应用DNA和同工酶遗传标记检测长江3个草鱼群体的遗传多样性

应用DNA和同工酶遗传标记检测长江3个草鱼群体的遗传多样性

论文摘要

本研究应用mtDNA D-loop区段的PCR-RFLP、RAPD以及同工酶技术,检测长江流域的天然草鱼的遗传多样性,并比较了不同群体的遗传差异。1.应用PCR技术对3个群体141尾草鱼mtDNA的D-loop区段进行扩增,用12种核酸内切限制酶酶切。结果显示:扩增出的140尾试验鱼的mtDNA D-loop区段为1.6kbp,监利群体中的1尾为1.8kbp,个体间存在长度变异现象;6种限制酶具有酶切位点,共检测到2种单倍型,其中监利群体中有长度变异的1尾为一种单倍型,另外140尾为另一种单倍型;邗江和九江两群体内的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均为0,而监利群体内分别为0.0465、0.00180;监利群体与邗江(或九江)群体间Rogers遗传距离为0.0403;x2检验结果显示三个群体间的遗传差异不显著(P>0.05)。由此表明草鱼mtDNA D-loop区段的遗传多样性很低。2.使用12种随机引物对长江流域3个草鱼群体进行了RAPD分析。邗江、九江和监利三个群体内的电泳带共有度分别为0.9713、0.9855和0.9560,由高到低依次为九江、邗江、监利,即群体内变异程度由低到高依次为九江、邗江、监利。3个群体间的遗传距:邗江和九江之间最大,为0.0489;邗江和监利之间次之,为0.0483;九江和监利之间最小,为0.0453;三个草鱼群体间的平均遗传距为0.0472。表明3个草鱼群体间的遗传多样性很低。3.在同工酶的研究中,对84尾草鱼(邗江45尾,九江39尾)的8种同工酶的电泳结果进行了分析,在检测到的12个基因座位中,2个座位为多态。邗江群体的多态基因座位为a-GPD*、GPI-2*,而九江群体只有a-GPD*基因座位出现变异。邗江和九江群体的多态座位比例分别为0.167、0.083;邗江和九江群体的平均杂合度观察值分别为0.0204、0.0064;平均杂合度预期值分别为0.0192、0.0062。因此邗江群体内的多样性高于九江群体内。x2检验结果显示九江群体内的多态基因座位的基因型分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,表明了该群体为随机交配的繁殖群体,而邗江群体偏离了Hardy-Weinberg遗传平衡。群体间的x2检验结果显示GPI-2*基因座位在群体间的差异不显著,a-GPD*基因座位在两群体间差异显著。两个草鱼群体间的遗传一致度为0.99928,Nei遗传距为0.00072,表明两群体间遗传多样性很低。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 目录
  • 第一章 草鱼的研究现状以及本研究的目的和意义
  • 1.1 鱼类遗传多样性的研究
  • 1.1.1 遗传多样性的概念
  • 1.1.2 形态学多样性
  • 1.1.3 细胞学水平——染色体多样性
  • 1.1.4 蛋白质水平的多样性
  • 1.1.5 DNA水平的多样性
  • 1.2 鱼类遗传多样性研究中常用的遗传标记方法
  • 1.2.1 同工酶标记
  • 1.2.2 分子遗传标记
  • 1.3 研究鱼类遗传多样性的意义
  • 1.4 草鱼的研究现状
  • 1.4.1 草鱼简介及分类地位
  • 1.4.2 草鱼遗传多样性的研究现状
  • 1.5 本试验的总体设计和研究策略
  • 第二章 线粒体DNA D-LOOP区段的限制性片段长度多态性分析
  • 2.1 材料和方法
  • 2.1.1 试验鱼
  • 2.1.2 草鱼DNA的提取与浓度测定
  • 2.1.3 线粒体D-loop区段的RFLP
  • 2.1.4 内切酶酶切及凝胶电泳
  • 2.1.5 数据处理和分析
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 个体间的mtDNA D-loop区段长度多态性
  • 2.2.2 RFLP分析
  • 2.2.3 遗传多样性指数及UPGMA聚类图
  • 2.3 讨论
  • 2.3.1 草鱼mtDNA个体间的长度变异分析
  • 2.3.2 草鱼群体的遗传多样性分析
  • 第三章 应用RAPD检测技术分析草鱼的遗传多样性
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 试验材料
  • 3.1.2 试验方法
  • 3.2 结果
  • 3.2.1 群体内的遗传相似性
  • 3.2.2 群体间的遗传相似性及遗传距
  • 3.3 分析与讨论
  • 3.3.1 群体内的遗传变异程度
  • 3.3.2 群体间的遗传相似性分析
  • 第四章 应用同工酶技术进行遗传多样性分析
  • 4.1 材料与方法
  • 4.1.1 试验材料
  • 4.1.2 电泳方法
  • 4.1.3 组化染色
  • 4.1.4 干胶的制作
  • 4.1.5 电泳结果记录
  • 4.1.6 遗传变异数据的统汁分析
  • 4.2 结果
  • 4.2.1 各种同工酶的电泳图谱
  • 4.2.2 各群体的等位基因频率
  • 4.2.3 群体内遗传变异
  • 4.2.4 群体间遗传差异的比较
  • 4.3 讨论
  • 4.3.1 两群体同工酶的遗传变异程度
  • 4.3.2 群体内的遗传差异
  • 4.3.3 群体间的遗传差异
  • 第五章 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录1:表格索引
  • 附录2:图索引
  • 附录3:已接收论文
  • 相关论文文献

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