微悬臂梁-DNA芯片的弯电效应

微悬臂梁-DNA芯片的弯电效应

论文摘要

本文利用液晶生物膜弯电理论、层合梁Zhang两变量方法以及尺度法和连续介质静电理论等,建立了无标记生物检测中DNA芯片纳米力学分析的简化单层硅膜弯电模型和四层层合梁力电液晶模型,确立了DNA片段长度、封装密度和溶液盐浓度等因素与DNA生物膜电势和芯片挠度之间的关系,并对DNA生物膜电势进行了实验检测。对于单链DNA(ssDNA)芯片,从生物电角度出发,基于聚电解质溶液的非线性Poisson-Boltzmann(NLPB)方程和Liu的简化单层硅膜弯电理论,利用Fogolari修正公式,给出了ssDNA几何特征、盐溶液浓度等因素与生物膜电势、芯片挠度之间的近似解析关系。根据Wu的ssDNA芯片实验数据,对生物膜高度和弯电系数等模型参数进行了拟合,考察了ssDNA链片段长度和封装密度等因素对芯片挠度的影响。对于双链DNA(dsDNA)芯片,在本文ssDNA芯片非线性弯电模型的基础上,考虑杂交对dsDNA分子单体浓度、电荷密度和生物膜平衡高度的影响,利用Fogolari修正公式,给出了dsDNA几何特征、盐溶液浓度、DNA分子杂交率等因素与生物膜电势、芯片挠度之间的近似解析关系。根据Wu的dsDNA芯片实验数据,对生物膜高度和弯电系数等模型参数进行了拟合,考察了DNA链片段长度和封装密度等因素对杂交前后生物膜高度、电势、电荷密度和芯片挠度的影响。对于DNA生物膜电势,利用巯基自组装技术和数字电位差综合测试仪对杂交前ssDNA生物膜与杂交后dsDNA生物膜电势差进行实测,考察了DNA片段长度、盐溶液浓度、pH值与DNA生物膜电势之间的关系,并比较了生物膜电势实测值与采用Fogolari修正法和Chen迭代法的理论预测值之间的差别。对于ssDNA芯片,考虑到芯片变形和结构特征,在本文ssDNA芯片简化单层硅膜弯电模型的基础上,借鉴Gao关于生物薄膜的自由能分析,建立了ssDNA芯片纳米力学分析的四层层合梁力电液晶模型,利用泰勒展开法,给出了ssDNA几何特征、盐溶液浓度、非生物层宏观机械性能等因素与生物膜电势、芯片挠度之间的近似解析关系。根据Mckendry的ssDNA芯片实验数据,对生物膜高度和弯电系数进行了拟合,并考察了ssDNA链片段长度和封装密度等因素对生物膜电势和芯片挠度的影响。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 目录
  • 第一章 绪论
  • 1.1 课题来源
  • 1.2 课题研究的目的和意义
  • 1.2.1. DNA 芯片技术
  • 1.2.2 微悬臂梁传感技术
  • 1.3 国内外研究概况
  • 1.3.1. DNA 芯片研究概况
  • 1.3.1.1 实验研究
  • 1.3.1.2 理论研究
  • 1.3.2 DNA 电学性能研究概况
  • 1.3.3 课题研究的困难分析和设想
  • 1.4 论文的主要研究内容
  • 第二章 单链DNA 芯片纳米力学分析的非线性弯电模型
  • 2.1 引言
  • 2.2 非线性模型及其线性化
  • 2.3 非线性模型的近似解析解
  • 2.4 算例分析
  • 2.4.1 参数拟合
  • 2.4.2 线性和非线性预测的比较
  • 2.4.3 封装密度对ssDNA 芯片纳米力学行为的影响
  • 2.5 小结
  • 第三章 双链DNA 芯片纳米力学分析的非线性弯电模型
  • 3.1 引言
  • 3.2 数学模型及解析求解
  • 3.3 算例分析
  • 3.3.1 参数拟合
  • 3.3.2 线性与非线性预测的比较
  • 3.3.3 ssDNA 芯片与dsDNA 芯片纳米力学行为的比较
  • 3.3.4 优化设计
  • 3.4 小结
  • 第四章 DNA 生物膜电势的实验研究
  • 4.1 引言
  • 4.2 实验材料与方法
  • 4.2.1 试剂和仪器
  • 4.2.2 实验步骤
  • 4.3 ssDNA 生物膜电势检测结果与讨论
  • 4.3.1 片段长度对ssDNA 生物膜电势的影响
  • 4.3.2 盐浓度对ssDNA 生物膜电势的影响
  • 4.3.3 pH 值对ssDNA 生物膜电势的影响
  • 4.4 dsDNA 生物膜电势检测结果与讨论
  • 4.4.1 片段长度对dsDNA 生物膜电势的影响
  • 4.4.2 盐浓度对dsDNA 生物膜电势的影响
  • 4.4.3 pH 值对dsDNA 生物膜电势的影响
  • 4.5 小结
  • 第五章 单链 DNA 芯片纳米力学分析的力电液晶模型
  • 5.1 引言
  • 5.2 数学模型
  • 5.2.1 ssDNA 芯片的力电液晶模型
  • 5.2.2 近似解析求解
  • 5.3 算例分析
  • 5.3.1 参数拟合
  • 5.3.2 参数影响
  • 5.4 小结
  • 第六章 结论与展望
  • 6.1 结论
  • 6.2 展望
  • 附录 Chen迭代法原理
  • 参考文献
  • 作者在攻读硕士学位期间公开发表的论文
  • 作者在攻读硕士学位期间所作的项目
  • 致谢
  • 相关论文文献

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