小麦抗条锈病品系Taichung29~*6/Yr5的蛋白质组学分析

小麦抗条锈病品系Taichung29~*6/Yr5的蛋白质组学分析

论文摘要

蛋白质组学是生命科学研究的热点和前沿。蛋白质组学的发展是受技术限制的,也是受技术推动的。目前小麦叶片蛋白质组研究主要采用双向电泳(2-DE)分离和肽质量指纹(PMF)分析技术。探索新的分离、分析方法,可为更深入全面研究小麦叶片蛋白质组提供技术保证。二维液相色谱(2D-LC)与2-DE技术具有互补性,本文探讨了利用2D-LC和纳升级液相色谱串联质谱(Nano LC-MS/MS)技术分离鉴定小麦叶片蛋白质组的新方法。小麦叶片蛋白经提取、脱盐后,进行第一维阴离子交换分离;收集洗脱组分进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析,并对非高丰度蛋白组分进行第二维反相液相色谱分离;随机选择含较低吸收峰的部分组分经胰蛋白酶水解后进行Nano LC-MS/MS分析;将串联质谱数据通过MASCOT搜索NCBInr和EST数据库,并对二级质谱获得的蛋白序列进行MS BLAST分析。结果表明,经第一维阴离子交换色谱分离,收集得到15个组分,其中第15组分包含小麦叶片丰度最高的蛋白——1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO);其余14个组分经反相液相色谱分离,共收集1551个组分,获得1867个色谱峰;随机对其中6个含较低吸收峰的收集组分酶解和Nano LC-MS/MS检测,9种蛋白得到鉴定。小麦条锈病(Puccinia striiformis f.sp.tritici)一直是我国小麦的主要病害,成灾频率高、流行范围广。利用抗病品种是防治小麦条锈病最有效、经济和安全的途径,选育和推广抗病品种成为控制病害流行的首选措施。但由于病原菌生理小种变异快,品种抗性频繁丧失,抗病育种始终处于被动应付状态。本文从蛋白质组学角度出发深入研究小麦对条锈病抗性的分子机理,揭示寄主小麦与病菌之间的互作机制,在小麦抗病品种的培育和利用上具有重要理论和实际意义。由中国农科院植保所培育的小麦抗条锈病品系Taichung29*6/Yr5目前在我国尚未发现对其致病的条锈菌生理小种。本试验联合应用双向电泳、二维液相色谱和质谱技术,以接种当前条锈菌主要流行小种条中32号(CY32)的小麦抗条锈病品系Taichung29*6/Yr5为材料,研究其叶片差异表达蛋白质组,以期发现特异的抗病相关蛋白。经双向电泳分析,初步确定19个差异表达蛋白质点。其中,接种后诱导表达的蛋白质点有8个;上调表达的蛋白质点有10个;下调表达的蛋白质点有1个;未发现表达被抑制的蛋白质点。经二维液相色谱分析,初步确定17个差异色谱峰。其中,接种后新出现的色谱峰有1个;峰面积增加的色谱峰有6个;峰面积减少的色谱峰有9个;缺失的色谱峰有1个。所有差异蛋白组分均进行了质谱分析与数据库检索,11个蛋白质获得鉴定结果,包含8个与植物源蛋白相匹配的蛋白、2个与真菌蛋白高度同源的蛋白和1个与假设蛋白高度同源的蛋白。鉴定蛋白的功能主要涉及植物防卫和植物光合作用。试验结果表明利用2D-LC和Nano LC-MS/MS技术可有效地分离和鉴定小麦叶片蛋白质组;同时采用双向电泳和二维液相色谱技术分析小麦抗条锈病品系Taichung29*6/Yr5接种条锈菌CY32的差异表达蛋白质组,能够更全面的获取差异表达蛋白质信息;本文利用小麦抗条锈病品系Taichung29*6/Yr5开展的比较蛋白质组研究工作,为深入理解小麦与条锈病菌的互作机制提供了重要的基础。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 前言
  • 1.1 文献综述
  • 1.1.1 小麦条锈病的危害与发生
  • 1.1.2 小麦条锈病的防治
  • 1.1.3 小麦抗条锈种质资源研究概况
  • 1.1.4 植物抗病基因的分子生物学研究
  • 1.1.5 小麦抗条锈基因的定位与标记
  • 1.1.6 蛋白质组学的研究背景
  • 1.1.7 蛋白质组学研究策略
  • 1.1.8 蛋白质组学研究的主要技术
  • 1.1.9 蛋白质组学在农业中的应用
  • 1.1.10 小麦条锈病相关蛋白质组学研究
  • 1.2 本论文的研究内容和研究意义
  • 2 小麦叶片蛋白质组的二维液相色谱分离及纳升级液相色谱串联质谱分析
  • 2.1 引言
  • 2.2 材料与方法
  • 2.2.1 植物材料
  • 2.2.2 主要仪器和试剂
  • 2.2.3 部分缓冲液的配制
  • 2.2.4 试验方法
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 小麦叶片蛋白质组的第一维液相色谱分离
  • 2.3.2 小麦叶片蛋白质组的第二维液相色谱分离
  • 2.3.3 小麦叶片蛋白质的纳升级液相色谱串联质谱分析
  • 2.4 讨论
  • 2.4.1 样品制备
  • 2.4.2 低丰度蛋白质的分离检测
  • 2.4.3 与其它二维液相色谱系统的比较
  • 2.4.4 未知基因组物种的蛋白质鉴定
  • 2.4.5 采用二维液相色谱分离小麦叶片蛋白质组的复杂性
  • 3 双向电泳分析接种条锈菌CY32八天后TAICHUNG29*6/YR5 叶片蛋白表达变化
  • 3.1 引言
  • 3.2 材料与方法
  • 3.2.1 寄主材料
  • 3.2.2 条锈病病菌
  • 3.2.3 主要仪器和试剂
  • 3.2.4 部分溶液的配制
  • 3.2.5 试验方法
  • 3.3 结果与分析
  • 3.3.1 Taichung29*6/Yr5 接种条锈菌 CY32 八天后叶片症状
  • 3.3.2 Taichung29*6/Yr5 接种条锈菌 CY32 八天后叶片蛋白的双向电泳分析
  • 3.3.3 差异表达蛋白质点的分离
  • 3.3.4 差异表达蛋白质点的鉴定
  • 3.4 讨论
  • 3.4.1 小麦条锈病相关蛋白质组的双向电泳分析
  • 3.4.2 双向电泳的样品制备
  • 3.4.3 双向电泳分析小麦叶片蛋白质组的复杂性
  • 3.4.4 差异蛋白质的鉴定率
  • 3.4.5 鉴定蛋白质的分析
  • 4 二维液相色谱分析接种条锈菌CY32八天后TAICHUNG29*6/YR5 叶片蛋白表达变化
  • 4.1 引言
  • 4.2 材料与方法
  • 4.2.1 寄主材料
  • 4.2.2 条锈病病菌
  • 4.2.3 主要仪器和试剂
  • 4.2.4 部分缓冲液的配制
  • 4.2.5 试验方法
  • 4.3 结果与分析
  • 4.3.1 第一维液相色谱分离结果
  • 4.3.2 第二维液相色谱分离图谱比较结果
  • 4.3.3 差异色谱峰的纳升级液相色谱串联质谱分析
  • 4.4 讨论
  • 4.4.1 小麦条锈病相关蛋白质组的二维液相色谱分析
  • 4.4.2 差异蛋白质的鉴定率
  • 4.4.3 鉴定蛋白质的分析
  • 5 全文总结
  • 5.1 结论
  • 5.2 关于本工作深入进行的几点想法
  • 致谢
  • 参考文献
  • 攻读博士学位期间发表的学术论文
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  

    小麦抗条锈病品系Taichung29~*6/Yr5的蛋白质组学分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢