卢世雄:葡萄Trihelix转录因子家族生物信息及其基因表达分析论文

卢世雄:葡萄Trihelix转录因子家族生物信息及其基因表达分析论文

本文主要研究内容

作者卢世雄,王萍,何红红,梁国平,马宗桓,乔亚丽,吴玉霞,陈佰鸿,毛娟(2019)在《葡萄Trihelix转录因子家族生物信息及其基因表达分析》一文中研究指出:利用生物信息学分析、预测葡萄Trihelix转录因子家族基因的特性与功能,为葡萄抗逆基因的挖掘和利用提供理论依据。以‘红地球’葡萄(Vitis vinifera)试管苗为试验材料,对葡萄Trihelix转录因子家族进行理化性质、染色体定位、二级结构预测、亚细胞定位、基因结构分析、motif以及基因芯片表达分析,并利用qRT-PCR技术分析该家族基因在400 mmol·L-1 NaCl、100 mmol·L-1 ABA和10%PEG逆境下的表达情况。结果表明,该转录因子家族在葡萄基因组中总共有27个成员,分布于11条染色体上,其中有10个成员集中分布在第14号和17号染色体上;氨基酸残基为175~880个,大多数具有疏水性。亚细胞定位分析表明,该基因家族主要存在于细胞核中。结构域分析显示,同一亚家族蛋白保守域结构高度相似。基因芯片表达结果显示,非生物胁迫下,叶片中VvTrihelix6在PEG处理24 h后与对照相比呈显著上调趋势,当用NaCl处理4h和24h后,与叶片对照相比有下调表达趋势;用ABA处理果实3d后,该基因在果实中呈下调表达,处理10d后变化不明显。叶片中VvTrihelix19转录因子经PEG、NaCl和冷胁迫处理24 h后明显下调;果实用ABA处理3 d和10 d后均有明显下调趋势。qRT-PCR分析表明该转录因子家族所有基因对逆境胁迫具有响应作用,但是,不同成员在不同逆境胁迫下的响应程度存在一定的差异。转录因子VvTrihelix6在400 mmol·L-1 NaCl和100 mmol·L-1ABA处理下表达量极显著高于对照,分别是对照的15倍和8倍;VvTrihelix19只在10%PEG胁迫处理后呈显著上调表达。

Abstract

li yong sheng wu xin xi xue fen xi 、yu ce pu tao Trihelixzhuai lu yin zi jia zu ji yin de te xing yu gong neng ,wei pu tao kang ni ji yin de wa jue he li yong di gong li lun yi ju 。yi ‘gong de qiu ’pu tao (Vitis vinifera)shi guan miao wei shi yan cai liao ,dui pu tao Trihelixzhuai lu yin zi jia zu jin hang li hua xing zhi 、ran se ti ding wei 、er ji jie gou yu ce 、ya xi bao ding wei 、ji yin jie gou fen xi 、motifyi ji ji yin xin pian biao da fen xi ,bing li yong qRT-PCRji shu fen xi gai jia zu ji yin zai 400 mmol·L-1 NaCl、100 mmol·L-1 ABAhe 10%PEGni jing xia de biao da qing kuang 。jie guo biao ming ,gai zhuai lu yin zi jia zu zai pu tao ji yin zu zhong zong gong you 27ge cheng yuan ,fen bu yu 11tiao ran se ti shang ,ji zhong you 10ge cheng yuan ji zhong fen bu zai di 14hao he 17hao ran se ti shang ;an ji suan can ji wei 175~880ge ,da duo shu ju you shu shui xing 。ya xi bao ding wei fen xi biao ming ,gai ji yin jia zu zhu yao cun zai yu xi bao he zhong 。jie gou yu fen xi xian shi ,tong yi ya jia zu dan bai bao shou yu jie gou gao du xiang shi 。ji yin xin pian biao da jie guo xian shi ,fei sheng wu xie pai xia ,xie pian zhong VvTrihelix6zai PEGchu li 24 hhou yu dui zhao xiang bi cheng xian zhe shang diao qu shi ,dang yong NaClchu li 4hhe 24hhou ,yu xie pian dui zhao xiang bi you xia diao biao da qu shi ;yong ABAchu li guo shi 3dhou ,gai ji yin zai guo shi zhong cheng xia diao biao da ,chu li 10dhou bian hua bu ming xian 。xie pian zhong VvTrihelix19zhuai lu yin zi jing PEG、NaClhe leng xie pai chu li 24 hhou ming xian xia diao ;guo shi yong ABAchu li 3 dhe 10 dhou jun you ming xian xia diao qu shi 。qRT-PCRfen xi biao ming gai zhuai lu yin zi jia zu suo you ji yin dui ni jing xie pai ju you xiang ying zuo yong ,dan shi ,bu tong cheng yuan zai bu tong ni jing xie pai xia de xiang ying cheng du cun zai yi ding de cha yi 。zhuai lu yin zi VvTrihelix6zai 400 mmol·L-1 NaClhe 100 mmol·L-1ABAchu li xia biao da liang ji xian zhe gao yu dui zhao ,fen bie shi dui zhao de 15bei he 8bei ;VvTrihelix19zhi zai 10%PEGxie pai chu li hou cheng xian zhe shang diao biao da 。

论文参考文献

  • [1].植物三螺旋Trihelix转录因子家族与环境相互作用的研究进展[J]. 于冰,陈孟迪,王宇光.  植物遗传资源学报.2019(05)
  • [2].植物Trihelix转录因子响应非生物胁迫的研究进展[J]. 卢惠君,李子义,贺子航,王玉成,及晓宇.  分子植物育种.2019(10)
  • [3].葡萄种植常见病虫害及防治措施[J]. 郑强.  特种经济动植物.2018(07)
  • [4].高温胁迫下根施褪黑素对葡萄叶片叶绿素荧光特性的影响[J]. 卞凤娥,孙永江,牛彦杰,杜远鹏,翟衡.  植物生理学报.2017(02)
  • [5].葡萄叶面积快速测定法[J]. 孙祎龙.  中国果树.1987(01)
  • [6].谈谈葡萄的栽培和管理 第四讲 十、十一月葡萄农事[J]. 葛根.  上海农业科技.1987(05)
  • [7].施用PP333对苹果、葡萄叶片组织结构和厚度的影响[J]. 乔宪生,曹尚银.  落叶果树.1988(03)
  • [8].早熟大粒葡萄——“84—010”[J]. 谷元昌.  新农业.1988(11)
  • [9].南方酸性土葡萄营养的研究[J]. 刘淑欣,熊德中,彭时尧,张金彪,吴少华.  中国果树.1988(04)
  • [10].我场葡萄叶片黄化的原因及转绿措施初探[J]. 陈星黎.  葡萄栽培与酿酒.1988(01)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自园艺学报的卢世雄,王萍,何红红,梁国平,马宗桓,乔亚丽,吴玉霞,陈佰鸿,毛娟,发表于刊物园艺学报2019年07期论文,是一篇关于葡萄论文,非生物胁迫论文,基因家族论文,生物信息学分析论文,基因表达芯片论文,园艺学报2019年07期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自园艺学报2019年07期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  

    卢世雄:葡萄Trihelix转录因子家族生物信息及其基因表达分析论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢