赵宇航:桐花树叶片的转录组分析论文

赵宇航:桐花树叶片的转录组分析论文

本文主要研究内容

作者赵宇航,张守信,冉闽媛,郭昱昕,周勇芝,杨小波,龙文兴,周韬(2019)在《桐花树叶片的转录组分析》一文中研究指出:为了进一步了解桐花树耐盐的分子机制,本研究采用Illumina HiSeq 2000高通量测序平台对桐花树叶片转录组进行测序,经de novo组装后获得73 721个Unigenes,进一步利用7个公共数据库(NR, NT,GO, COG, KEGG, SwissProt和InterPro)进行比对,注释了50 338个Unigenes。结果表明,有34 991个Unigenes参与到136条KEGG通路上,其中在花青素和类黄酮合成途径中的Unigenes分别有49个和176个,这些基因可能参与了桐花树应对逆境的调控过程;此外,从转录组序列中搜索到34 509个SSR位点,其中二碱基重复出现次数最多,出现频率为65.75%;从转录组的数据中预测到了2 255个转录因子,分属于58个家族。本研究结果为桐花树的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供一定的理论参考。

Abstract

wei le jin yi bu le jie tong hua shu nai yan de fen zi ji zhi ,ben yan jiu cai yong Illumina HiSeq 2000gao tong liang ce xu ping tai dui tong hua shu xie pian zhuai lu zu jin hang ce xu ,jing de novozu zhuang hou huo de 73 721ge Unigenes,jin yi bu li yong 7ge gong gong shu ju ku (NR, NT,GO, COG, KEGG, SwissProthe InterPro)jin hang bi dui ,zhu shi le 50 338ge Unigenes。jie guo biao ming ,you 34 991ge Unigenescan yu dao 136tiao KEGGtong lu shang ,ji zhong zai hua qing su he lei huang tong ge cheng tu jing zhong de Unigenesfen bie you 49ge he 176ge ,zhe xie ji yin ke neng can yu le tong hua shu ying dui ni jing de diao kong guo cheng ;ci wai ,cong zhuai lu zu xu lie zhong sou suo dao 34 509ge SSRwei dian ,ji zhong er jian ji chong fu chu xian ci shu zui duo ,chu xian pin lv wei 65.75%;cong zhuai lu zu de shu ju zhong yu ce dao le 2 255ge zhuai lu yin zi ,fen shu yu 58ge jia zu 。ben yan jiu jie guo wei tong hua shu de ji yin gong neng fen xi 、fen zi biao ji kai fa he wei chuan duo yang xing yan jiu di gong yi ding de li lun can kao 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自分子植物育种的赵宇航,张守信,冉闽媛,郭昱昕,周勇芝,杨小波,龙文兴,周韬,发表于刊物分子植物育种2019年07期论文,是一篇关于桐花树论文,高通量测序论文,转录组论文,分子植物育种2019年07期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自分子植物育种2019年07期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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