本文主要研究内容
作者林俊俊,郭怀刚,董洁静,杨克军,张海燕,李佐同,赵长江,徐晶宇（2019）在《高粱AGO蛋白家族基因鉴定及表达分析》一文中研究指出：Argonaute (AGO)蛋白是RNA介导的沉默复合物RISC的核心成分,在小RNA、Dicer-like酶等的协同下共同激发RNA沉默反应。为阐明高粱中AGO蛋白的功能,本研究采用生物信息学的方法首次在高粱全基因组水平鉴定15个SbAGOs,分别定位于高粱的7条染色体上,根据氨基酸序列将其划分为三个亚家族。亚家族Ⅲ中SbAGO7和SbAGO3都含有3个外显子,亚家族Ⅱ中SbAGO4和SbAGO6都具有22个外显子,成员最多的亚家族Ⅰ中基因外显子数量介于19～24之间。其中,亚家族Ⅰ中SbAGO1-1和SbAGO1-3、SbAGO1-3和SbAGO1-4、SbAGO5-2和SbAGO5-4发生过基因复制事件,可能存在功能冗余现象。NCBI表达谱数据库分析发现,SbAGO1-1、SbAGO1-2、SbAGO1-3和SbAGO4在高粱不同组织器官和生长发育阶段均有较高表达,其中SbAGO1-1和SbAGO1-2、SbAGO1-3和SbAGO4表达时期和表达量基本一致,可能在调控高粱生长发育方面发挥协同作用。高温、干旱及高温与干旱复合逆境表达谱芯片数据分析发现,高温处理引起5个SbAGOs基因差异表达,干旱处理SbAGOs表达变化不明显,复合逆境引起7个SbAGOs基因差异表达;2个处理共同差异表达基因为SbAGO1-3、SbAGO1-1、SbAGO5-2和SbAGO3,表达量变化趋势相近。其中SbAGO1-1、SbAGO1-2、SbAGO1-3和SbAGO5-6下调表达,SbAGO3、SbAGO5-2、SbAGO1-4和SbAGO10上调表达。本研究结果为揭示SbAGO蛋白功能和发掘高粱的抗逆育种靶向基因资源提供了一定的理论依据。
Abstract
Argonaute (AGO)dan bai shi RNAjie dao de chen mo fu ge wu RISCde he xin cheng fen ,zai xiao RNA、Dicer-likemei deng de xie tong xia gong tong ji fa RNAchen mo fan ying 。wei chan ming gao liang zhong AGOdan bai de gong neng ,ben yan jiu cai yong sheng wu xin xi xue de fang fa shou ci zai gao liang quan ji yin zu shui ping jian ding 15ge SbAGOs,fen bie ding wei yu gao liang de 7tiao ran se ti shang ,gen ju an ji suan xu lie jiang ji hua fen wei san ge ya jia zu 。ya jia zu Ⅲzhong SbAGO7he SbAGO3dou han you 3ge wai xian zi ,ya jia zu Ⅱzhong SbAGO4he SbAGO6dou ju you 22ge wai xian zi ,cheng yuan zui duo de ya jia zu Ⅰzhong ji yin wai xian zi shu liang jie yu 19～24zhi jian 。ji zhong ,ya jia zu Ⅰzhong SbAGO1-1he SbAGO1-3、SbAGO1-3he SbAGO1-4、SbAGO5-2he SbAGO5-4fa sheng guo ji yin fu zhi shi jian ,ke neng cun zai gong neng rong yu xian xiang 。NCBIbiao da pu shu ju ku fen xi fa xian ,SbAGO1-1、SbAGO1-2、SbAGO1-3he SbAGO4zai gao liang bu tong zu zhi qi guan he sheng chang fa yo jie duan jun you jiao gao biao da ,ji zhong SbAGO1-1he SbAGO1-2、SbAGO1-3he SbAGO4biao da shi ji he biao da liang ji ben yi zhi ,ke neng zai diao kong gao liang sheng chang fa yo fang mian fa hui xie tong zuo yong 。gao wen 、gan han ji gao wen yu gan han fu ge ni jing biao da pu xin pian shu ju fen xi fa xian ,gao wen chu li yin qi 5ge SbAGOsji yin cha yi biao da ,gan han chu li SbAGOsbiao da bian hua bu ming xian ,fu ge ni jing yin qi 7ge SbAGOsji yin cha yi biao da ;2ge chu li gong tong cha yi biao da ji yin wei SbAGO1-3、SbAGO1-1、SbAGO5-2he SbAGO3,biao da liang bian hua qu shi xiang jin 。ji zhong SbAGO1-1、SbAGO1-2、SbAGO1-3he SbAGO5-6xia diao biao da ,SbAGO3、SbAGO5-2、SbAGO1-4he SbAGO10shang diao biao da 。ben yan jiu jie guo wei jie shi SbAGOdan bai gong neng he fa jue gao liang de kang ni yo chong ba xiang ji yin zi yuan di gong le yi ding de li lun yi ju 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自核农学报的林俊俊,郭怀刚,董洁静,杨克军,张海燕,李佐同,赵长江,徐晶宇，发表于刊物核农学报2019年07期论文，是一篇关于高粱论文,表达分析物论文,生物信息学分析论文,核农学报2019年07期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自核农学报2019年07期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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