDNA文库中筛选抗菌肽的编码基因,我们共筛选到了199个编码抗菌肽的克隆。其中编码不同抗菌肽前体的cDNA序列共167条(Genebank登录号为EU136401-EU136567),这167条序列共编码45个新的抗菌肽。根据其分子结构特点将它们归于15个不同的抗菌肽家族,其中有21个抗菌肽分别属于Rugosin-RN、Gaegurin-6-RN、Temporin-RN和Brevinin-2-RN这4个已知的蛙科来源的抗菌肽家族,其余24个与已知的抗菌肽相似性较低,我们将它们归类到11个新的家族,分别命名为Nigroain-A,-B,-C,-D,-E,-F,-G,-H,-I,-J,-L。这些新型抗菌肽大致可分为两类,线性肽和含分子内二硫键的环状肽,且以环状肽居多,这与以前从蛙科动物分离到大量环状肽而线性肽较少的研究结果相一致。根据家族内及家族间抗菌肽序列及结构的分析结果,我们认为,黑带蛙皮肤抗菌肽的分子多样性可能是通过点突变、碱基的插入或删除、结构域的穿梭以及拼接等多种机制形成的。这15个家族抗菌肽的前体编码单一拷贝的成熟肽,其SPD区域(包括信号肽和前导肽,Signal and Propiece Domain,SPD)都非常保守,而MD区域(成熟肽区域,Maturepeptide,MD)却变化很大,说明这些抗菌肽相关基因形成了一个起源于共同祖先的多基因家族,这也是导致两栖类抗菌肽多样性产生的分子机制之一。对来自黑带蛙皮肤抗菌肽生物功能的分析表明,这些结构多样的抗菌肽,生物功能也表现出多样性。首先它们具有广泛的抗菌谱和高效的抗菌活性,对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌包括两者耐药菌株和真菌具有很强的杀灭作用;还普遍具有促进肥大细胞脱粒、促或抗组胺释放功能;相当一部分抗菌肽具有对自由基的清除能力和对Fe3+的还原力,表现出强烈的抗氧化活性;还发现同时具有丝氨酸蛋白酶抑制剂活性和凝集红细胞活性的抗菌肽;此外,有些抗菌肽还表现出溶血活性。特别是有些抗菌肽类似物已经失去抗菌活性,却表现出促进肥大细胞脱粒或抗组胺释放活性及抗氧化的功能。对这些抗菌肽一级结构的分析表明,氨基酸残基的个别突变对抗菌肽功能的影响非常明显,我们的试验结果显示可以改变抗菌肽抗菌谱的范围,对微生物的敏感程度;可以使溶血活性从强到弱;可以使抗氧化活性由无到有。可以说,单一的突变就可能很大程度上改变抗菌肽的生物活性。我们在黑带蛙皮肤发现一种同时具有抗菌活性,凝集兔血细胞和凝集细菌的功能,以及胰蛋白酶抑制剂活性的小分子多功能活性肽,Nigroain-A1。其仅对革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)具有抗菌活性,但能迅速引起革兰氏阳性、阴性菌及真菌的凝集,对兔红细胞的最小凝集浓度为15μg/ml,对胰蛋白酶的抑制常数为Ki=5.26×10-6M;而且这种小分子活性肽在黑带蛙皮肤内含量丰富。这种多种活性集于一种小分子肽的现象推测主要是作为两栖类的一种集约型的防御机制。根据Nigroain-A1前体结构与抗菌肽前体序列的相似性以及三种生物活性物质都起到防御保护作用这一功能的相似性,我们推测这类抗菌肽和丝氨酸蛋白酶抑制剂以及凝集素可能来自同一祖先,长期的自然选择使它们共同的祖先基因发生分化或者先后进化出诸多不同的功能。Nigroain-A1这种小分子多肽作为多种生物活性的载体对研究基因形成机制、基因进化、生物活性物质构效关系及研制新型临床治疗药物具有重要意义。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 文献综述
  • 1. 两栖类抗菌肽的组织分布
  • 2. 两栖类抗菌肽的理化性质和分子结构
  • 3. 两栖类抗菌肽的多样性
  • 4. 两栖类抗菌肽的应用
  • 5. 两栖类资源的保护与开发
  • 参考文献
  • 第二章 黑带蛙皮肤分泌液中抗菌肽的分离鉴定与分子多样性
  • 前言
  • 材料与方法
  • 1.实验材料
  • 2.样品收集
  • 3.抗菌肽的分离纯化
  • 4.抗菌活性检测
  • 5.抗菌肽结构分析
  • 6.黑带蛙皮肤cDNA的合成
  • 7.黑带蛙皮肤抗菌肽的分子克隆
  • 结果与讨论
  • 1.黑带蛙皮肤抗菌肽的分离纯化
  • 2.黑带蛙皮肤抗菌肽的分子克隆与分子多样性
  • 总结
  • 参考文献
  • 第三章 黑带蛙皮肤抗菌肽的生物功能研究
  • 1. 前言
  • 2. 材料与方法
  • 1.样品合成
  • 2.功能研究
  • 3. 结果与讨论
  • 1.抗菌活性及最小抑菌浓度
  • 2.溶血活性
  • 3.肥大细胞脱粒及组胺释放
  • 4.抗氧化活性
  • 5.红细胞凝集活性
  • 6.胰蛋白酶抑制剂活性
  • 4. 总结
  • 参考文献
  • 第四章 黑带蛙皮肤来源的一种多功能活性肽的研究
  • 一、研究概况
  • 1.两栖动物丝氨酸蛋白酶抑制剂研究概况
  • 2.两栖动物凝集素研究概况
  • 二、试验部分
  • 材料与方法
  • 结果与讨论
  • 总结
  • 参考文献
  • 本研究创新点
  • 攻读博士学位期间发表的学术论文目录
  • 致谢
  • 附录 20种常用氨基酸表
  • 相关论文文献

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