赵乐乐:雉鸡SSR分子标记开发论文

赵乐乐:雉鸡SSR分子标记开发论文

本文主要研究内容

作者赵乐乐,邢磊,袁红艳,陆雪林(2019)在《雉鸡SSR分子标记开发》一文中研究指出:目的进行雉鸡SSR分子标记的开发。方法在雉鸡分子标记未知的情况下,采用454测序平台结合SSR富集文库测序的高通量测序方法进行雉鸡SSR分子标记的开发,对测序数据进行分析与筛选。结果获得如下结果:①原始数据经质量过滤后的总reads数为289 008条,总碱基数为109 667 298个,含有SSR位点的序列数为48 168条;②单核苷酸重复SSR到六核苷酸重复SSR在雉鸡基因组中均有分布。其中单核苷酸重复SSR数目最多,达25 648个,占SSR位点总数的39.33%;双核苷酸和三核苷酸SSR数量亦较丰富,分别为19 618和9 299个,占SSR位点总数的30.08%和14.26%;而四核苷酸至六核苷酸重复SSR数目较少,三者的总和为10 651个,其中六核苷酸重复序列最少,仅为603个。结论通过雉鸡SSR分子标记数据库的构建,为雉鸡种质资源遗传多样性分析、分子标记辅助育种、遗传图谱构建和功能基因的挖掘等提供了有利工具。

Abstract

mu de jin hang zhi ji SSRfen zi biao ji de kai fa 。fang fa zai zhi ji fen zi biao ji wei zhi de qing kuang xia ,cai yong 454ce xu ping tai jie ge SSRfu ji wen ku ce xu de gao tong liang ce xu fang fa jin hang zhi ji SSRfen zi biao ji de kai fa ,dui ce xu shu ju jin hang fen xi yu shai shua 。jie guo huo de ru xia jie guo :①yuan shi shu ju jing zhi liang guo lv hou de zong readsshu wei 289 008tiao ,zong jian ji shu wei 109 667 298ge ,han you SSRwei dian de xu lie shu wei 48 168tiao ;②chan he gan suan chong fu SSRdao liu he gan suan chong fu SSRzai zhi ji ji yin zu zhong jun you fen bu 。ji zhong chan he gan suan chong fu SSRshu mu zui duo ,da 25 648ge ,zhan SSRwei dian zong shu de 39.33%;shuang he gan suan he san he gan suan SSRshu liang yi jiao feng fu ,fen bie wei 19 618he 9 299ge ,zhan SSRwei dian zong shu de 30.08%he 14.26%;er si he gan suan zhi liu he gan suan chong fu SSRshu mu jiao shao ,san zhe de zong he wei 10 651ge ,ji zhong liu he gan suan chong fu xu lie zui shao ,jin wei 603ge 。jie lun tong guo zhi ji SSRfen zi biao ji shu ju ku de gou jian ,wei zhi ji chong zhi zi yuan wei chuan duo yang xing fen xi 、fen zi biao ji fu zhu yo chong 、wei chuan tu pu gou jian he gong neng ji yin de wa jue deng di gong le you li gong ju 。

论文参考文献

  • [1].分子标记及其在标记辅助选择中的应用[J]. 陈旭,张元跃.  畜牧与饲料科学(奶牛版).2006(04)
  • [2].分子标记在猪育种中的应用[J]. 林亚秋,李瑞文,杨公社.  家畜生态.2003(01)
  • [3].分子标记在家禽研究中的应用进展[J]. 束婧婷,高玉时,陈宽维.  中国家禽.2009(10)
  • [4].分子标记AFLP及其在遗传分析中应用[J]. 朱文进,曹瑞琴,张纪刚,王曦,杜美红,郭传甲.  动物科学与动物医学.2001(05)
  • [5].分子标记在动物育种中的应用[J]. 刘双虎,胡海燕.  养殖技术顾问.2013(09)
  • [6].分子标记在猪遗传育种上的应用[J]. 肖书奇,李爽,张嘉保,任文陟,刘保国,赵中利,张树敏.  吉林畜牧兽医.2006(10)
  • [7].分子标记回归模型与显性分子标记资料[J]. 李学斌.  动物科学与动物医学.2002(06)
  • [8].分子标记在牛育种中的应用[J]. 卫银霞,段志强.  畜牧与饲料科学.2007(06)
  • [9].基于RNA-seq数据的窄足真蚋SSR分子标记开发[J]. 郭欢,王刚,张树田,黄敏.  昆虫学报.2018(07)
  • [10].分子标记常用技术及其在绵羊育种中的应用[J]. 买买提伊明·巴拉提,柳广斌.  中国畜牧兽医.2008(04)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自畜禽业的赵乐乐,邢磊,袁红艳,陆雪林,发表于刊物畜禽业2019年10期论文,是一篇关于雉鸡论文,分子标记论文,富集文库论文,高通量测序论文,畜禽业2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自畜禽业2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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