鸡肌肉硫胺素相关候选基因遗传多样性及其与硫胺素含量相关性研究

鸡肌肉硫胺素相关候选基因遗传多样性及其与硫胺素含量相关性研究

论文摘要

硫胺素是影响肉品风味的重要物质基础之一,硫胺素在体内的合成和代谢过程十分复杂。本研究以文昌鸡、如皋鸡为材料探讨肌肉硫胺素含量的变化规律及同品种不同家系间硫胺素含量的差异;同时以鸡的硫胺焦磷酸激酶(TPK1)基因为候选基因,在如皋鸡、泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡等4个地方鸡种以及l个外来鸡种-隐性白羽鸡群体中对鸡的硫胺焦磷酸激酶(TPK1)基因进行单核苷酸多态性( SNP )扫描,并分析其与地方鸡种肌肉硫胺素含量之间的关系,主要结果如下:1.在相同的饲养管理条件下,4~12周龄的文昌鸡肌肉中硫胺素含量随周龄增加而逐渐减少。同品种不同家系12周龄的如皋鸡肌肉硫胺素含量差异显著(P < 0.05),母鸡的胸肌硫胺素含量稍高于公鸡,但两者之间的差异不显著。体重与胸肌硫胺素含量显著负相关(P < 0.05,r = -0.200 ),进一步证实了鸡肌肉硫胺素含量受遗传因素的影响显著,这为进一步从分子水平探讨我国地方鸡种特异香味机理的研究奠定了基础,对于从育种角度开发利用地方鸡种资源也具有重要意义。2.首次以鸡硫胺素合成代谢过程中的硫胺焦磷酸激酶( TPK1 )基因为候选基因,采用PCR-SSCP结合序列测定的方法,对如皋鸡、泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡和隐性白羽鸡群体中对该基因的所有外显子与3′-调控区域进行SNP扫描,共发现2个SSCP多态位点,分别为3′-调控区和外显子7。3′-调控区多态位点,纯合子AA型与BB型相比有一个C2132T的单碱基突变,CC型与BB型相比有一个C2132A的单碱基突变,如皋鸡在此位点并未检测到AC和CC基因型;外显子7中多个个体测序发现一个A809G。2个SNP分别命名为TPK1A和TPK1B,TPK1B只在如皋鸡中检测到。统计分析发现,这2个多态位点的基因型分布在鸡不同品种间差异显著,在同一品种不同家系间基因型分布也具有显著差异。进一步方差分析结果表明,只有TPK1A位点与胸肌硫胺素含量之间存在关联;其AA型(突变型)个体的硫胺素含量极显著高于BB型和AB型个体(P < 0.01),研究初步认为该位点可以作为肌肉硫胺素含量的辅助选择标记。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 研究素材介绍
  • 2 风味物质
  • 3. 硫胺素作为风味物质研究进展
  • 3.1 硫胺素的风味特性
  • 3.2 影响肌肉硫胺素含量的因素
  • 3.3 硫胺素的合成代谢
  • 3.4 硫胺素合成代谢酶系基因的研究概况
  • 4. 侯选基因法在畜禽遗传育种中的应用
  • 4.1 候选基因与表型性状间的连锁分析
  • 4.2 连锁关系的验证
  • 4.3 候选基因法用于鸡肉品质性状的研究
  • 5. 利用分子标记评估群体遗传结构及遗传分化
  • 5.1 线粒体DNA
  • 5.2 基因组DNA
  • 6. 研究目的和意义
  • 第二章 肌肉硫胺素含量变化规律及不同家系硫胺素含量的比较分析
  • 1 引言
  • 2. 材料和方法
  • 2.1 研究动物
  • 2.2 研究方法
  • 2.3 统计分析
  • 3. 结果与分析
  • 3.1 硫胺素含量的变化规律
  • 3.2 12 周龄肌肉硫胺素的含量
  • 3.3 肌肉硫胺素的含量与体重的相关性
  • 4 讨论
  • 4.1 硫胺素测定方法的比较
  • 4.2 肌肉硫胺素含量的变化规律
  • 4.3 如皋鸡不同家系鸡种硫胺素含量的比较
  • 4.4 如皋鸡不同家系性别间肌肉硫胺素含量的比较
  • 4.5 胸肌硫胺素含量与体重相关性分析
  • 第三章 鸡TPK1 基因的单核苷酸多态性及其与肌肉硫胺素含量的关联分析
  • 1. 引言
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 研究对象
  • 2.2 研究仪器
  • 2.3 研究试剂
  • 2.4 溶液的配制
  • 2.5 实验步骤
  • 3 相关软件及统计方法
  • 3.1 相关软件
  • 3.2 统计方法
  • 4 结果与分析
  • 4.1 5 个鸡种间TPK1 基因SNP 筛查结果
  • 4.2 如皋鸡12 个家系内的SNP 筛查
  • 4.3 TPK1 基因与12 周龄肌肉硫胺素含量的相关分析
  • 5. 讨论
  • 5.1 影响PCR 扩增的因素
  • 5.2 影响PCR-SSCP 分析的因素
  • 5.3 遗传检测的抽样方法
  • 5.4 TPK1 基因3′-调控区的突变(TPK1A 位点)
  • 5.5 TPK1 基因外显子7 的A809G 突变(TPK18 位点)
  • 全文结论
  • 参考文献
  • 缩略词表
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表学术论文目录
  • 相关论文文献

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