汪豪英:菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析论文

汪豪英:菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析论文

本文主要研究内容

作者汪豪英,刘志远,王晓武,武剑,张合龙,夏志兰,徐兆生,钱伟(2019)在《菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析》一文中研究指出:菠菜为典型的雌雄异株植物,少数植株表现为雌雄同株。为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点,对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析,同时进行测序深度为10×的重测序。重测序共获得了3 420 496个SNP,过滤后得到1 621 970个多态性高的SNP位点。利用高质量的SNP对菠菜雌雄同株的性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。利用压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)在菠菜4号染色体上检测到1个强关联区域。基于强关联信号SNP位点LD值(31.2kb)的大小,将控制菠菜雌雄同株的基因X~m定位在64.6kb的区间内。该范围内存在3个基因:Spo24600、Spo24601和Spo24602。该研究在关联区域内开发了KASP标记,可以有效用于菠菜雌雄同株的鉴定。

Abstract

bo cai wei dian xing de ci xiong yi zhu zhi wu ,shao shu zhi zhu biao xian wei ci xiong tong zhu 。wei le wa jue kong zhi bo cai ci xiong tong zhu de ji yin wei dian ,dui 82fen bo cai gao dai zi jiao ji de xing xing jin hang diao cha fen xi ,tong shi jin hang ce xu shen du wei 10×de chong ce xu 。chong ce xu gong huo de le 3 420 496ge SNP,guo lv hou de dao 1 621 970ge duo tai xing gao de SNPwei dian 。li yong gao zhi liang de SNPdui bo cai ci xiong tong zhu de xing zhuang jin hang le quan ji yin zu guan lian fen xi (GWAS)。li yong ya su hun ge xian xing mo xing (compress mixed linear model,cMLM)zai bo cai 4hao ran se ti shang jian ce dao 1ge jiang guan lian ou yu 。ji yu jiang guan lian xin hao SNPwei dian LDzhi (31.2kb)de da xiao ,jiang kong zhi bo cai ci xiong tong zhu de ji yin X~mding wei zai 64.6kbde ou jian nei 。gai fan wei nei cun zai 3ge ji yin :Spo24600、Spo24601he Spo24602。gai yan jiu zai guan lian ou yu nei kai fa le KASPbiao ji ,ke yi you xiao yong yu bo cai ci xiong tong zhu de jian ding 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自园艺学报的汪豪英,刘志远,王晓武,武剑,张合龙,夏志兰,徐兆生,钱伟,发表于刊物园艺学报2019年08期论文,是一篇关于菠菜论文,全基因组论文,关联分析论文,雌雄同株论文,园艺学报2019年08期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自园艺学报2019年08期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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