小麦产量相关性状的分子遗传分析及抗赤霉病侵染QTL的分子标记开发

小麦产量相关性状的分子遗传分析及抗赤霉病侵染QTL的分子标记开发

论文摘要

小麦作为世界最主要的粮食作物之一,在粮食生产中具有举足轻重的作用。提高单位面积产量一直是小麦育种的最基本目标。穗粒数是小麦产量构成因素之一。为了解穗长、小穗数、可育小穗数、不育小穗数和穗密度等穗粒数相关性状的遗传基础,本研究利用‘南大2419’x‘望水白’的136个重组自交系和由这些株系相互杂交得到的“永久F2”(IF2)群体,对上述性状进行了QTLs定位,并探讨了它们的遗传方式及两位点间的互作。利用重组自交系构建的覆盖全基因组约3300 cM的遗传图谱被用于QTL作图。定位分析表明,针对这五个性状分别有3、5、2、2和6个在至少二个环境中都能检测到的QTLs。穗密度QTLs一般与小穗数QTL QSpn.nau-5A或与稳长QTLs位于相同的区间,在所有穗密度QTL中,只有一个例外。位于7D染色体的Xcfd46~Xwmc702区间与除不育小穗数外的其它四个性状都相关,并表现为最大的效应。穗密度可能受不同的机制调控,因为不是所有穗密度QTLs区间都与小穗数和穗长相关。我们发现穗长QTLs区间几乎不与小穗数QTLs区间重叠,这种现象同样存在于可育小穗数QTLs与不育小穗数QTLs间。每个性状都有来自于双亲的优良等位位点。此外,所研究性状的QTLs存在加性和超显性遗传模式及两位点上位性互作,表明这些性状的遗传机制复杂。研究结果有助于在育种中更有效地利用望水白和南大2419这两个特殊的种质资源,为小麦产量育种服务。粒重是最后形成的一个小麦产量构成因素。本研究利用南大2419x望水白的136个株系的重组自交系群体和由其衍生的永久F2群体对粒重进行了QTL定位并探讨其遗传方式和上位性互作,同时利用该重组自交系群体对株高以及旗叶长、宽、面积、长宽比等叶部形态学性状进行了QTLs定位并探讨它们与粒重的相关性。QTL作图时利用重组自交系构建的覆盖全基因组约3300cM的遗传图谱。共检测到6个粒重QTLs,在所有三个环境中都可检测到的粒重QTLs位于4B和5A染色体。加性效应、显性效应以及上位性互作都在粒重遗传中发挥重要作用。在所有两个环境中都可检测到的株高QTLs位于1A和4B染色体。4B粒重和株高QTLs区间相同。在定位的16个旗叶性状QTLs中,3D和4A旗叶长QTL分别与旗叶面积和旗叶长宽比QTL区间相同,7A旗叶长QTL区间与旗叶面积和旗叶长宽比都相关,5A旗叶宽QTL区间与旗叶长宽比相关,此外该区间与5A粒重QTL区间相近。除粒重和旗叶面积的增效等位位点都来自于南大2419外,其它性状都有来自于双亲的增效等位位点。结果表明基因的多效性或紧密连锁可以解释这些性状间相关的原因。分蘖角度是一个重要的形态学性状,也是株型育种中的重要性状。利用ITMI群体的115个株系,定位了4个分蘖角度QTLs,分别位于染色体3B、4D、6D和7D染色体,解释9.7%~22.6%的表型变异。双亲都提供了增加分蘖角度的等位位点。Qfhi.nau-5A是位于5A染色体短臂上一个主效的抗赤霉病侵染QTL位点。利用已定位于小麦第5群短臂ESTs及该染色体区段与水稻12染色体长臂的共线性关系,共设计了216对EST-SSR和EST-STS标记,27个在南大2419和望水白间检测到了多态性,6个被定位在5AS上。单向方差分析表明有4个标记与抗侵染性显著相关,可解释高达25%的表型变异。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 文献综述
  • 第一节 禾本科比较基因组学研究进展
  • 一、比较基因组学概述
  • 二、水稻和小麦基因组研究进展
  • (一) 水稻基因组研究进展
  • (二) 小麦基因组研究进展
  • 1、遗传图谱
  • 2、基于缺失区的物理图谱
  • 3、ESTs计划
  • 三、禾本科作物基因组结构和功能的比较
  • 第二节 数量性状的遗传分析
  • 一、数量性状的遗传模型
  • 二、数量性状的研究方法
  • (一) 基本要素
  • (二) 分析方法
  • (三) QTL与环境互作
  • (四) 上位性
  • (五) QTLs的精细定位与克隆
  • 第三节 小麦农艺性状的遗传分析
  • 一、产量构成因素
  • (一) 穗数
  • (二) 穗粒数
  • (三) 粒重
  • 二、株型育种
  • 三、产量相关的生理和发育性状
  • 四、熟期
  • 2群体对小麦五个穗部相关性状的分子遗传分析'>第二章 利用重组自交系和永久F2群体对小麦五个穗部相关性状的分子遗传分析
  • 引言
  • 材料与方法
  • 一、植物材料
  • 二、表型鉴定
  • 三、统计分析
  • 四、QTL分析
  • 五、遗传模型
  • 六、上位性互作
  • 结果与分析
  • 一、表型分析
  • 二、QTL定位和遗传模式分析
  • 1、穗长
  • 2、小穗数
  • 3、可育小穗数
  • 4、不育小穗数
  • 5、穗密度
  • 三、上位性
  • 讨论
  • 一、穗长、小穗数和穗密度QTLs
  • 二、可育小穗数和不育小穗数 OTLs
  • 三、基因内和基因间的互作
  • 第三章 粒重、株高和旗叶性状的分子遗传分析
  • 引言
  • 材料与方法
  • 一、植物材料
  • 二、表型鉴定
  • 三、统计分析和QTL分析
  • 四、遗传模型分析
  • 五、上位性互作
  • 结果与分析
  • 一、表型分析
  • 二、QTL定位和遗传模型分析
  • 1、粒重
  • 2、株高
  • 3、旗叶性状
  • 三、粒重和株高QTL的上位性检测
  • 讨论
  • 一、粒重和株高
  • 二、粒重与旗叶
  • 第四章 小麦分蘖角度的QTLs定位
  • 引言
  • 材料与方法
  • 一、植物材料
  • 二、表型鉴定
  • 三、统计分析
  • 四、QTL分析
  • 结果与分析
  • 一、表型分析
  • 二、区间作图分析
  • 讨论
  • 第五章 小麦抗赤霉病侵染QTL的分子标记开发
  • 引言
  • 材料与方法
  • 一、试验材料
  • 二、引物设计
  • 三、PCR
  • 四、赤霉病鉴定
  • 五、统计分析
  • 六、图谱构建
  • 结果与分析
  • 一、利用定位于5AS缺失区的ESTs开发标记
  • 二、利用与水稻预测基因同源的小麦ESTs开发标记
  • 三、与抗赤霉病侵染QTL的关系
  • 讨论
  • 参考文献
  • 全文总结
  • 全文创新点
  • 发表论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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