猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株检测、分离及病毒特性的研究

猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株检测、分离及病毒特性的研究

论文摘要

猪繁殖与呼吸综合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRS Virus,PRRSV)引起猪的一种新型传染病。该病自1987年首次在美国发现以来,迅速遍及世界各地。自2006年5月来,我国大部分养猪地区相继发生了“猪高热病”疫情,经证实PRRSV变异株是其重要的病原之一,给养猪业造成了巨大的损失。根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)变异株Nsp2基因的缺失信息,设计了3条特异性引物,以含PRRSV变异株Nsp2基因的质粒pMDNSP2及普通PRRSVVR2332株RNA为模板,建立了快速检测PRRSV变异株RT-PCR方法。通过敏感性实验、特异性实验以及临床应用实验表明该方法能够准确地鉴别PRRSV变异株和普通PRRSV,且具有快速、敏感和特异的特点,具有临床实用性。将36份经RT-PCR检测为PRRSV变异株阳性的临床样品接种Marc-145细胞,分离到5株PRRSV变异株ZZ-7、YY-8、CS06、CD06、XT07株。ZZ-7株在Marc-145细胞中的繁殖滴度较高,TCID50为10-4.63/0.1mL。对5株分离毒Nsp2、Gp5基因序列分析表明,Nsp2基因缺失情况与国内其它PRRSV变异株一致;5株分离毒Gp5基因有不同程度的变异,基因序列同源性为98.7%-99.7%,推导的氨基酸序列同源性为98.5%-100%。并且5株分离株位于遗传进化树同一分支上,推测它们可能源于同一个毒株。根据马动脉炎病毒(EAV)缺损性干扰(DI)RNA的特性,在PRRSV Nsp1和Nsp11基因处设计引物,在不同的PRRSV中扩增到380-1100bp的基因片段,通过对PCR产物克隆测序表明,PCR产物为PRRSV基因组片段,因此推测为PRRSV DI RNA基因片段且不同的病毒其DI RNA的组成存在差别。不同的病毒DI RNA缺失区主要在Nsp1 3′端/Nsp2 5′端至Nsp10 5′端,缺失了包括了Nsp2和Nsp10部分基因以及Nsp3-Nsp9全部基因。进一步通过制备针对PRRSV Nsp1的RNA探针对PRRSV RNA Northern杂交,结果发现在PRRSV基因组下方出现了大约6400-7000bp大小的DI RNA基因组,推测DI RNA包括5′非编码区(UTR)-Nsp1 5′端/Nsp2 5′端和Nsp10 3′端-3′未端。因此证实了在PRRSV中存在DI RNA,为PRRSV的繁殖、毒力、进化等的进一步研究打下基础。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 1 猪繁殖与呼吸综合征的研究进展
  • 2 猪繁殖与呼吸综合征病毒的基因组及结构蛋白的研究进展
  • 参考文献
  • 第一章 猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株RT—PCR快速鉴别检测方法的建立与临床应用
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 特异性试验
  • 2.2 敏感性试验
  • 2.3 样品检测的应用
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 参考文献
  • 第二章 猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株的分离鉴定及特性研究
  • 1 材料和方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 疾病的流行情况及其症状和病变
  • 2.2 病毒的分离与RT-PCR鉴定
  • 2.3 间接免疫荧光(IFA)鉴定
  • 2.4 PRRSV分离毒基因组序列分析
  • 50的测定'>2.5 PRRSV分离毒TCID50的测定
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 参考文献
  • 第三章 猪繁殖与呼吸综合征病毒中缺损性干扰RNA的鉴定
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 RT-nest PCR
  • 2.2 DI cDNA的克隆测序及序列分析
  • 2.3 Northern blotting
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 参考文献
  • 附录A
  • 附录B
  • 符号说明
  • 致谢
  • 个人简历
  • 相关论文文献

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