水稻包穗基因ESP2的功能分析

水稻包穗基因ESP2的功能分析

论文摘要

目前使用的水稻籼型不育系普遍存在不同程度的包穗现象。本实验室从籼稻品种明恢86的后代中获得一种全包穗突变体esp2。本课题组前期研究表明,ESP2影响水稻倒一节间和穗的发育;基因定位和互补实验的结果显示,ESP2是一个磷脂酰丝氨酸合成酶(PSS)基因。在此基础上,本课题进一步分析了esp2的其它农艺性状、ESP2基因的结构特征、突变体中该基因的表达与功能,以及ESP2蛋白的亚细胞定位。主要结果如下:(1)除调节水稻倒一节节间和穗的发育外,ESP2基因还对水稻倒1—倒3叶的发育产生不同程度的影响,但该基因对水稻生育期、叶色、分蘖数等其它重要农艺性状没有明显影响。(2)利用生物信息学软件分析表明,ESP2蛋白含有PSS功能域,主要催化磷脂类物质和亲核供体发生转酯反应合成PS。该酶蛋白的保守序列位于起始密码子后的280个氨基酸,包括1个磷酸结合位点、8个催化活性位点和6个稳定性调控位点,这与哺乳动物仓鼠的PSS1完全一致。由此推测,ESP2属于一种磷脂酰丝氨酸合成酶(PSS)。目前植物中主要有BE-PSS和CD-PSS两种PSS,但ESP2属于哪一种PSS,有待于进一步的研究分析。(3)生物信息学分析显示,ESP2蛋白主要定位于细胞膜。将亚细胞定位载体pCX-DG-ESP2通过农杆菌侵染法转化洋葱表皮细胞,结果显示ESP2-GFP融合蛋白定位在细胞膜上,这与预测的结果一致。由此推断,ESP2应该是一个膜蛋白。(4)对esp2的转录产物进行序列分析,发现其在第四个外显子末端插入了5287 bp后,引起ESP2基因的第三和第四内含子保留在其ORF中,因而导致移码突变而在该基因的第97个密码子处提前终止。由此推测,esp2中该基因功能完全丧失,应该是一个零等位突变体。(5)对几个水稻品种(籼稻和粳稻)的ESP2基因序列分析表明,不同水稻品种间ESP2基因的DNA序列相同,但它们的ORF长度不同。这些测试品种的ORF中起始密码子后的495 bp的序列完全一致,但由于它们的第六内含子的剪接位点不同而导致其ORF长度差异。结合ESP2的生物信学分析结果和这些测试水稻品种的正常表型,推测在水稻进化过程中,尽管不同品种中ESP2的ORF发生了改变,但决定ESP2蛋白功能的关键结构域(165个氨基酸)十分保守。

论文目录

  • 缩写词
  • 摘要
  • Abstract
  • 引言
  • 文献综述
  • 1 水稻包穗现象的研究现状
  • 1.1 水稻的包穗现象
  • 1.2 水稻株高相关基因的研究进展
  • 1.2.1 水稻矮秆相关基因的研究
  • 1.2.2 水稻高秆相关基因的研究
  • 1.3 植物激素与水稻茎节生长的关系
  • 1.3.1 赤霉素与水稻茎节伸长的关系
  • 1.3.2 生长素与水稻茎节伸长的关系
  • 1.3.3 其他激素与水稻茎节伸长的关系
  • 2 水稻包穗基因ESP2的研究进展
  • 2.1 磷脂酰丝氨酸(PS)的研究现状
  • 2.1.1 磷脂酰丝氨酸的生物特性及功能
  • 2.1.2 磷脂酰丝氨酸的合成及降解途径
  • 2.2 磷脂酰丝氨酸合成酶(PSS)的研究现状
  • 材料与方法
  • 1 实验材料
  • 1.1 植物材料
  • 1.2 质粒载体和菌株
  • 1.3 实验所用到的药品和仪器
  • 2 实验方法
  • 2.1 田间农艺性状调查
  • 2.2 生物信息学分析工具
  • 2.3 ESP2蛋白的亚细胞定位
  • 2.3.1 构建亚细胞定位的载体
  • 2.3.2 农杆菌侵染洋葱内表皮细胞
  • 2.3.2.1 制备pCX-DG-ESP2农杆菌侵染菌液
  • 2.3.2.2 洋葱内表皮的预培养
  • 2.3.2.3 农杆菌侵染洋葱内表皮细胞
  • 2.4 DNA、RNA的提取以及反转录
  • 结果与分析
  • 1 esp2突变体的形态特征
  • 2 ESP2的生物信息学分析
  • 2.1 ESP2蛋白保守结构域
  • 2.2 PSS同源序列比对
  • 3 ESP2蛋白的亚细胞定位
  • 3.1 ESP2蛋白亚细胞定位预测结果
  • 3.2 亚细胞定位载体构建
  • 3.3 ESP2蛋白的亚细胞定位
  • 4 突变体esp2的ORF序列分析
  • 5 不同水稻品种ESP2基因的分析
  • 讨论
  • 1 ESP2基因的生物学功能
  • 2 ESP2功能域
  • 3 ESP2可能编码一个BE-PSS
  • 4 下一步的工作
  • 参考文献
  • 附录1 分子生物学相关实验方法
  • 附录2 本实验所用基本培养基配方
  • 附录3 本实验所用的其他实验方法
  • 致谢
  • 相关论文文献

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