2005~2006年武汉地区A组轮状病毒G和P基因型别的特征

2005~2006年武汉地区A组轮状病毒G和P基因型别的特征

论文摘要

轮状病毒(Rotavirus,RV)属于呼肠孤病毒科(Reoviridae)轮状病毒属,是引起婴幼儿急性胃肠炎最常见的病毒病原,每年全世界因RV感染从而导致约1.25亿婴幼儿腹泻和90万婴幼儿死亡,其中大多数发生在发展中国家。RV引起的腹泻至今尚无特效药物进行治疗,只能对症进行补液纠治,所以预防就显得特别重要。而疫苗预防又是最有效的方法,因此发展RV疫苗成为当今世界卫生组织疫苗发展计划的首要任务之一。RV的外壳结构蛋白VP4、VP7具有中和抗原活性,能刺激机体产生中和抗体,根据VP7、VP4蛋白的差异,RV可分为不同的G、P基因型。RV的基因型会随着区域的不同而不同,即使同一区域的RV,其基因型会随着时间的不同而不同。因此,为了研制合适的RV疫苗,必须开展对当地RV基因型的监测。本研究即对武汉地区2005~2006年的A组轮状病毒的G、P基因型进行分析,以期为轮状病毒的防治及研制适合武汉地区的疫苗提供实验依据。具体研究内容如下:第一节综述了轮状病毒的蛋白质功能,流行病学研究,临床表现,主要血清型及变化,发病机理,治疗和预防,实验室诊断以及RV疫苗研究的现状和展望。第二节利用PAGE检测了武汉地区收集的腹泻儿童粪便标本,初步分析了武汉地区腹泻儿童中RV的区域,时间和人群分布;发现男女宿主间的发病率无显著性差别,在不同年龄组的宿主中RV的阳性率存在明显差异,6月~1岁年龄组的阳性率最高。第三节利用多重RT-PCR对武汉地区2005~2006年A组轮状病毒G基因型构成进行研究,发现武汉地区A组轮状病毒性腹泻是以G3(66.2%)型为主,其次是G1(20.5%)型,G1/G3混合型占8%。第四节利用多重巢式RT-PCR对武汉地区2005~2006年A组轮状病毒P基因型构成进行研究,结果显示武汉市A组轮状病毒由P[4]、P[8]基因型构成,以P[8]基因型为主,占94.35%,而P[4]仅占1.32%,未能P基因分型的占1.51%。第五节分析武汉地区A组轮状病毒G、P基因型组合,武汉地区2005~2006年A组轮状病毒G型和P型的组合是以G3P[8]、G1P[8]为主。与2002~2003年相比,G3P[8]型比率下降,从原来的80.79%降到66.2%;G1P[8]型比率上升,从1.32%升到20.5%。第六节对部分未能G基因分型的GARV样品,通过RT-PCR扩增其vp7基因,对其序列进行分析,首次在武汉发现G9型GARV。第七节对部分未能P基因分型的GARV样品,通过RT-PCR扩增其vp4基因片段,对其序列进行分析,发现与其它A组轮状病毒P基因型有一定距离。G3P[8]型比率下,G1P[8]型比率上升,提示我们,武汉地区的RV基因组成结构有一定的改变;检测到的G9型RV提示我们,武汉已经开始有G9型的RV;而与其它A组轮状病毒P基因型有一定距离的病毒株说明此病毒株的基因变异;这些结果提示我们,A组轮状病毒VP7、VP4基因在自然状态下已经发生变异,随着变异的加大,人群原来建立的抗体保护屏障对A组轮状病毒的抵御作用将削弱,存在A组轮状病毒在人群中爆发流行的可能,我们要加大监测的力度,为轮状病毒的防治及研制适合武汉地区的疫苗提供实验依据。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 一.A组轮状病毒(Group A Rotavirus,GARV)研究进展
  • 1.轮状病毒的概述
  • 2.轮状病毒蛋白的功能
  • 2.1 病毒核蛋白的功能
  • 2.2 病毒结构蛋白的功能
  • 2.3 轮状病毒非结构蛋白的功能
  • 3.轮状病毒流行病学的研究
  • 3.1 传染源
  • 3.2 传播途径
  • 3.3 易感人群
  • 3.4 流行特征
  • 4.临床表现症状
  • 5.GARV主要流行血清型及变化趋势的研究
  • 5.1 主要血清型的分布可随时间和区域不同而有所不同
  • 5.2 罕见型别的比例在不断增加或成为优势流行株
  • 5.3 出现种系内或种系间的基因重配导致基因型的多样性
  • 6.发病机理
  • 7.治疗与预防
  • 7.1 治疗
  • 7.2 预防
  • 8.实验室诊断
  • 9.轮状病毒疫苗的研制现状及展望
  • 9.1 单价疫苗的研制
  • 9.2 多价疫苗的研制
  • 9.3 基因工程疫苗的研制
  • 二.武汉地区A组轮状病毒的检测及区域人群分布
  • 1.材料与方法
  • 1.1 腹泻病人粪便样本
  • 1.2 样品的处理
  • 1.3 粪便样本中轮状病毒的检测
  • 1.4 数据的分析
  • 2.结果
  • 2.1 轮状病毒PAGE电泳
  • 2.2 武汉地区轮状病毒阳性率
  • 2.3 武汉地区轮状病毒感染腹泻人群地区分布
  • 2.4 武汉地区轮状病毒宿主人群年龄分布
  • 2.5 武汉地区轮状病毒感染人群性别分布
  • 3.讨论
  • 三.武汉市A组轮状病毒G基因型构成研究
  • 1.材料与方法
  • 1.1 纯化腹泻病人粪便A组轮状病毒阳性样本RNA
  • 1.2 A组轮状病毒多重RT-PCR分型引物
  • 1.3 一步多重RT-PCR扩增GARV G基因型测定
  • 1.4 PCR产物的检测
  • 2.结果
  • 3.讨论
  • 四.武汉市A组轮状病毒P基因型构成
  • 1.材料与方法
  • 1.1 纯化腹泻病人粪便样本A轮状病毒阳性RNA
  • 1.2 A组轮状病毒多重巢式RT-PCR分型引物
  • 1.3 第一轮RT-PCR扩增
  • 1.4 第二轮PCR扩增
  • 1.5 PCR产物的检测
  • 2.结果
  • 3.讨论
  • 五.武汉市A组轮状病毒G、P基因型组合
  • 1.武汉市A组轮状病毒G、P基因型组合
  • 2.讨论
  • 六.未能G基因分型GARV vp7基因序列分析
  • 1.材料与办法
  • 1.1 未能G基因分型的A轮状病毒阳性腹泻病人粪便样本
  • 1.2 A组轮状病毒vp7基因RT-PCR引物
  • 1.3 A组轮状病毒vp7基因RT-PCR扩增
  • 1.4 PCR产物的检测
  • 1.5 PCR产物的回收纯化
  • 1.6 A组轮状病毒vp7基因序列分析
  • 2.结果
  • 2.1 A组轮状病毒VP7基因RT-PCR扩增
  • 2.2 A轮状病毒vp7基因序列
  • 3.讨论
  • 七.未能P基因分型GARV vp4基因片段序列分析
  • 1.材料与方法
  • 1.1 未能P基因分型的A轮状病毒阳性腹泻病人粪便样本
  • 1.2 A组轮状病毒vp4基因RT-PCR引物
  • 1.3 A组轮状病毒vp4基因RT-PCR扩增
  • 1.4 PCR产物的检测
  • 1.5 PCR产物的回收纯化
  • 1.6 A组轮状病毒vp4基因序列分析
  • 2.结果
  • 2.1 A组轮状病毒vp4基因RT-PCR扩增
  • 2.2 A轮状病毒vp4基因序列
  • 3.讨论
  • 参考文献
  • 在校期间发表的论文及科研成果
  • 致谢
  • 相关论文文献

    标签:;  

    2005~2006年武汉地区A组轮状病毒G和P基因型别的特征
    下载Doc文档

    猜你喜欢