二化螟取食胁迫下的水稻转录组分析及相关基因OsHI-LOX的功能解析

二化螟取食胁迫下的水稻转录组分析及相关基因OsHI-LOX的功能解析

论文摘要

解析植食性昆虫为害诱导的植物防御反应的分子机理一直是近几年来昆虫与植物互作关系研究中的一个热点。至今,已在拟南芥、烟草、蕃茄等双子叶植物中开展了较多的研究,但作为单子叶模式植物的水稻,在这方面的研究还很少。为此,本文利用Affymetrix公司的57 K GeneChip(?) Rice Genome Array,分析了二化螟取食24 h后水稻转录组的变化,并对二化螟诱导的一个差异表达基因水稻脂氧合酶基因OsHI-LOX在水稻诱导防御反应中的作用进行了的研究。结果如下:二化螟取食导致4545个(大约占水稻全基因的8%)水稻基因的转录水平发生变化,其中表达量上/下调的基因分别为2124和2421个。这些水稻基因涉及新陈代谢、能量生成、信号转导、植物激素合成、转录调控和逆境反应等18个功能类别。与在拟南芥、烟草等双子叶植物中所报道的相类似,二化螟取食抑制了绝大部分水稻叶绿体光合系统及光合磷酸化电子传递相关基因的表达,导致叶绿素降解,光合作用能力下降;而碳水化合物代谢途径,如糖酵解(glycolysis)、糖质异生(gluconeogenesis)、乙醛酸循环(glyoxylate cycle)和三羧酸循环(TCA)等相关基因的表达水平显著增强,即水稻的能量产生过程发生改变,由以光合磷酸化为主的ATP合成的方式转为以氧化磷酸化为主的ATP合成的方式。二化螟取食还调控了与众多植物激素如茉莉酸(JA)、水杨酸(SA)、乙烯(Ethylene)、生长素(Auxin)、脱落酸(ABA)、分裂素(CK)和赤霉素(GA)等合成及其信号转导途径的基因,但与在其它植物中发现的一样,参与二化螟诱导的水稻防御反应的植物激素主要也是茉莉酸、水杨酸和乙烯,这些激素的合成及其信号转导相关基因大多数是被诱导表达。二化螟取食诱导的水稻防御反应还涉及到很多胞内信号转导途径,如Ca2+信号途径(36个基因被调控)、G-蛋白信号途径(39个)、蛋白磷酸酯酶(21个)、蛋白激酶(217个)、磷脂酰肌醇信号(9个)等。此外,有42个家族的289个转录因子参与二化螟诱导的水稻防御反应,其中有13个家族如AS2、C2C2-Dof、EIL、GRAP-G2-Like、GRAS、HSF、MBF1、NAC、PLATZ、SRS、ULT、WRKY和ZIM的80%以上成员的表达水平是上调的。研究结果还发现,二化螟取食与很多其他逆境胁迫因子在诱导水稻防御反应方面存在复杂的相互作用,很多生物与非生物逆境因子(病原物侵染、氧胁迫、热胁迫、冷冻、营养缺乏等)所调控的基因,也被二化螟取食调控。因此,二化螟取食诱导的水稻防御反应是水稻整体在生理生化以及代谢等方面的一个重建过程,是由以生长发育为主向以防御为主的一种转移。OsHI-LOX基因全长2873 bp,包括2775 bp长的编码序列(ORF)以及一段14 bp 5’端非编码序列(5’-UTR)及84 bp的3’端非编码序列(3’-UTR),共编码924个氨基酸,预测分子量为102.82 kDa。OsHI-LOX蛋白定位于叶绿体,二化螟取食、JA处理和机械损伤均能增加OsHI-LOX基因的表达水平。反义抑制OsHI-LOX表达导致二化螟取食诱导的茉莉酸(JA)和胰蛋白酶抑制剂(TrypPI)含量下降,并降低水稻对两种咀嚼式口器害虫(二化螟和稻纵卷叶螟)的抗性;外用JA处理,可以恢复反义抑制品系中TrypPI的含量及对稻纵卷叶螟的抗性。与此相反,反义抑制OsHI-LOX表达却增强水稻对刺吸式口器害虫(褐飞虱)的抗性,导致褐飞虱成虫对稻株的选择性、产卵量以及取食量下降,取食反义抑制OsHI-LOX水稻的褐飞虱若虫成活率也下降。这种抗性的产生,与褐飞虱为害时反义抑制品系水稻产生的高浓度的H2O2和SA有关,从而引起水稻的类似过敏性细胞死亡(HR)。上述结果表明,OsHI-LOX基因参与了水稻虫害诱导的茉莉酸的合成,并且在调控水稻对咀嚼式口器和刺吸式口器害虫的防御反应中发挥了重要作用。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1.植物的诱导抗虫反应及其相关的主要信号转导途径
  • 1.1 直接防御和间接防御
  • 1.2 防御化合物
  • 1.3 防御信号分子
  • 2.茉莉酸信号转导途径研究进展
  • 2.1 植物茉莉酸类物质的合成途径
  • 2.2 茉莉酸类物质的生物学功能
  • JA在植物生长发育中的作用
  • 抑制光合作用
  • 在非生物胁迫反应中的作用
  • 抗虫反应中的作用
  • 抗病防御反应中的作用
  • 2.3 水稻脂氧合酶基因LOX研究进展
  • 3.基因芯片在植物诱导抗虫反应研究中的应用
  • 3.1 差异表达基因研究方法
  • 3.2 基因芯片技术在植物诱导抗虫反应研究中的应用
  • 4.基因功能鉴定的主要方法
  • 5.本文的研究思路与目的意义
  • 5.1 本研究目的和意义
  • 5.2 本研究的技术路线
  • 第二章 二化螟幼虫取食诱导的水稻差异表达基因的分析
  • 2.1 前言
  • 2.2 材料与方法
  • 2.2.1 供试水稻
  • 2.2.2 供试昆虫
  • 2.2.3 基因芯片
  • 2.2.4 试剂来源和实验仪器
  • 2.2.5 水稻处理
  • 2.2.6 水稻总RNA的提取
  • 2.2.7 cDNA合成及PCR反应
  • 2.2.8 芯片检测和数据处理
  • 2.2.9 基因芯片实验重复性评价
  • 2.2.10 Northern杂交检测
  • 2.2.11 差异基因功能分类
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 SSB取食造成大约8%水稻基因转录水平发生变化
  • 2.3.2 Northern杂交验证芯片数据
  • 2.3.3 差异表达基因功能分类
  • 2.3.4 SSB取食影响JA、SA、Ethylene等植物激素和活性氧种信号途径相关基因的表达
  • 2.3.5 SSB调控的胞内信号传导途径
  • 2.3.6 SSB取食调控的转录因子
  • 2.3.7 SSB取食影响水稻能量生成相关基因
  • 2.3.8 SSB取食调控的植物主代谢和次生代谢基因
  • 2.3.9 SSB取食调控的防御相关基因
  • 2.4 讨论
  • SSB取食诱导的水稻防御反应涉及到水稻众多基因转录水平的变化,是水稻整体生理生化以及代谢等方面的一个重建过程
  • 植物激素在SSB防御反应中的作用
  • 诱导防御反应与能量合成
  • 对植食性昆虫防御与其他胁迫反应信号网络部分重叠
  • 第三章 二化螟诱导的OsHI-LOX基因的克隆及反义抑制突变体构建
  • 3.1 前言
  • 3.2 材料和方法
  • 3.3 结果与分析
  • 3.3.1 水稻OsHI-LOX基因克隆
  • 3.3.2 OsHI-LOX蛋白结构分析
  • 3.3.3 OsHI-LOX系统树分析
  • 3.3.4 OsHI-LOX编码蛋白的亚细胞定位
  • 3.3.5 机械损伤、二化螟取食、JA处理诱导OsHI-LOX基因表达
  • 3.3.6 OsHI-LOX反义抑制植物转化双元表达载体的构建
  • 3.3.7 OsHI-LOX反义抑制水稻突变体纯合子的筛选
  • 3.3.8 Southern杂交鉴定T-DNA拷贝数
  • 3.4 讨论
  • 第四章 基因OsHI-LOX的功能分析
  • 4.1 前言
  • 4.2 材料和方法
  • 4.3 结果与分析
  • 2.3.10 反义抑制OsHI-LOX对水稻生长发育的影响
  • 2.3.11 反义抑制OsHI-LOX降低水稻诱导的JA和TrypPI含量
  • 2.3.12 反义抑制OsHI-LOX降低对咀嚼式口器害虫的抗性
  • 2.3.13 反义抑制OsHI-LOX增加水稻对刺吸口器BPH的抗性
  • 2O2含量升高'>2.3.14 反义抑制OsHI-LOX导致BPH取食后出现过敏性反应及水稻SA和H2O2含量升高
  • 4.4 讨论
  • 第五章 本文小结和今后研究
  • 结论与讨论
  • 本文创新点
  • 今后的研究方向
  • 附表(图)
  • 参考文献
  • 相关论文文献

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