拟南芥胚胎发育相关基因AtFEM和鼠李糖合成酶基因AtRHM1的功能分析

拟南芥胚胎发育相关基因AtFEM和鼠李糖合成酶基因AtRHM1的功能分析

论文摘要

本论文第一部分工作是关于一个影响胚胎发育的AtFEM基因的研究。植物中精确控制基因的表达对于胚胎和胚乳的发育是非常关键的。目前已经发现,超过250个基因的突变可以导致胚胎发育异常(或致死),这些基因的正常表达对于胚胎的正常发育是必需的,对胚胎发育的影响不尽相同。已知的引起胚胎发育缺陷的基因编码执行不同功能的蛋白,包括代谢、细胞生长、转录、蛋白命运、蛋白转运和受阻以及植物防御。在拟南芥中, F-box蛋白有700个以上,通过参与SCF复合体介导底物蛋白降解。遗传分析表明,F-box蛋白在许多信号传导途径中发挥作用。关于F-box蛋白参与胚胎和胚乳发育已经有一些报道。F-box蛋白TIR1和AFB在胚胎形成过程中调节生长素的反应,tir1-1 afb2-1 afb3-1突变体的胚胎在早期发育异常。F-box蛋白AtSFL61和AtSFL70参与胚胎或雌配子体的发育,AtSFL61突变引起胚胎败育,突变体胚胎细胞不正常分裂;atsfl70/+杂合突变体胚珠种子败育率为50%,由雌配子体致死所引起。本论文中对一个F-BOX EMBRYO LETHAL (FEM)基因进行研究,预测该基因编码的蛋白是一个参与细胞周期的F-box蛋白,Atfem的T-DNA插入突变可以引起隐性胚胎致死表型。自交的杂合体植株产生几乎25%的不正常种子,这些种子最终萎缩败育。突变体的胚胎大部分停滞在晚球形期,其中有的败育胚胎停滞在球形向心形过渡期。在1-细胞期和2-细胞期时,野生型和突变体胚胎没有明显区别;野生型胚胎发育到球形期时,突变体胚胎主要处于8-16细胞期;野生型胚胎发育到心形期时,突变体胚胎主要处于早球形期;野生型胚胎继续发育为成熟胚胎,突变体胚胎大部分仍处于晚球形期,没有胚胎可以发育到心形期,突变体胚胎最终败育。突变体的胚胎除了发育迟缓,另一个明显的特征是细胞分裂异常,分裂板的位置发生变化,最终产生了形态各异的不规则的球形期胚。此外,突变体的胚乳核数目与野生型相比显著降低。FEM蛋白包含两个LRR结构和两个F-box结构域。GUS染色结果显示,FEM在幼苗、莲座叶、种荚、花序均有表达。在幼苗的子叶和新生真叶表达强烈,特别是在叶脉上表达明显,根上只有少量表达。直到胚胎发育到成熟期,FEM在胚乳和胚胎中一直有表达,在胚乳中表达强烈,在胚胎中相对较弱。以上结果表明,FEM基因对于胚胎和胚乳的发育是非常重要的。本论文第二部分工作是关于鼠李糖合成酶基因AtRHM1的功能分析。在植物进行正常的生命活动时,细胞壁是植物细胞不可缺少的重要部分。细胞壁不但在维持细胞形态与细胞之间黏结、决定细胞壁的强度和调控细胞伸长等方面起了必要的作用,而且还参与了细胞的分化、抗病、细胞识别与信号传导等一系列生理过程。细胞壁成分包含纤维素、半纤维素、果胶和少量的结构蛋白等。L-鼠李糖是拟南芥细胞壁果胶多聚糖的重要组分之一,在模式植物拟南芥中由三种鼠李糖合成酶AtRHM1,AtRHM2和AtRHM3催化合成。拟南芥中的RHM2基因的等位基因是MUM4(MUCILAGE-MODIFIED4)。RHM2基因突变导致拟南芥种皮粘液中鼠李糖和半乳糖醛酸含量的减少,进一步证实了RHM蛋白具有鼠李糖合成酶的功能。已经发现,RHM1参与拟南芥根毛的形成,但是AtRHM1蛋白的体内酶学活性和亚细胞定位仍然不清楚。本论文对AtRHM1的功能进行了进一步的阐述。AtRHM1与拟南芥中RHM家族的其它成员有很高的相似性,与其它植物例如水稻和葡萄也有高的相似性。AtRHM1启动子-GUS (Prhm1)融合表达结果表明AtRHM1几乎在各个组织器官表达,尤其在幼苗的根、子叶和植株花序表达强烈,GUS染色结果与RT-PCR结果一致。这与AtRHM3基因的表达模式相似,但AtRHM2基因的表达模式不同,AtRHM2/MUM4在繁殖器官中表达量较高,如种子等。对AtRHM1不同缺失启动子(Pd1,Pd2,Pd3,Pd4,Pd5)GUS转基因植株GUS染色结果表明:Prhm1和Pd1在整体上的GUS表达模式一致,即在整株幼苗都有表达,只是在染色程度上Pd1比Prhm1稍弱;而对于Pd2与Pd1染色情况比较来看,Pd2的子叶染色弱而根上几乎无染色,而Pd1的根上有很深的染色,表明RHM1启动子中的-752 bp~-308 bp这段序列可能与根特异表达相关;Pd3幼苗子叶上的染色较Pd2明显降低,2天时子叶无染色,4、7天的子叶只有顶尖处有稍许表达,表明-308 bp~-140 bp序列可能与子叶特异表达相关,而在RHM1基因启动子-752 bp~-308 bp含有两个G-box和一个与伤害有关的调控元件,在-308 bp~-140 bp区域中存在ACTT和ABRE元件。AtRHM1的表达受糖和伤害诱导,RHM1基因启动子中与伤害诱导相关的顺式作用元件可能位于-308 bp~140 bp,与葡萄糖应答相关顺式作用元件可能位于该基因启动子-931 bp~-752 bp区域。已有假设指出许多核糖转化酶定位在细胞质。Reiter和Pai指出烟草中一种UDP-D-apiose/UDP-D-xylose合成酶NbAXS1通常定位在细胞质。共聚焦显微镜观察表明GFP::AtRHM1融合蛋白定位在子叶细胞的细胞质,这说明AtRHM1是一种细胞质定位的蛋白。AtRHM1代表了RHM家族中第一个定位在细胞质的鼠李糖合成蛋白,这与许多其它参与细胞壁生物合成的核糖转化酶定位在细胞质相符。拟南芥中AtRHM1基因过表达导致叶片细胞壁的鼠李糖含量增加了40%,同时,甘露糖和葡萄糖的含量也发生了改变。而RNAi株系细胞壁中主要单糖包括鼠李糖的含量没有任何明显的改变。傅里叶变换红外光谱分析表明AtRHM1过表达株系中增加的鼠李糖参与了鼠李糖苷的合成。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一部分
  • 第一章 绪论
  • 1.1 胚胎发育过程
  • 1.1.1 顶细胞及胚体形成
  • 1.1.2 基细胞的发育
  • 1.1.3 植物细胞的命运决定
  • 1.2 植物胚胎发育过程中的基因表达
  • 1.2.1 合子激活的基因表达调控
  • 1.2.2 胚胎发育过程中的基因表达调控
  • 1.3 胚乳发育
  • 1.3.1 胚乳多核体的产生
  • 1.3.2 胚乳细胞化
  • 1.4 胚乳发育过程中的基因表达
  • 1.4.1 胚乳发育及胚乳游离核细胞化的分子机制
  • 1.4.2 胚乳和胚发育的相互作用
  • 1.5 植物泛素介导的蛋白降解和 F-BOX 基因的研究进展
  • 1.5.1 泛素和泛素化级联反应
  • 1.5.2 植物中F-box 蛋白的研究进展
  • 1.6 影响胚胎和胚乳发育的基因 ATFEM 的研究意义
  • 第二章 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 实验样品
  • 2.1.2 菌种
  • 2.1.3 载体
  • 2.1.4 工具酶和修饰酶
  • 2.1.5 分子量标准
  • 2.1.6 测序及引物合成
  • 2.1.7 试剂盒
  • 2.1.8 化学试剂
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 拟南芥的栽培
  • 2.2.2 简易法提取拟南芥基因组 DNA
  • 2.2.3 拟南芥RNA 提取
  • 2.2.4 AtNPC2 基因启动子与GUS 融合载体构建
  • 2.2.5 拟南芥转化(Floral Dipping 法)
  • 2.2.6 转基因植株的筛选和鉴定
  • 2.2.7 扩增T-DNA 侧翼序列
  • 2.2.8 AtFEM 基因启动子与GUS 融合载体构建
  • 2.2.9 AtFEM 基因互补载体的构建
  • 2.2.10 转化子的 GUS 组织化学染色
  • 2.2.11 拟南芥有性杂交和正反交
  • 2.2.12 DIC(相差微分干涉)观察拟南芥胚胎
  • 第三章 结果与分析
  • 3.1 突变体的获得
  • 3.2 T-DNA 插入位点边界序列扩增及基因型与表现型的连锁分析..
  • 3.2.1 T-DNA 插入位点边界序列扩增
  • 3.2.2 突变体基因型与表型的连锁分析
  • 3.3 ATFEM 突变体中雌配子和雄配子的发育正常
  • 3.4 ATFEM 蛋白结构和保守区
  • 3.5 突变体胚胎发育停滞在晚球形期
  • 3.6 突变体胚乳发育异常
  • 3.7 ATFEM 基因的表达模式
  • 第四章 讨论
  • 第五章 结论
  • 5.1 结论
  • 5.2 创新点
  • 第二部分
  • 第一章 绪论
  • 1.1 植物细胞壁研究
  • 1.1.1 植物细胞壁结构与成分
  • 1.1.2 细胞壁的功能
  • 1.2 鼠李糖的研究
  • 1.2.1 鼠李糖的物理性质
  • 1.2.2 鼠李糖的来源
  • 1.2.3 鼠李糖生产的研究现状
  • 1.2.4 鼠李糖的作用
  • 1.3 鼠李糖合成酶的研究
  • 1.4 糖信号感应和信号传导
  • 1.4.1 糖信号分子
  • 1.4.2 糖相关调控元件
  • 1.5 RHM1 基因的研究现状及意义
  • 第二章 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 实验样品
  • 2.1.2 菌种
  • 2.1.3 载体
  • 2.1.4 工具酶和修饰酶
  • 2.1.5 分子量标准
  • 2.1.6 测序及引物合成
  • 2.1.7 试剂盒
  • 2.1.8 化学试剂
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 拟南芥的栽培
  • 2.2.2 载体构建和植物转化
  • 2.2.3 转化子的GUS 染色
  • 2.2.4 转化子β-葡萄糖苷酸酶(GUS)的荧光定量分析
  • 2.2.5 GUS 荧光定量
  • 2.2.6 拟南芥胁迫处理
  • 2.2.7 荧光显微镜观察亚细胞定位
  • 2.2.8 细胞壁糖含量测定
  • 2.2.9 种子染色
  • 2.2.10 RNA 杂交分析
  • 2.2.11 RT-PCR
  • 2.2.12 FT-IR 光谱分析
  • 第三章 结果与分析
  • 3.1 植物中与ATRHM1 相似的蛋白序列的鉴定
  • 3.2 ATRHM1 基因表达模式
  • 3.2.1 RT-PCR 检测RHM1 基因不同组织器官表达模式
  • 3.2.2 发育不同时期RHM1 基因的表达模式
  • 3.2.3 组织化学染色
  • 3.3 启动子缺失分析
  • 3.4 ATRHM1 的表达受糖和伤害诱导
  • 3.5 ATRHM1 的细胞质定位
  • 3.6 ATRHM1 过表达改变了细胞壁鼠李糖和鼠李糖苷的含量
  • 3.6.1 过表达载体和RNAi 载体的构建
  • 3.6.2 过表达和RNAi 转基因植株表型的确定
  • 第四章 讨论
  • 第五章 结论
  • 5.1 结论
  • 5.2 创新点
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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