三维化学计量学方法和定量构效关系应用于药学的若干基础研究

三维化学计量学方法和定量构效关系应用于药学的若干基础研究

论文摘要

在化学计量学的理论和方法体系中,三维数据分析和定量构效关系是两个非常重要的研究领域,本论文通过对这两个领域的研究热点的追踪分析,选取了其中几个重要的问题进行了探索和应用研究,主要涉及以下几个方面:一、三维化学数据解析的方法和应用研究(第一章-第五章):三维化学数据解析方法因其能够在未知干扰存在下实现对感兴趣成分的定性定量分析而受到广泛的重视。传统的三维数据解析方法如平行因子分析由于收敛速度慢,容易出现衰退解,对拟合模型需要的化学秩敏感等不足影响了它的应用。近年来发展的交替三线性分解算法(ATLD)克服了传统平行因子分析算法收敛速度慢、对化学秩预估计值不敏感等不足,为三维数据分析算法在化学中的应用注入了新的生机。但是交替三线性分解算法在解决小样品量测时可能出现求解不稳定问题,为了弥补这一不足,同时能够保留其优点,本文结合平行因子-交替最小二乘算法,提出了交替不对称三线性分解算法(AATLD)。模拟的和真实的三维二阶校正数据试验均显示出该算法在浓度模出现比较严重的共线性时可以取得与平行因子分析方法相媲美的结果,同时其收敛速度远远快于平行因子分析算法,而且作为一种不对称算法,相对于交替三线性分解算法而言,可以很好地解决小样品校正问题,并在一定程度上能够克服二阶衰退,从而实现在现代分析化学中实际复杂体系的直接快速定量分析。在应用一种三维化学数据解析算法处理三维数据之前,首先要做的就是估计三维化学数据的化学秩。同二维数据的秩估计相比,三维化学的秩估计更加困难。基于已有的三维数据秩估计方法存在的不足,结合直接三线性分解的思想,代替如传统的利用特征值进行秩估计的思路,提出了伪样品特征矢量提取和投影技术估计三维数阵化学秩的新方法。模拟的和真实的三维二阶校正数据显示该方法运算速度快、结果可靠、不需要人为设定判别标准等优点。由于三维试验数据来源较为复杂,任何一种秩估计方法都不能保证在所有的情况下都能给出复杂体系的正确因子数,本文又提出了利用简单的线性变换方法结合蒙特卡罗技术提出了秩估计方法。该方法利用两个子空间,一个来源于原始三维数据本身,一个由原始三维数据经线性变化后产生,结合投影技术估计三维数据的化学秩。为了使结果更稳健,应用蒙特卡罗方法,用多组子空间确定复杂体系的化学秩。同其他三维数阵秩估计方法相比,该算法具有计算量小、运算速度快、结果更可靠,不需要事先制定判别标准等优点。在体液中的药物分析是现代生命医学领域面临的一个重要的问题,传统方法采用色谱分离技术来实现这一目的,通常情况下通过调整色谱柱或者色谱条件分

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第1章 绪论
  • 1.1 张量校正
  • 1.2 定量构效关系
  • 1.3 本论文的研究工作
  • 1.3.1 三维化学数据分析及应用(第二章-第六章)
  • 1.3.2 定量构效关系在药物设计中的应用研究(第七章-第八章)
  • 第2章 三维数据结构及其三线性成分分解模型
  • 2.1 三维化学数据的产生及其结构
  • 2.2 三维数据的秩与三线性成分模型
  • 2.2.1 三线性成分模型
  • 2.2.2 三维数据的秩
  • 2.3 三维数据的三线性分解成分模型及平行因子分析法
  • 第3章 交替不对称三线性分解算法
  • 3.1 前言
  • 3.2 理论
  • 3.2.1 三线性分解成分模型
  • 3.2.2 交替不对称三线性分解(AATLD)算法
  • 3.3 实验
  • 3.3.1 模拟数据
  • 3.3.2 实际数据
  • 3.4 结果与讨论
  • 3.4.1 模拟数据
  • 3.4.2 实际数据
  • 3.5 结论
  • 第4章 基于伪样品提取和投影技术估计三维数据的化学秩
  • 4.1 前言
  • 4.2 理论
  • 4.2.1 三线性成分模型
  • 4.2.2 算法
  • 4.3 实验
  • 4.3.1 模拟数据
  • 4.3.2 实际数据
  • 4.4 结果与讨论
  • 4.4.1 模拟的HPLC-DAD 数据
  • 4.4.2 模拟的三维荧光数据数据
  • 4.4.3 真实的HPLC-DAD 数据
  • 4.4.4 真实的荧光数据
  • 4.5 结论
  • 第5章 用一个简单的线性转换结合蒙特卡罗模拟方法估计三维数据的化学秩
  • 5.1 前言
  • 5.2 理论和算法
  • 5.2.1 三线性成分模型
  • 5.2.2 算法
  • 5.3 实验
  • 5.3.1 模拟的具有均方差和异方差的三维数据
  • 5.3.2 模拟的高共线性三维荧光数据
  • 5.3.3 真实的HPLC-DAD 数据
  • 5.3.4 真实的激发发射矩阵荧光(EX-EM)数据
  • 5.4 结果与讨论
  • 5.4.1 模拟的均方差和异方差的三维数据阵列
  • 5.4.2 模拟的高共线性三维荧光数据
  • 5.4.3 真实的HPLC-DAD 数据
  • 5.4.4 真实的激发发射矩阵荧光(EX-EM)数据
  • 5.5 结论
  • 第6章 二阶校正方法联合HPLC-DAD 同时定量测定人血清中的万古霉素和头孢氨苄
  • 6.1 前言
  • 6.2 理论
  • 6.2.1 三线性成分模型
  • 6.2.2 PARAFAC-ALS 算法
  • 6.2.3 自加权交替三线性分解算法(SWATLD)算法
  • 6.2.4 交替不对称三线性分解算法(AATLD)算法
  • 6.3 试验部分
  • 6.3.1 试剂
  • 6.3.2 血清样品处理
  • 6.3.3 HPLC 仪器和条件
  • 6.4 结果与讨论
  • 6.4.1 因子数的选择
  • 6.4.2 PARAFAC-ALS, SWATLD 和 AATLD 分析
  • 6.4.3 分析品质指数
  • 6.5 结论
  • 第7章 咪唑苯二氮类化合物和α6 苯二氮受体的定量构效关系研究
  • 7.1 前言
  • 7.2 理论
  • 7.2.1 改进的粒子群的优化
  • 7.2.2 基于粒子群优化算法的最优逐区变量提取
  • 7.3 数据库和描述
  • 7.3.1 数据
  • 7.3.2 描述符
  • 7.4 结果和讨论
  • 7.5 结论
  • 第8章 非竞争性AMPA 受体拮抗剂2,3-苯并二氮-4(硫)酮类衍生物的定量构效关系研究
  • 8.1 前言
  • 8.2 理论
  • 8.2.1 蚁群优化算法
  • 8.2.2 改进的蚁群优化算法
  • 8.2.3 目标函数
  • 8.3 非竞争性AMPA 受体拮抗剂活性数据
  • 8.4 结果与讨论
  • 8.5 结论
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录A 攻读学位期间发表及完成的论文目录
  • 致谢
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